Rchr
J-GLOBAL ID:200901009575866862
Update date: Nov. 18, 2024
Tsumoto Kouhei
ツモト コウヘイ | Tsumoto Kouhei
Affiliation and department:
Job title:
Professor
Other affiliations (1):
Homepage URL (1):
http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/phys-biochem/
Research field (3):
Biophysics
, Applied biofunctional and bioprocess engineering
, Biochemistry
Research keywords (8):
生物機能工学
, 生物物理学
, 蛋白質科学
, 生命分子工学
, protein
, kinetics
, thermodynamics
, interaction
Research theme for competitive and other funds (40):
- 2022 - 2029 Full-body electronic skins for digital me
- 2019 - 2024 生命金属動態の理解と制御のための分子認識素子の開発
- 2019 - 2024 Integrated Biometal Science: Research to Explore Dynamics of Metals in Cellular System
- 2019 - 2024 Integrated Biometal Science: Research to Explore Dynamics of Metals in Cellular System
- 2020 - 2023 Elucidation and Control of Local Fractions in Protein Engineering
- 2017 - 2022 Development of heteroduplex oligonucleotide crossing the blood-brain barrier
- 2018 - 2021 Pioneering glioblastoma therapy by in situ mRNA-based amplification of immune checkpoint inhibitors
- 2018 - 2021 Pioneering glioblastoma therapy by in situ mRNA-based amplification of immune checkpoint inhibitors
- 2017 - 2019 Development of species-specific anti-bacterial therapeutic agents based on molecular interaction
- 2017 - 2019 Development of novel in situ crosslinked hydrogel using lectins
- 2016 - 2019 Screening and design of ligands regulating the process of protein-protein interactions based on biophysical approaches
- 2015 - 2018 Thermodynamic basis of life: protein-carbohydrate interaction
- 2013 - 2018 Dynamics of Molecular Pattern Recognition in Protein Interaction
- 2013 - 2017 Development of Polymeric Micelles for Brain-Targeted Delivery of Nucleic Acid Drugs to Treat Intractable Neurological Diseases
- 2013 - 2016 Ligand discovery based on biophysical analyses
- 2012 - 2016 Bio-design for interface molecules in nano scale
- 2011 - 2015 Analysis of regulatory mechanisms of newly identified ERK substrates
- 2009 - 2011 Structural and Functional Analyses of Intrinsically Unfolded Proteins for Engineering
- 2007 - 2008 蛋白質相互作用における多重特異性の定量的記述と応用
- 2004 - 2008 Protein Engineering for Construction of Bio-interfaces
- 2006 - 2007 Structural and functional analysis of the motor protein prestin using purified protein
- 2005 - 2007 Development of a novel system for solubilization and preparation of proteins based on the aggregation suppression effects of arginine on proteins
- 2006 - 2006 受容体分子認識における多重特異性発現機構の定量的解明
- 2005 - 2006 Fabrication of dynamic materials using molecular chaperons
- 2004 - 2005 抗原抗体反応における特異性・親和性創出と水分子との関連に関する実験的考察
- 2005 - 蛋白質超分子構造解析と応用
- 2005 - 生命分子相互作用解析と設計
- 2005 - 天然変性蛋白質の構造・機能解析と工学応用
- 2005 - 生命分子の構造・機能マニピュレーション
- 2002 - 2004 細胞表面抗原特異的ヒト抗体の網羅的選択・調製と応用
- 2001 - 2003 GENERATION AND UTILIZATION OF NOVEL HUMAN ANTIBODY MOLECULES BASED ON GENETIC INFORMATION
- 2001 - 2002 構造情報に基づく細胞性免疫システムにおける特異的分子認識機構の解明
- 2000 - 2001 構造情報に基づく抗原抗体反応の精密解析と特異性・親和性を決定する因子の抽出
- 1999 - 2000 シグナル伝達機構解析を目指した抗体-受容体キメラ蛋白質の創製と構造解析
- 1997 - 1999 Establishment of the adoptive anticancer immunotherapy for the unresectable cholangiocarcinoma using the bispecific antibody - Construction of bacterial expression system of bispecific antibodies
- 1998 - 1998 新機能抗体-受容体キメラ蛋白質の創製と細胞増殖制御機構解析への応用
- 1997 - 1998 抗体分子の人工設計を目指す抗原抗体相互作用の精密解析
- 1996 - 1996 新規なファージベクター系を利用した抗体分子の機能改変
- 1995 - Protein Therapeutics特に抗体工学
- Protein Manipulation,Biomolecular Interaction, Protein Therapeutics,
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Papers (570):
