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J-GLOBAL ID：200901019779819060   Update date: Apr. 17, 2024

Rintaro Saito

Rintaro Saito
Research field  (1)： Biological, health, and medical informatics
Research theme for competitive and other funds  (13)：
  • 2022 - 2025 統合シースレスキャピラリー電気泳動-質量分析システムの開発
  • 2022 - 2025 Construction of Pipeline for Integrated Metabolome Analyses of Kidney Disease
  • 2019 - 2022 Development of AI for the discovery of novel kidney disease genes using metabolomics and network biology
  • 2020 - 2022 仮想人体構築のための数理モデル化
  • 2018 - 2022 人々を軸にあらゆる情報をオープンに活用する基盤「PeOPLe」によるライフイノベーションの創出
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Papers (77)：
  • Harada S, Iida M, Miyagawa N, Hirata A, Kuwabara K, Matsumoto M, Okamura T, Edagawa S, Kawada Y, Miyake A, et al. Study Profile of the Tsuruoka Metabolomics Cohort Study (TMCS). J Epidemiol. 2023
  • Nomura M, Ohuchi M, Sakamoto Y, Kudo K, Yaku K, Soga T, Sugiura Y, Morita M, Hayashi K, Miyahara S, et al. Niacin restriction with NAMPT-inhibition is synthetic lethal 1 to neuroendocrine carcinoma. Nat Commun. 2023
  • Sharma K, Zhang G, Saito R. Suppression of mitochondrial respiration is a feature of cellular glucose toxicity. Trans Am Clin Climatol Assoc. 2023. 133. 24-33
  • Matsuta R, Yamamoto H, Tomita M, Saito R. iDMET: network-based approach for integrating differential analysis of cancer metabolomics. BMC Bioinformatics. 2022. 23. 1
  • Saito R, Hirayama A, Akiba A, Kamei Y, Kato Y, Ikeda S, Kwan B, Pu M, Natarajan L, Shinjo H, et al. Urinary metabolome analyses of patients with acute kidney injury using capillary electrophoresis-mass spectrometry. Metabolites. 2021. 11. 10
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MISC (8)：
  • 谷内江望, 斎藤輪太郎, 杉山直幸, 菅原潤一, 冨田勝, 石濱泰. 大規模データマイニングからみえるリン酸化プロテオームの全貌. 生化学. 2009. ROMBUNNO.3S2P-3
  • YACHIE NOZOMU, SAITO RINTARO, SUGIYAMA NAOYUKI, TOMITA MASARU, ISHIHAMA YASUSHI. Macroscopic Relationships between Protein Phosphorylation and Physical Interaction. 生物物理. 2009. 49. Supplement 1. S50
  • 谷内江 望, 斎藤 輪太郎, 杉山 直幸, 菅原 潤一, 冨田 勝, 石濱 泰. リン酸化プロテオミクスによるシグナル伝達解析の新展開 大規模データマイニングからみえるリン酸化プロテオーム全貌. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2009. 82回. 3S2p-3
  • IMAMURA HARUNA, YACHIE NOZOMU, SAITO RINTARO, ISHIHAMA YASUSHI, TOMITA MASARU. Towards systematic discovery of signal transduction network via phosphorylation dynamics data. 日本分子生物学会年会講演要旨集. 2009. 32nd. Vol.2. 62
  • YACHIE NOZOMU, SAITO RINTARO, SUGIYAMA NAOYUKI, TOMITA MASARU, ISHIHAMA YASUSHI. Macroscopic relationships between protein phosphorylation and physical interaction. 日本分子生物学会年会講演要旨集. 2009. 32nd. Vol.1. 56
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Patents (1)：
  • タンパク質間相互作用の評価方法
Books (10)：
  • 実験医学「Cytoscapeによる細胞内インタラクトームの解析」
    羊土社 2013
  • 機能性non-coding RNA「バイオインフォマティクスを用いたnon-coding RNA予測の様々な試み」
    クバプロ 2006
  • 人工知能学事典「モチーフ抽出」
    共立出版 2005
  • バイオインフォマティクスの基礎-ゲノム解析プログラミングを中心に
    サイエンス社 2005
  • ゲノムネットワーク「ゲノムワイドデータの精製」
    共立出版 2004
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Lectures and oral presentations  (13)：
  • Multi-omics and Systems Analysis Reveal a Novel Role of MDM2 in Diabetic Nephropathy
    (ISN's Forefronts Symposium on the Metabolome and Microbiome in Kidney Disease 2016)
  • Computational Prediction and Experimental Analyses of Proteins That Bridge Metabolite Markers of Human Diabetic Nephropathy
    (ASN Kidney Week 2015 Annual Meeting 2015)
  • A travel guide to Cytoscape plugins
    (Cytoscape Retreat 2012)
  • Comprehensive Analysis of Domain-Domain Interactions Using In Vitro Virus
    (Genome Informatics Workshop 2007 (GIW2007) 2007)
  • In vitro virus法により得られたタンパク質間相互作用データのマイニング
    (慶應義塾大学21世紀COEプログラム「システム生物学による生命機能の理解と制御」公開シンポジウム「“ウエットバイオロジー”と“ドライバイオロジー”の融合・連携」 2006)
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Education (1)：
  • 2000 - 2000 Keio University 政策・メディア研究科
Work history (5)：
  • 2017/09 - 現在 慶應義塾大学 政策・メディア研究科 特任教授
  • 2014/03 - 2017/07 University of California, San Diego Department of Medicine Associate Project Scientist
  • 2011/02 - 2014/01 University of California, San Diego Department of Medicine Visiting Assistant Professor
  • 2002/04 - 2011/01 慶應義塾大学 環境情報学部 専任講師(有期)
  • 2000/04 - 2002/03 理化学研究所 ゲノム科学総合研究センター 研究員
Committee career (5)：
  • 2018 - 2018 日本バイオインフォマティクス学会 生命医薬情報学連合大会プログラム委員
  • 2011 - 2014 National Resource for Network Biology / The San Diego Center for Systems Biology Collaboration consultant, Cytoscape instructor
  • 2010 - 2010 The International Conference on Bioinformatics (InCoB2010) Programme committee member
  • 2008 - 2010 Genome Informatics Workshop (GIW) Programme committee member
  • 2010 - The International Conference on Bioinformatics (InCoB2010) Programme committee member
Association Membership(s) (2)：
日本分子生物学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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