Akashi Satoko

アカシサトコ | Akashi Satoko

Affiliation and department：
Homepage URL (1)： http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/stbiol/index.html

Research field (3)： Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry , Molecular biochemistry , Structural biochemistry

Research keywords (8)：質量分析 , DNA , 生体分子 , タンパク質 , mass spectrometry , DNA , biomolecule , protein

Research theme for competitive and other funds (27)：

2024 - 2027 ネイティブ質量分析による膜タンパク質の薬剤スクリーニングプラットフォームの構築
2021 - 2024 Native mass spectrometry of membrane proteins obtained from cultured cells
2019 - 2024 生命金属動態解析を目指したタンパク質のネイティブ質量分析
2018 - 2020 Native Mass Spectrometry for Characterization of Protein interactions under Crowded Conditions
2019 - 2020 Development of native mass spectrometry for protein complexes under crude biological conditions

2017 - 2020 Structural Biology of modified nucleosomes using mass spectrometry

2018 - 2019 夾雑環境下でのネイティブ質量分析によるタンパク質相互作用の観測と追跡

2014 - 2017 結晶構造解析できないタンパク質の気相および溶液における構造の比較

2013 - 2015 X線結晶構造解析が不可能な修飾ヌクレオソームコアの構造解析

2009 - 2014 Target recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein

2009 - 2014 天然変性タンパク質の動的構造解析 -質量分析による解析-

2010 - 2012 イオンモビリティ質量分析による生体超分子のコンフォメーション解析

2008 - 2012 Dynamics of intrinsically disordered proteins and their functional roles

2007 - 2009 ソフトな相互作用からなる、塩濃度に敏感な複合体の溶液構造の解析」(2007-2008年度

2008 - 2008 核内転写関連因子の天然変性状態と動的構造解析

2005 - 2007 ソフトな相互作用からなる複合体の MS と NMR による統合的な構造解析法の開発

2005 - 2007 Basic research on double-stranded DNA-binding proteins

2004 - 2005 クロスリンク法と質量分析、NMR をインテグレイトした複合体の構造解析法の開発

2005 - 2005 染色体末端テロメアの構造生物学

2003 - 2005 バイオ質量分析におけるイオン化法の開発「各種イオン化法を駆使した生体反応の解析」

2003 - 2005 Development of ionization methods in mass spectrometry for biological molecules. -Characterization of biological reactions using mass spectrometry with newly dveloped ionization methods-

2001 - 2002 Development of a method for structural characterization of DNA-binding proteins with multiple structural domains

2001 - タンパク質複合体の質量分析

2001 - DNA結合タンパク質の質量分析による構造解析

2001 - Mass spectrometry of protein complexes

2001 - Structural Characterization of DNA binding Proteins by Mass Spectrometry

1999 - 2000 Structural characterization of protein-protein interaction sites by FT-ICR MS

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Papers (103)：

Tsuyoshi Konuma, Tomoyo Takai, Chieko Tsuchiya, Masayuki Nishida, Miyu Hashiba, Yudai Yamada, Haruka Shirai, Yoko Motoda, Aritaka Nagadoi, Eriko Chikaishi, et al. Analysis of the homodimeric structure of a D-Ala-D-Ala metallopeptidase, VanX, from vancomycin-resistant bacteria. Protein Science. 2024. 33. 6
Satoshi Ninomiya, Stephanie Rankin-Turner, Satoko Akashi, Kenzo Hiraoka. Solvent effect on the detection of peptides and proteins by nanoelectrospray ionization mass spectrometry: Anomalous behavior of aqueous 2-propanol. Analytical Biochemistry. 2024. 688. 115461-115461
Noa Suzuki, Tsuyoshi Konuma, Takahisa Ikegami, Satoko Akashi. Biophysical insights into the dimer formation of human Sirtuin 2. Protein science : a publication of the Protein Society. 2024. 33. 5. e4994
Kenzo Hiraoka, Satoshi Ninomiya, Stephanie Rankin-Turner, Satoko Akashi. Sodiation of melittin, cytochrome c, and ubiquitin studied by electrospray mass spectrometry: Stabilities of α-helix and β-sheet in basic solutions. International Journal of Mass Spectrometry. 2024. 498. 117212-117212
Kenzo Hiraoka, Satoko Akashi, Stephanie Rankin-Turner, Satoshi Ninomiya. Site-specific deprotonation/sodiation of gramicidin S studied by electrospray ionization/mass spectrometry. International Journal of Mass Spectrometry. 2023. 493. 117135-117135

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MISC (20)：

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Books (8)：

現代質量分析学
化学同人 2013
“試料分析講座タンパク質分析”、日本分析化学会編
丸善出版 2012
翻訳後修飾のプロテオミクス -質量分析装置を中心とした分析法の原理-
講談社 2011
生命科学のための機器分析実験ハンドブック
羊土社 2007
II-8 タンパク質の相互作用の解析(2) -タンパク質相互作用部位の解析書名:生命科学の最新マヌスペクトロメトリーゲノム創菜をめざして
講談社サイエンティフィク 2002

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Lectures and oral presentations (117)：

薬物スクリーニングを目指した生細胞内タンパク質の直接質量分析
(第49回BMSコンファレンス 2023)
静電および疎水性相互作用を考慮した粗視化分子動力学シミュレーションによる気相構造解析
(第23回日本蛋白質科学会年会 2023)
小胞体ストレスセンサーIRE1の多量体形成ポテンシャルとストレス感知
(第23回日本蛋白質科学会年会 2023)
ヒトSirtuin2の二量体化と脱アセチル化活性の関係
(第23回日本蛋白質科学会年会 2023)
亜鉛結合タンパク質ヒトSirtuin2の二量体化と脱アセチル化活性の解析
(第2回生命金属科学シンポジウム 2023)

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Education (2)：

Chiba University Ph.D.
Chiba University Department of Pharmaceutical Science

Professional career (1)：

Doctor (Pharmaceutical Science) (Chiba University)

Work history (5)：

2020/04 - 現在 Yokohama City University Graduate School of Medical Life Science
2001/04 - 2020/03 Yokohama City Universtiy Graduate School of Medical Life Science Associate Professor
Yokohama City University International College of Arts and Sciences Medical Life Science Graduate School of Medical Life Science Department of Medical Life Science Associate Professor
RIKEN Senior Research Scientist
Ajinomoto Co., Inc. Central Research Institute Research Scientist

Committee career (10)：

2023/04 - 現在日本質量分析学会理事
2021/06 - 現在日本蛋白質科学会役員
2021/04 - 現在 Mass Spectrometry Associate Editor
2019/04 - 2021/03 Mass Spectrometry Editor
2017/04 - 2021/03 日本質量分析学会理事

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Awards (3)：

2006 - 日本薬学会平成18年度学術振興賞
2002 - 日本質量分析学会論文賞
1995 - 日本質量分析学会奨励賞

Association Membership(s) (6)：

日本化学会 , 日本生化学会 , 日本蛋白質科学会 , 日本薬学会 , 日本質量分析学会 , American Society for Mass Spectrometry

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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