Sugimoto Shinya

スギモトシンヤ | Sugimoto Shinya

Affiliation and department：
Job title： Assistant Professor
Other affiliations (1)：

Jikei University

Homepage URL (1)： http://www.jikei.ac.jp/academic/course/11_saikin.html

Research field (6)： Morphology, anatomy , Bacteriology , Applied biochemistry , Applied microbiology , Molecular biology , Functional biochemistry

Research keywords (16)： iCBiofilm , ASEM , E. coli , T8SS , Curli , バイオフィルム , ブドウ球菌 , アミロイド線維 , 細胞分裂 , フォールディング , AAAタンパク質 , 分子シャペロン , Biofilm , Staphylococci , Protein Folding , Molecular Chaperone

Research theme for competitive and other funds (20)：

2024 - 2028 バイオフィルムマトリクス構成分子のムーンライト機能の開拓
2023 - 2026 アミロイドの制御分子から開拓する感染症・神経変性疾患の融合領域研究
2022 - 2024 iBC法を用いたポストコッホ微生物集団の活写
2021 - 2024 バイオフィルムを介した胆管ステント閉塞メカニズムの解明
2020 - 2024 Study on moonlighting functions of extracellular matrix components in biofilm development

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Papers (41)：

Saishu Yoshida, Akira Kawamura, Katsuhiko Aoki, Pattama Wiriyasermkul, Shinya Sugimoto, Junnosuke Tomiyoshi, Ayasa Tajima, Yamato Ishida, Yohei Katoh, Takehiro Tsukada, et al. Positive regulation of Hedgehog signaling via phosphorylation of GLI2/GLI3 by DYRK2 kinase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2024. 121. 28. e2320070121
Tatsuki Kunoh, Tatsuya Yamamoto, Erika Ono, Shinya Sugimoto, Kyosuke Takabe, Minoru Takeda, Andrew S Utada, Nobuhiko Nomura. Identification of lthB, a Gene Encoding a Putative Glycosyltransferase Family 8 Protein Required for Leptothrix Sheath Formation. Applied and environmental microbiology. 2023. 89. 4. e0191922
Shinya Sugimoto, Yuki Kinjo. Instantaneous Clearing of Biofilm (iCBiofilm): an optical approach to revisit bacterial and fungal biofilm imaging. Communications Biology. 2023
Tatsuki Kunoh, Tatsuya Yamamoto, Manoj Prasad, Erika Ono, Xiaojie Li, Shinya Sugimoto, Eiji Iida, Nozomu Obana, Minoru Takeda, Nobuhiko Nomura, et al. Porous Pellicle Formation of a Filamentous Bacterium, Leptothrix. Applied and Environmental Microbiology. 2022
Akio Chiba, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Yuki Kinjo, Yoshimitsu Mizunoe, Shinya Sugimoto. Staphylococcus aureus utilizes environmental RNA as a building material in specific polysaccharide-dependent biofilms. NPJ biofilms and microbiomes. 2022. 8. 1. 17-17

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MISC (75)：

杉本真也, 金城雄樹. バイオフィルム透明化法iCBiofilmの開発と透明化ライブセルイメージングへの応用. 東京慈恵会医科大学雑誌. 2024. 138. 131-138
米本圭吾, 羽山哲生, 原慧一郎, 池上拓, 千葉明生, 杉本真也, 金城雄樹, 斎藤充. インプラント感染症起因菌のバイオフィルム形成の研究. 日本整形外科学会雑誌. 2023. 97. 8. S1630-S1630
小野絵里香, 山本達也, 尾花望, 杉本真也, Utada Andrew S., 久能樹, 野村暢彦. Leptothrix属細菌の網目状ペリクル形成に関与する因子の同定. BACTERIAL ADHERENCE & BIOFILM. 2023. 36. 37-40
杉本真也, 金城雄樹. 視える化で解き明かす微生物学の謎バイオフィルムの透明化ライブセルイメージングを可能にするiCBiofilm法の開発と応用. 日本細菌学雑誌. 2023. 78. 1. 26-26
佐藤主税, 佐藤真理, 納谷昌実, 佐藤啓子, 杉本真也. 視える化で解き明かす微生物学の謎腸内細菌と細菌培養系の親水環境での観察クライオ電顕と水中観察電顕. 日本細菌学雑誌. 2023. 78. 1. 27-27

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Patents (4)：

バイオフィルムの透明化試薬、及び、その透明化試薬を使用するバイオフィルムの観察方法
2020-092630
バイオフィルムの透明化試薬
バイオフィルム抑制及び/又は除去剤

Books (8)：

【微生物の集団性と社会性の創発】バイオフィルムにおける集団性と社会性形成メカニズムと表現型のゆらぎ
(株)エヌ・ティー・エス 2023 ISBN:9784860438210
バイオフィルム革新的制御技術
エヌ・ティー・エス 2023 ISBN:9784860438340
バイオテクノロジーの進化に貢献する光技術〈1〉バイオフィルムを数秒で透明化
2023
Methods for analyses of biofilms
2023
Moonlighting functions of extracellular-matrix components in biofilms
2022

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Lectures and oral presentations (102)：

大腸菌ペリプラズムにおけるアミロイド線維形成タンパク質CsgAの分解機構
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
バイオフィルムを瞬時に透明にするiCBiofilm法の開発と応用
(第72回日本放線菌学会学術講演会 2023)
細胞外アミロイド線維Curliの産生におけるDnaK/Hsp70シャペロンのヌクレオチド交換因子GrpEの必須性の解析
(第106回日本細菌学会関東支部総会 2023)
二次胆汁酸による閉塞胆管ステント由来腸球菌のバイオフィルム形成と凝集の促進
(第140回成医会総会 2023)
バイオフィルムを透視する新技術で微生物のリアルな姿に迫る
(日本科学振興協会(JAAS) 年次大会2023「会いに行ける科学者フェス」 2023)

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Education (3)：

- 2007 Kyushu University
- 2004 Kyushu University
- 2002 Kyushu University

Professional career (1)：

博士(農学) (九州大学)

Work history (9)：

2023/07 - 現在 Jikei University
2017/10 - 現在東京慈恵会医科大学
2017/01 - 2022/03 Japan Science and Technology Agency
2013/05 - 2017/09 Jikei University Faculty of Medicine
2010/04 - 2013/04 Jikei University Faculty of Medicine

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Committee career (3)：

2022/07 - 現在日本バイオフィルム学会広報委員会副委員長
2017/07 - 現在日本バイオフィルム学会広報委員
2015 - 現在日本バイオフィルム学会評議委員

Awards (14)：

2023/10 - 第106回日本細菌学会関東支部優秀学生発表賞細胞外アミロイド線維Curliの産生における分子シャペロンDnaKのヌクレオチド交換因子GrpEの必須性の解析
2023/10 - 第140回成医会総会優秀学生ポスター賞
2020/10 - 第137回成医会優秀発表賞
2019/10 - 第136回成医会優秀発表賞
2018/03 - 第91回日本細菌学会総会優秀ポスター発表賞

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Association Membership(s) (6)：

American Society for Microbiology , 日本バイオフィルム学会 , 日本細菌学会 , 日本分子生物学会 , 日本農芸化学会 , 日本生体防御学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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