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J-GLOBAL ID：200901039103322660
Update date: Dec. 12, 2024
Kodera Yoshio
コデラ ヨシオ | Kodera Yoshio
Affiliation and department：
Job title：
Professor
Other affiliations (1)：
Research field (1)：
Biophysics
Research keywords (8)：
biomarker
, mass spectrometry
, serum
, peptidomics
, peptidome
, proteome
, proteomics
, biophysics
Research theme for competitive and other funds (74)：
- 2024 - 2027 β2-ミクログロブリンを介した滑膜下結合組織線維化機構の解明と治療シーズの探索
- 2023 - 2026 二枚貝の個別複数回採卵による卵質評価方法の確立
- 2022 - 2025 Analyses on the function of Nkg7 in the regulation of lytic granule secretion and biogenesis
- 2022 - 2025 がんの根治を目指したがん幹細胞を対象とした分子標的治療薬開発のための基礎的検討
- 2022 - 2025 Clinical application of a rapid assay for antibacterial susceptibility test of beta-lactams and carbapenems antibacterial agents using MALDI-TOF MS
- 2022 - 2025 稀少臨床検体に注目した膠芽腫播種病態解明のためのマルチオミックス解析
- 2019 - 2022 TDP-43の核移行を制御する一次構造変化と翻訳後修飾の探索
- 2019 - 2022 Clinical application of serotyping of clinical isolates of Legionella pneumophila using MALDI-TOF MS
- 2019 - 2022 LRRK2変異と高脂肪食による糖代謝異常の機序解明:パーキンソン病発症への関与
- 2019 - 2022 Development of new intrathoracic therapies and biomarkers for pleural mesothelioma
- 2018 - 2021 Investigation of bladder cancer-specific protein and its establishment of diagnostic and treatment algorithm
- 2018 - 2021 Identification of disease biomarkers using highly sensitive peptidomics
- 2018 - 2021 A study on the participation of postsynaptic importin in synaptic plasticity.
- 2017 - 2020 Monitoring of brain function using a single blood drop
- 2017 - 2020 超高感度血漿分析技術とin silico 探索法による新規ペプチドホルモンの探索
- 2017 - 2020 Proteomic analysis of the mode of action of antidepressive-like effect of a Kampo (traditional Japanese) medicine "kososan" extract.
- 2017 - 2020 血液一滴による脳の機能状態モニタリング
- 2016 - 2020 臨床質量分析共用プラットフォーム(MS共用PF)
- 2016 - 2019 Clinical application of rapid bacterial identification using mass spectrometry
- 2015 - 2019 Elucidation of the relationship between SNAP-25 phosphorylation and stress disorder
- 2016 - 2018 Establishment of a sandwich ELISA for salusin-beta
- 2015 - 2018 Development of immunocomplex pretreatment method for mass spectrometry (MS, Immuno-MS) which is applicable to clinical testing
- 2014 - 2017 Search for a novel biological regulatory system based on low temperature biology
- 2014 - 2017 Proteomic analysis of bile
- 2014 - 2017 Study of stress-related disorder monitored by plasma proteomics
- 2014 - 2017 Identification of LEFTY as a molecular marker for ovarian clear cell carcinoma: its relationship to apoptosis and cell proliferation
- 2013 - 2017 Constitutive activity of NMDA receptors
- 2017 - 2017 血清・血漿試料の品質評価マーカーの開発と測定法の確立
- 2013 - 2016 Establishment of TDP-43 C-terminal deficient mice using zinc finger nuclease and application to the model for amyotrophic lateral sclerosis
- 2016 - 2016 血清・血漿試料の品質評価マーカーの開発と測定法の確立
- 2013 - 2015 Multidisciplinary modificomics to search for novel and early markers to detect hepatobiliary cancers
- 2012 - 2015 Identification of drug resistance-related proteins in pancreatic cancer by SILAC quantitative proteomic approach.