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Kazuhiro Miyanabe, Takefumi Yamashita, Kouhei Tsumoto. Thermodynamic and molecular dynamic insights into how fusion influences peptide-tag recognition of an antibody. Scientific Reports. 2024. 14. 1
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Keisuke Kasahara, Raiji Kawade, Makoto Nakakido, Ryo Matsunaga, Hiroki Akiba, Kevin C. Entzminger, Toshiaki Maruyama, Shigeru C.J. Okumura, Jose M.M. Caaveiro, Daisuke Kuroda, et al. Unveiling the structural mechanisms behind high affinity and selectivity in phosphorylated epitope-specific rabbit antibodies. Journal of Biological Chemistry. 2024. 107989-107989
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Jorge Fernandez-Perez, Akinobu Senoo, Jose M.M. Caaveiro, Makoto Nakakido, Susana de Vega, Ichiro Nakagawa, Kouhei Tsumoto. Structural basis for the ligand promiscuity of the hydroxamate siderophore binding protein FtsB from Streptococcus pyogenes. Structure. 2024
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Wijak Yospanya, Akari Matsumura, Yukihiro Imasato, Tomoyuki Itou, Yusuke Aoki, Hikaru Nakazawa, Takashi Matsui, Takeshi Yokoyama, Mihoko Ui, Mitsuo Umetsu, et al. Design of Cyborg Proteins by Loop Region Replacement with Oligo(ethylene glycol): Exploring Suitable Mutations for Cyborg Protein Construction Using Machine Learning. Bulletin of the Chemical Society of Japan. 2024
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Makoto Nakakido, Seisho Kinoshita, Kouhei Tsumoto. Development of novel humanized VHH synthetic libraries based on physicochemical analyses. Scientific Reports. 2024. 14. 1
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MISC (334):
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鄭澤華, 淡路雅彦, 根岸瑠美, 胡桃坂仁志, 中木戸誠, 津本浩平, 永田宏次, 鈴木道生. ホタテ貝Mizuhopecten yessoensis中腸腺におけるカドミウム結合タンパク質の同定と機能解析. 日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM). 2023. 2023
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中木戸誠, 小菅啓史, 長門石曉, 福田哲也, 板東泰彦, VEGA Susana, 大沼信一, 津本浩平, 津本浩平. 腫瘍抑制蛋白質PRELPのマルチバレント相互作用を介した機能制御. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th
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小菅啓史, 中木戸誠, 中木戸誠, DE VEGA Susana, 長門石曉, 福田哲也, 板東泰彦, 大沼信一, 津本浩平, 津本浩平, et al. 細胞外マトリクスへの局在を介した多重特異性蛋白質PRELPの低親和性相互作用の制御機構の解析. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th
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長門石曉, 木下清晶, 小菅啓史, 黒田大祐, 黒田大祐, 木吉真人, 石井明子, 寺尾陽介, 井出輝彦, 津本浩平. 固定化FcγRIIIaリガンドの抗体認識機構の解明. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th
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山口貴世志, 中川沙弥, 大河原悠哉, 高根希世子, 池上恒雄, 秦裕子, 尾山大明, 長門石曉, 津本浩平, 愛甲丞, et al. Regulation and function of BRD8, a subunit of the TIP60 HAT complex, in colorectal cancer cells. 日本癌学会学術総会抄録集(Web). 2023. 82nd
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Patents (16):
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Robo1に対する親和性を向上させた抗体及び高親和性抗体の分子設計方法
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ROBO1タンパク質に対するダイアボディ型二重特異性抗体
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腫瘍の診断剤又は治療剤
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低免疫原性ストレプトアビジンおよびその利用
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免疫グロブリン折りたたみ構造を持つタンパク質と、サブユニット構造となりうるタンパク質とを融合させた単量体タンパク質からなる多量体タンパク質の調製方法
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Books (108):
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黄色ブドウ球菌の鉄取り込み機構の解明と革新的抗菌戦略の開発
生体の科学 vol.75 no.2 2024年04月号 (医学書院) (2024) 2024
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医学用語解説 次世代抗体工学
