Rchr
J-GLOBAL ID：200901020603956094   Update date: Nov. 07, 2024

Nakamura Shota

ナカムラ ショウタ | Nakamura Shota
Affiliation and department：
Osaka University Research Institute for Microbial Diseases

About Osaka University Research Institute for Microbial Diseases


Job title： Associate Professor
Research field  (5)： Genomics ,  Structural biochemistry ,  Bacteriology ,  Infectious disease ,  Hygiene and public health (laboratory)
Research keywords  (5)： Genomics ,  Metagenomics ,  バイオインフォマティクス ,  構造生物学 ,  Microbiome
Research theme for competitive and other funds  (22)：
  • 2023 - 2026 腸内細菌叢によるアンドロゲンシグナル経路を介した去勢抵抗性前立腺癌進展機序の解明
  • 2022 - 2026 遺伝的素因、生活習慣、腸内細菌叢の多面的解析に基づく前立腺癌の早期診断戦略の構築
  • 2020 - 2023 Genomic Epidemiological Study of Mycobacteria circulating in Indonesia
  • 2020 - 2023 病原微生物のその場メタゲノミックタイピング手法の研究開発
  • 2017 - 2020 Molecular epidemiology study of the colistin-resistant bacteria dissemination in Vietnam
Show all
Papers (321)：
  • Kazunobu Asao, Noriyasu Hashida, Kazuichi Maruyama, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Kohji Nishida. Cases of endophthalmitis caused by Candida albicans and Candida dubliniensis identified via internal transcribed spacer deep sequencing. BMC ophthalmology. 2024. 24. 1. 444-444
  • Kiyoharu Fukushima, Yuki Matsumoto, Yuko Abe, Kazuki Hashimoto, Daisuke Motooka, Seigo Kitada, Haruko Saito, Sho Komukai, Eriko Fukui, Takayuki Niitsu, et al. Variability of macrolide-resistant profile in Mycobacterium avium complex pulmonary disease. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2024. e0121324
  • Jayedul Hassan, Atsushi Hinenoya, Noritoshi Hatanaka, Sharda Prasad Awasthi, Goutham Belagula Manjunath, Nahid Rahman, Jyoji Yamate, Shota Nakamura, Daisuke Motooka, Akira Nagita, et al. A plasmid-mediated type III secretion system associated with invasiveness and diarrheagenicity of Providencia rustigianii. mBio. 2024. e0229724
  • Hiroya Oki, Ryotaro Niwa, Somboonthum Pranee, Daisuke Motooka, Yoshiyuki Onda, Jun Nakata, Hiroko Nakajima, Yoshihiro Oka, Haruo Sugiyama, Yuka Yoshii, et al. Identification of causative fungus from sterile abscess using metagenomics followed by in situ hybridization. Access microbiology. 2024. 6. 8
  • Fumiaki Ihara, Hisako Kyan, Yasuhiro Takashima, Fumiko Ono, Kei Hayashi, Tomohide Matsuo, Makoto Igarashi, Yoshifumi Nishikawa, Kenji Hikosaka, Hirokazu Sakamoto, et al. Far-East Asian Toxoplasma isolates share ancestry with North and South/Central American recombinant lineages. Nature communications. 2024. 15. 1. 4278-4278
ｍore...
MISC (63)：