- 2012 - 2015 Clinical application of rapid bacterial identification using mass spectrometry
- 2012 - 2015 物理学に基盤を置く疾病治療への新規アプローチ技術の開発
- 2012 - 2015 ストレス関連障害の発症機序の解明と、ヒトでの新規診断法や治療法に用いる新規標的物質の開発
- 2011 - 2013 Classification of hematologic malignancy by relationship between cancer and expression of human cellular phosphoprotein.
- 2011 - 2013 Establishment of a strategy for the detection of disease-related modification of proteins in serum
- 2010 - 2012 Biomarker searches and clinical applications of gastrointestinal and hepatobiliary cancers by multidisciplinary approaches
- 2010 - 2012 Proteomic analysis of cyst fluid associated with renal cell carcinoma
- 2010 - 2012 Evaluation of Clathrin Heavy Chain (new tumor marker) for diagnosis in various cancer
- 2010 - 2012 Analysis of hibernation-associated gene regulation in chipmunk
- 2010 - 2012 Establishment and application of the strategies for the discovery of biomarker proteins and peptides including species bound to albumin in serum/plasma
- 2009 - 2011 自己抗体を活用した効率的な特定のがんの総合診断システムの開発
- 2009 - 2011 質量分析計(MS)による多項目同時臨床検査技術の包括的開発に関する調査研究
- 2008 - 2011 Proteomic study of novel biomarkers for bladder cancer
- 2008 - 2011 スピンプローブを用いたESR生体計測技術
- 2008 - 2011 プロテオーム解析により発見された膀胱癌新規腫瘍マーカーの臨床的有用性の検討
- 2010 - 2011 Development of a diagnostic marker and method for pancreatic cancer using secretome and proteome analysis.
- 2009 - 2010 泌尿器系がんの診断用プローブ(オーファン診断薬・治療薬)の開発と臨床応用
- 2009 - 2009 血中ペプチドを対象とした膀胱癌と腎細胞癌の診断法確立
- 2008 - 2009 A searching of novel biomarker in digestive organ cancer serum and the establishment of a practical diagnostic method using unique high-yield peptide-extraction method.
- 2007 - 2009 Development of early diagnostic markers for gastrointestinal and hepatobiliary cancers by multi-strategic proteome analyses
- 2007 - 2009 Proteomics approach to discover biomarker for kidney transplant rejection
- 2008 - 2008 ランダム免疫法による効率的な血清腫瘍マーカーの開発
- 2007 - 2008 Discovery of cancer related marker proteins and antibodies using proteomic approaches and development of detection method
- 2007 - 2008 Development of serum tumor markers by using antibodies generated by Top-Down screening strategy
- 2006 - 2008 Searching for new biomarkers of Renal cell carcinoma based on proteomic approach
- 2007 - 2007 未知修飾蛋白質をも認識可能な癌診断用抗体の迅速・体系的獲得
- 2006 - 2007 独自のペプチド解析技術を用いた消化器癌の新規腫瘍マーカーの開発
- 2006 - 2007 立体構造、修飾、部分分解たんぱく質等をも認識可能な癌特異的抗体の新規高効率作製法の検証
- 2006 - 2007 Development of novel serum peptidomic strategy and its application in the discovery of tumor marker peptides
- 2006 - 2007 臨床検査への実用化を目指した消化器癌の低分子量ペプチド腫瘍マーカーの開発
- 2005 - 2005 低分子量タンパク質の解析技術を用いた消化器癌の早期診断法の開発
- 2004 - 2005 抗体を基盤とした疾患プロテオミクスの展開と疾患診断・治療に最適化した抗体群と抗原群の作出
- 2003 - 2004 Tags for oxidized proteins (TOP) useful for assessing the effect of reactive oxygen species on disease proteomics
- 2002 - 2004 Proteomic Analysis of Androgen-Independent prostate cancer
- 1999 - 2001 Structure-activity relationship of human immunodeficiency virus nucleocapsid protein
- 1999 - 1999 HIVヌクレオキャプシドタンパク質の立体構造・活性相関の解明と機能制御
- 1998 - 1998 タンパク質構造機能相関解明を目的としたタンパク質室温燐光寿命の定量的解析
- 1997 - 1998 The Structure-function Relationships of the Human Immunodeficiency Virus Type-2 (HIV-2) Nucleocapsid protein
- 1997 - 1998 高分解能NMRを用いたタンパク質室温燐光寿命の定量的解析
- 1996 - 1996 高分解能NMRによるHIV-2のヌクレオキャプシドタンパク質の構造活性相関の解明
- 1996 - 1996 HIV-2 NCp8の構造活性相関の解明
- 1994 - 1995 Pulsed ENDOR studies of the local structure and function of water oxidizing system in Photosynthesis.
