研究者
J-GLOBAL ID:202301018567040440   更新日: 2024年12月06日

外山 侑樹

トヤマ ユウキ | Toyama Yuki
所属機関・部署:
職名: 特任助教
研究分野 (4件): 構造生物化学 ,  生物物理学 ,  薬系分析、物理化学 ,  生物分子化学
競争的資金等の研究課題 (4件):
  • 2024 - 2027 DDXヘリカーゼによるRNA構造リモデリング機構の解明
  • 2022 - 2022 Probing the structural dynamics of human mitochondrial protease HtrA2 by methyl-TROSY NMR
  • 2021 - 2022 ミトコンドリアプロテアーゼHtrA2の活性化機構の解明
  • 2019 - 2021 熱ショック因子の温度感知機構の構造生物学的解明
論文 (29件):
  • Debajyoti De, Nemika Thapliyal, Ved Prakash Tiwari, Yuki Toyama, D. Flemming Hansen, Lewis E. Kay, Pramodh Vallurupalli. Mapping the FF domain folding pathway via structures of transiently populated folding intermediates. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2024
  • Yuki Toyama, Ichio Shimada. Quantitative analysis of the slow exchange process by 19F NMR in the presence of scalar and dipolar couplings: applications to the ribose 2′-19F probe in nucleic acids. Journal of Biomolecular NMR. 2024
  • Yuki Toyama, Ichio Shimada. NMR characterization of RNA binding property of the DEAD-box RNA helicase DDX3X and its implications for helicase activity. Nature Communications. 2024
  • Robert W. Harkness, Huaying Zhao, Yuki Toyama, Peter Schuck, Lewis Kay. Exploring Host-Guest Interactions within a 600 kDa DegP Protease Cage Complex Using Hydrodynamics Measurements and Methyl-TROSY NMR. Journal of the American Chemical Society. 2024
  • Atul Kaushik Rangadurai, Yuki Toyama, Lewis E. Kay. Sometimes pulses just have to be perfect - An example based on the measurement of amide proton transverse relaxation rates in proteins. Journal of Magnetic Resonance. 2023. 349. 107412-107412
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MISC (5件):
  • 岩原 淳二, 外山侑樹. NMRを用いた生体高分子表面周辺静電ポテンシャルの直接測定. 日本核磁気共鳴学会機関誌. 2024. 13. 2. 86-92
  • 外山侑樹. 核磁気共鳴静電ポテンシャル測定による非膜オルガネラ形成の分子機構の解析. 生物物理. 2023. 63. 5. 276-280
  • 外山侑樹, 嶋田一夫, 西田紀貴. RAC1発がん性変異体の動的分子機構. 細胞. 2023. 55. 3
  • 外山侑樹, Lewis Kay. 混合安定同位体標識を活用したタンパク質オリゴマーのアロステリック共役機構のNMR解析. 分光研究. 2023. 72. 1
  • 外山侑樹, 嶋田一夫. G蛋白質共役受容体 がんとG蛋白質変異:動的分子メカニズムの解明. 脳神経内科(神経内科). 2021. 94. 4. 488
学歴 (1件):
  • 2012 - 2015 東京大学 大学院薬学系研究科
学位 (1件):
  • 博士(薬科学) (東京大学)
経歴 (5件):
  • 2024/09 - 現在 東京大学 大学院薬学系研究科 特任助教
  • 2022/10 - 2024/08 国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 研究員
  • 2019/04 - 2022/09 トロント大学 博士研究員
  • 2018/05 - 2019/03 東京大学 大学院薬学系研究科 特任研究員
  • 2015/04 - 2018/04 一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム 特別研究職員
受賞 (2件):
  • 2018/05 - The 59th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference JMR Award
  • 2015/11 - 日本核磁気共鳴学会 若手ポスター最優秀賞 (JEOL RESONANCE賞)
所属学会 (3件):
日本生物物理学会 ,  日本薬学会 ,  日本核磁気共鳴学会
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