  • 吉田 志緒美, 露口 一成, 青野 昭男, 五十嵐 ゆり子, 松本 悠希, 中村 昇太, 能田 淳, 御手洗 聡, 井上 義一, 竹本 潔, et al. 重症心身障害児施設におけるM.abscessus subsp.massilienseの院内感染事例. 結核. 2023. 98. 4. 118-118
  • 元岡大祐, 前田悠一, 前田悠一, 沖大也, 田中健太郎, 猪頭英里, 平田晴彦, 木田博, 熊ノ郷淳, 中村昇太, et al. Longitudinal alterations of the gut microbiota and mycobiota on COVID-19 severity. 日本細菌学雑誌(Web). 2023. 78. 1
  • 岡田紘一, 竹澤健太郎, 小山佳久, 元岡大祐, 中村昇太, 辻村剛, 今中岳洋, 栗林宗平, 福原慎一郎, 木内寛, et al. 前立腺腫大は前立腺細菌叢と関連するか:前立腺細菌叢のプロファイリング. 日本排尿機能学会誌(Web). 2022. 33. 1. 208-208
  • 清水健太郎, 平田陽彦, 徳平夏子, 上田安希子, 元岡大祐, 中村昇太, 小倉裕司. A case of refractory massive diarrhea in a patient with COVID-19. 日本救急医学会雑誌. 2022. 33. 1
  • 安部祐子, 安部祐子, 福島清春, 福島清春, 福島清春, 松本悠希, 新津敬之, 新津敬之, 新居卓朗, 木庭太郎, et al. リアルタイムコアゲノム解析による非結核性抗酸菌症の迅速・高精度同定法の確立および臨床応用. 日本サルコイドーシス/肉芽腫性疾患学会雑誌. 2021. 41
ｍore...
Books (8)：
  • 非結核性抗酸菌症の血清診断について
    "Insmed合同会社 第95回日本感染症学会学術講演会 第69回日本化学療法学会総会 記録集" 2021
  • 次世代シーケンス技術の現状と今後-2020
    公益社団法人 日本生物工学会 2021
  • Structual basis of type IVb pilus-mediated bacterial adhesion to the intestinal epithelium
    Spring-8 SACLA Research Frontiers 2019
  • 抗生物質の「先」の薬を目指す
    神戸新聞総合出版センター 2018 ISBN:9784343010018
  • ウイルス検出のためのNGS解析のデザインと運用
    PHARM TECH JAPAN 2018
ｍore...
Lectures and oral presentations  (110)：
  • Current Diagnostic Approach of Non-tuberculous Mycobacteria
    (インドネシア大学医学部 交流会 2023)
  • メタゲノム解析による環境微生物探索
    (第151 回関西実験動物研究会 2023)
  • Automated Analysis Pipeline for Nanopore Sequencing ー Identification of Non-Tuberculous Mycobacteria
    (National Institute of Cholera and Enteric Diseases (NICED) Seminar 2023)
  • 非結核性抗酸菌の迅速その場同定
    (第6回抗酸菌研究会 2022)
  • 腸内細菌がIVb型線毛システム依存的に分泌するタンパク質の特徴
    (第45回分子生物学会 2022)
ｍore...
Education (3)：
  • - 2006 Osaka University Graduate School of Pharmaceutical Sciences
  • - 2003 Osaka University Graduate School of Pharmaceutical Sciences
  • - 2001 Hiroshima University Faculty of Science Department of Chemistry
Work history (4)：
  • 2023/01 - 現在 Osaka University Department of Infection Metagenomics, Research Institute for Microbial Diseases Associate Professor
  • 2016/04 - 2022/12 大阪大学微生物病研究所 感染症国際研究センター 病原体同定研究グループ 特任准教授(常勤)
  • 2011 - 2016 大阪大学微生物病研究所 遺伝情報実験センター ゲノム情報解析分野 助教
  • 2006 - 2011 大阪大学微生物病研究所 日本・タイ感染症共同研究センター バイオインフォマティクス部門 特任助教(常勤)
Awards (3)：
  • 2023/10 - 日本微生物学連盟 2023年度 野本賞 カテゴリー「病気と健康」
  • 2020/09 - 科学技術振興機構及び新エネルギー産業技術総合開発機構 大学発ベンチャー表彰2020 文部科学大臣賞 次世代シーケンシングによる腸内細菌DNAの迅速解析法の確立
  • 2014/07 - Osaka University Osaka University President Encouragement Award
Association Membership(s) (5)：
The Crystallographic Society of Japan ,  日本結核・非結核性抗酸菌症学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本ウイルス学会 ,  日本細菌学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

Return to Previous Page

TOP

BOTTOM