炎症と免疫 vol.31 no.4 2023年7月号 (先端医学社) (2023) 2023
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抗体医薬の進歩と課題
週刊医学のあゆみ 285巻10号 (医歯薬出版) (2023) 2023
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第2編 医用工学の基盤技術 6
抗体工学 医用工学ハンドブック (エヌ・ティー・エス) (2022) 2022
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医用工学ハンドブック
(エヌ・ティー・エス) (2022) 2022
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Lectures and oral presentations (436):
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蛋白質相互作用解析と創薬
(日本薬学会 第144年会 2024)
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Vaccine Antigen and Antibody Protein Engineering
(The Joint 24th International Conference on Emerging Infectious Diseases in the Pacific Rim of the U.S.-Japan Cooperative Medical Sciences Program (USJCMSP) 2024)
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次世代抗体医薬品開発の現状と今後
(第9回次世代モダリティセミナー 2024)
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次世代抗体医薬品への期待
(第33回日本リウマチ学会関東支部学術集会 2023)
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創薬モダリティを加速させる物理化学的解析支援
(第44回日本臨床薬理学会学術総会 2023)
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Education (3):
- - 1995 The University of Tokyo
- - 1993 The University of Tokyo
- - 1991 The University of Tokyo
Professional career (1):
Work history (19):
- 2023/04 - 現在 School of Engineering, The University of Tokyo Vice Dean
- 2013/04 - 現在 School of Engineering, The University of Tokyo Department of Bioengineering Professor
- 2010/05 - 現在 Institute of Medical Science Medical Proteomics Laboratory Professor
- 2012/04 - 2016/03 Institute of Industrial Science, The University of Tokyo Professor
- 2007/04 - 2010/04 東京大学准教授(大学院新領域創成科学研究科)
- 2006 - 2007 Kyoto University Institute for Chemical Research
- 2005 - 2007 東京大学助教授(大学院新領域創成科学研究科)
- 2002 - 2005 東北大学助教授(大学院工学研究科)
- 2003 - 2004 Tohoku University Center for Interdisciplinary Research
- 2001 - 2002 東北大学講師(大学院工学研究科)
- 2000 - 2001 筑波大学先端学際領域研究センター 客員研究員
- 1995 - 2001 東北大学助手(大学院工学研究科)
- 1997 - 1999 Osaka University Institute for Protein Research
- 島根大学大学院医学研究科 非常勤講師
- Kyushu University Faculty of Agriculture
- Hokkaido University Graduate School of Engineering
- Kyushu University Faculty of Pharmaceutical Sciences
- Nagoya University Graduate School of Engineering
- 北海道大学大学院理学研究科 非常勤講師
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Committee career (26):
- 2018 - 現在 日本化学会フロンティア生命化学研究会 庶務担当幹事
- 2013 - 現在 日本DDS学会 評議員
- 2012 - 現在 日本生化学会 理事,代議員,評議員
- 2011 - 現在 日本蛋白質科学会 理事,執行役員
- 2019 - 2024 先端的バイオ創薬等基盤技術開発事業 プログラムオフィサー
- 2020 - 2022 Protein Science Society of Japan President
- 2014 - 2019 文部科学省(AMED) 革新的バイオ医薬品基盤技術開発推進事業推進委員
- 2014 - 2019 JST さきがけ研究領域(一細胞)アドバイザー
- 2014 - 2016 日本生化学会 関東支部幹事
- 2013 - 2015/03 JST JST-CRDSライフサイエンス・医療分野俯瞰委員
- 2014 - 2014 特許庁 特許動向調査委員会委員(抗体医薬)
- 2012 - 2014 産業技術総合研究所健康工学研究部門 評価委員
- 2006 - 2012 日本生化学会 Journal of Biochemistry Associate Editor
- 2005 - 2010 日本蛋白質科学会 庶務担当理事
- 2006 - 2008 日本化学会生命化学研究会 幹事
- 2003 - Chemistry2003)実行委員・プログラム委員
- 2003 - 平成14~15年 ISBC2003(International Symposium of Biomolecular
- 2001 - 平成13年 化学展「2001年なぞとき体験の旅」企画実行委員
- 平成20年 日本蛋白質科学会年会 組織委員
- 平成19年 日本生物物理学会年会 実行委員
- 平成16~17年 日本生物物理学会誌(生物物理)編集委員
- 平成14年 第25回日本分子生物学会年会プログラム委員
- 平成14~15年 日本化学会生体機能関連化学部会若手幹事
- 平成13~16年 日本生化学会誌(生化学)プラナー
- 平成12年 日本生物物理学会年会実行委員
- 平成 9~14年 日本生化学会東北支部幹事
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Awards (8):
Association Membership(s) (9):
高分子学会
, アメリカ生化学・分子生物学会
, アメリカ化学会
, アメリカ蛋白質科学会
, 日本分子生物学会
, 日本生化学会
, 日本化学会
, 日本生物物理学会
, 日本蛋白質科学会
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