深沢嘉紀

フカサワヨシノリ | Fukasawa Yoshinori

所属機関・部署：
職名：准教授

研究分野 (2件)：システムゲノム科学 , 生命、健康、医療情報学

研究キーワード (4件)：タンパク質立体構造解析 , オーミクス解析 , ゲノム科学 , バイオインフォマティクス

競争的資金等の研究課題 (2件)：

論文 (19件)：

Géraldine C. Genard, Luca Tirinato, Francesca Pagliari, Jessica Da Silva, Alessandro Giammona, Fatema Alquraish, Maria Parra Reyes, Marie Bordas, Maria Grazia Marafioti, Simone Di Franco, et al. Lipid droplets and small extracellular vesicles: More than two independent entities. Journal of Extracellular Biology. 2024. 3. 9
Yoshinori Fukasawa, Patrick Driguez, Salim Bougouffa, Karen Carty, Alexander Putra, Ming-Sin Cheung, Luca Ermini. Plasticity of repetitive sequences demonstrated by the complete mitochondrial genome of Eucalyptus camaldulensis. Frontiers in plant science. 2024. 15. 1339594-1339594
Yoshinori Fukasawa, Kenichiro Imai, Paul Horton. Prediction of mitochondrial targeting signals and their cleavage sites. Methods in Enzymology. 2024. 161-192
Lama AlAbdi, Hanan E Shamseldin, Ebtissal Khouj, Rana Helaby, Bayan Aljamal, Mashael Alqahtani, Aisha Almulhim, Halima Hamid, Mais O Hashem, Firdous Abdulwahab, et al. Beyond the exome: utility of long-read whole genome sequencing in exome-negative autosomal recessive diseases. Genome medicine. 2023. 15. 1. 114-114
Patrick Driguez, Salim Bougouffa, Karen Carty, Alexander Putra, Kamel Jabbari, Muppala Reddy, Richard Soppe, Ming Sin Cheung, Yoshinori Fukasawa, Luca Ermini. LeafGo: Leaf to Genome, a quick workflow to produce high-quality de novo plant genomes using long-read sequencing technology. GENOME BIOLOGY. 2021. 22. 1

MISC (1件)：

Géraldine Genard, Luca Tirinato, Francesca Pagliari, Jessica Da Silva, alessandro giammona, Fatema Alquraish, Marie Bordas, Maria Grazia Marafioti, simone di franco, Jeannette Jansen, et al. Lipid Droplets Fuel Small Extracellular Vesicle Biogenesis. 2022

講演・口頭発表等 (3件)：

Solutions and new challenges of bioinformatics in long-accurate read era.
(GIW/ISCB-Asia 2022 2022)
Reference-free data quality control using LongQC
(Nanopore Community Meeting 2020 2020)
Accurate prediction of mitochondrial presequence and their cleavage site with MitoFates identifies hundreds of novel human mitochondrial protein candidates
(ISMB 2014 2014)

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (6件)：

2023/04 - 現在宇都宮大学バイオサイエンス教育研究センター准教授
2018/07 - 2023/03 King Abdullah University of Science and Technology Core Labs Team lead
2017/05 - 2018/07 King Abdullah University of Science and Technology Core Labs Staff scientist
2015/04 - 2017/03 国立研究開発法人産業技術総合研究所人工知能研究センター産総研特別研究員
2014/10 - 2015/03 独立行政法人日本学術振興会特別研究員 (PD) *DC1より切り替え

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委員歴 (2件)：

2023/09 - 2024/09 日本植物学会第88回大会実行委員会
2012 - 2013 Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB) Organizing committee

受賞 (6件)：

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所属学会 (2件)：

日本分子生物学会 , 日本植物学会

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深沢 嘉紀