坂本祥駿

サカモトヨシタカ | Sakamoto Yoshitaka

所属機関・部署：
職名：研究員

研究キーワード (2件)：バイオインフォマティクス , がんゲノム

競争的資金等の研究課題 (2件)：

論文 (14件)：

Hajime Suzuki, Masahiro Sugawa, Yoshitaka Sakamoto, Yuichi Shiraishi. mm2-ivh: simple and precise overlap detection in alpha satellite HORs with interval hashing. Bioinformatics (Oxford, England). 2025
Keisuke Kunigo, Satoi Nagasawa, Keiko Kajiya, Yoshitaka Sakamoto, Suzuko Zaha, Yuta Kuze, Akinori Kanai, Kotaro Nomura, Masahiro Tsuboi, Genichiro Ishii, et al. Targeted long-read methylation analysis using hybridization capture suitable for clinical specimens. Cell reports methods. 2025. 101215-101215
Yasuhiko Haga, Yoshitaka Sakamoto, Keiko Kajiya, Hitomi Kawai, Miho Oka, Noriko Motoi, Masayuki Shirasawa, Masaya Yotsukura, Shun-Ichi Watanabe, Miyuki Arai, et al. Whole-genome sequencing reveals the molecular implications of the stepwise progression of lung adenocarcinoma. Nature communications. 2023. 14. 1. 8375-8375
Yasuhiko Haga, Yoshitaka Sakamoto, Miyuki Arai, Yutaka Suzuki, Ayako Suzuki. Long-Read Whole-Genome Sequencing Using a Nanopore Sequencer and Detection of Structural Variants in Cancer Genomes. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2632. 177-189
Yoshitaka Sakamoto, Shuhei Miyake, Miho Oka, Akinori Kanai, Yosuke Kawai, Satoi Nagasawa, Yuichi Shiraishi, Katsushi Tokunaga, Takashi Kohno, Masahide Seki, et al. Phasing analysis of lung cancer genomes using a long read sequencer. Nature communications. 2022. 13. 1. 3464-3464

講演・口頭発表等 (5件)：

Cancer genome analysis based on personalized reference genome using long-read sequencing technologies
(The 70th Annual Meeting of the Japan Society of Human Genetics 2025)
個別化参照ゲノムに基づいたがんゲノム解析によるがんゲノム構造の再構成
(第84回日本癌学会学術総会 2025)
Personalized reference genome-based pipeline for cancer genome analyses to identify somatic mutations comprehensively
(17th RECOMB-CCB 2025 2025)
ナノポアシークエンサーを用いたDNA付加体検出手法の開発
(2024年度(令和6年度)日本環境変異原ゲノム学会公開シンポジウム 2024)
がん患者の個別化参照ゲノムに基づいたアプローチによるがんゲノム中の正確な構造変異の探索
(第82回日本癌学会学術総会 2023)

学歴 (4件)：

学位 (1件)：

経歴 (2件)：

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坂本 祥駿