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J-GLOBAL ID：200901003525240956   Update date: Nov. 20, 2024

Okamura Kohji

オカムラ コウジ | Okamura Kohji
Affiliation and department：
National Center for Child Health and Development Department of Systems BioMedicine

About National Center for Child Health and Development Department of Systems BioMedicine


Job title： Division Chief
Homepage URL  (1)： https://aihospital.ncchd.go.jp/okamura/
Research field  (8)： Genetics ,  Molecular biology ,  Genomics ,  Systems genomics ,  Software ,  Biological, health, and medical informatics ,  Information security ,  Basic physical chemistry
Research keywords  (9)： gene regulation ,  genomic imprinting ,  retrotransposition ,  DNA methylation ,  molecular evolution ,  bacteria ,  physical chemistry ,  deep learning ,  information security
Research theme for competitive and other funds  (6)：
  • 2023 - 2026 クラウド上の医療AI利用促進のためのネットワークセキュリティ構成類型化と実証及び施策の提言
  • 2021 - 2024 細胞のリプログラミングによるDNAメチル化変化を利用した遺伝子発現制御の理解
  • 2016 - 2019 iPS細胞誘導によるクローン性を利用したドライバーおよびパッセンジャー変異の検出
  • 2011 - 2015 プロモータ領域のメチル化を利用した遺伝子発現制御の進化的な獲得
  • 2008 - 2010 Identification of de novo DNA methylation signal by comparative genomics
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Papers (74)：
  • Morita-Nakagawa M, Okamura K, Nakabayashi K, Inanaga Y, Shimizu S, Guo WZ, Fujino M, Li XK. Supervised machine learning of outbred mouse genotypes to predict hepatic immunological tolerance of individuals. Sci. Rep. 2024. 14. 1. 24399
  • Matsubara K, Ohgami Y, Okamura K, Aoto S, Fukami M, Shimada Y. Machine learning trial to detect sex differences in simple sticker arts of 1606 preschool children. Minerva Pediatr. 2024. 76. 3. 343-349
  • Hattori A, Seki A, Inaba N, Nakabayashi K, Takeda K, Tatsusmi K, Naiki Y, Nakamura A, Ishiwata K, Matsumoto K, et al. Expression levels and DNA methylation profiles of the growth gene SHOX in cartilage tissues and chondrocytes. Sci. Rep. 2024. 14. 1. 8069
  • Amano N, Narumi S, Aizu K, Miyazawa M, Okamura K, Ohashi H, Katsumata N, Ishii T, Hasegawa T. Single-exon deletions of ZNRF3 exon 2 cause congenital adrenal hypoplasia. J. Clin. Endocrinol. Metab. 2024. 109. 3. 641-648
  • Kawano T, Okamura K, Shinchi H, Ueda K, Nomura T, Shiba K. Differentiation of large extracellular vesicles in oral fluid: combined protocol of small force centrifugation and sedimentation pattern analysis. J. Extracell. Biol. 2024. 3. 2. e143
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MISC (24)：
  • Okamura K. JavaScriptで出力する論文リストのウェブサイトをサーバレスで公開. ICR臨床研究入門. 2024. 81. 4660
  • Okamura K. ハッシュ関数とハッシュ値および暗号学的ハッシュ関数. ICR臨床研究入門. 2024. 81. 521
  • Okamura K. HTMLの構造をオブジェクトとして扱うJavaScriptのDOMの理解. ICR臨床研究入門. 2024. 81. 4248
  • Okamura K. 解読不可能なワンタイムパッドのPython実装と暗号理論の基礎の理解. ICR臨床研究入門. 2023. 81. 4095
  • Okamura K. PythonとSQLAlchemyでデータベースを操作. ICR臨床研究入門. 2023. 81. 4094
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Patents (4)：
  • Materials and methods for glycan profiling
  • 非破壊的な細胞解析方法
  • 細胞判定装置、細胞判定方法及びプログラム
  • Memory management
Books (7)：
  • 医療×AI: AWSの生成AIサービスと切り拓く医療の新時代 -遺伝カウンセリングへの活用に向けて-
    2024
  • スプレッドシートに代わる関係データベースの活用
    メディカル ドゥ 遺伝子医学 通巻43号 2023 ISBN:9784909508218
  • Understanding the contribution of deep learning to the future of genetic counseling
    Japanese Journal of Genetic Counseling 2022
  • 間葉系幹細胞研究を変えつつある人工知能
    医歯薬出版 医学のあゆみ 第272巻10号, 1064-1068 (ASIN: B0851M9H94) 2020
  • Understanding deep learning by a glimpse of a future genome database
    Medical Do 2019 ISBN:9784909508027
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Lectures and oral presentations  (63)：
  • Exploration of allele-specific DNA methylated regions in northern pika
    (2024)
  • Allele-specific DNA methylation in Northern Pika <i>IMPACT</i>
    (第47回日本分子生物学会年会< 2024)
  • Development of medical AI services envisioning future integration with EHR terminals
    (第44回医療情報学連合大会 2024)
  • Enhanced retrotransposition of endogenous genes in ERCC2-deficient cells derived from a patient with xeroderma pigmentosum
    (29th Congress of Chinese Pediatric Society 2024)
  • Identification of lagomorph core promoter regions using human transcription start sites
    (第17回日本エピジェネティクス研究会年会 2024)
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Education (3)：
  • 1999 - 2003 University of Tokyo Graduate School of Medicine Department of Molecular Cell Biology
  • 1994 - 1996 Tohoku University Graduate School of Science Department of Chemistry
  • 1990 - 1994 Tohoku University Faculty of Science Department of Chemistry
Professional career (2)：
  • Master of Science (Tohoku University)
  • Ph.D. (The University of Tokyo)
Work history (12)：
  • 2021 - 現在 Mie University Graduate School of Medicine Associate professor
  • 2012 - 現在 National Center for Child Health and Development Department of Systems BioMedicine Division chief
  • 2015 - 2018 Kyoto University Graduate School of Medicine Visiting researcher
  • 2012 - 2013 Waseda University School of Social Sciences Part-time lecturer
  • 2011 - 2013 Tsukuba University Graduate School of Comprehensive Human Sciences Part-time lectuler
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Committee career (1)：
  • 学際生命科学東京コンソーシアム 教育高度化部会委員
Awards (1)：
  • 2011/12 - Asia Pacific Bioinformatics Network Best Paper Award (InCob 2011) Profiling ascidian promoters as the primordial type of vertebrate promoter
Association Membership(s) (3)：
日本エピジェネティクス研究会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本分子生物学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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