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Papers (234)：
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Arisa Suto, Takashi Matsui, Yoshio Kodera. Reducing Offsite Modification using 2-mercaptoethanol for Proteome Analysis. 2024
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傍島 健哉, 清水 百梨, 武富 春香, 高野 重紹, 小寺 義男, 大塚 将之, 曽川 一幸. プロテオーム解析による胆管癌の新規診断マーカーの探索. JSBMS Letters. 2024. 49. Suppl. 94-94
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三原田 萌華, 高田 護, 高野 重紹, 小寺 義男, 大塚 将之, 曽川 一幸. プロテオーム解析によるトリプルネガティブ乳癌の新規診断マーカー解析. JSBMS Letters. 2024. 49. Suppl. 101-101
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Taichi Takasawa, Takashi Matsui, Go Watanabe, Yoshio Kodera. Molecular dynamics simulations reveal differences in the conformational stability of FtsZs derived from Staphylococcus aureus and Bacillus subtilis. Scientific Reports. 2024. 14. 16043
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Yusei Okuda, Yuzuru Nakagawa, Takashi Matsui, Ryo Konno, Yusuke Kawashima, Toshiya Sato, Makoto Itakura, Yoshio Kodera. Data for peptidomic analysis of a single mouse hypothalamus. Journal of Proteome Data and Methods. 2024
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MISC (161)：
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高橋悠大, 奥田悠世, 須藤愛莉咲, 麹谷英嗣, 高澤太一, 松井崇, 松井崇, 小寺義男, 小寺義男. Analysis the conformational state of human serum albumin in solution by cross-linking mass spectrometry. 日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集. 2024. 2024 (Web)
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奥田悠世, 中川譲, 溜亜海, 板倉誠, 板倉誠, 松井崇, 松井崇, 小寺義男, 小寺義男. Peptidomics analysis of mouse tissues for the discovery of novel bioactive peptides. 日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集. 2024. 2024 (Web)
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廣川武, 奥田悠世, 須藤愛莉咲, 龍門代里子, 松井崇, 松井崇, 小寺義男, 小寺義男. Establishment of a method for quantitative analysis of the cleavage state of proteins by GeLC-MS/MS. 日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集. 2024. 2024 (Web)
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山本高大, 大城拓未, 高澤太一, 小寺義男, 小寺義男, 松井崇, 松井崇. Analysis of the mechanism of structural transformation of the cell division protein FtsZ. 量子ビームサイエンスフェスタ(Web). 2024. 2023
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SUTO Arisa, KODERA Yoshio, MATSUI Takashi. Development of Highly efficient and specific modification technique for Cys residue. 生物物理(Web). 2023. 63. Supplement 1-2
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Patents (17)：
Books (10)：
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別冊「医学のあゆみ」臨床プロテオミクス
医歯薬学出版株式会社 2015
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医学のあゆみ Vol.251 No.10 「臨床プロテオミクス」
医歯薬出版株式会社 2014
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プロテオミクス辞典
講談社 2013 ISBN:9784061538931
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臨床プロテオミクス -バイオマーカー探索から個別化医療へ
金原出版 2012 ISBN:9784307004701
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実験医学別冊(創薬・タンパク質研究のためのプロテオミクス解析)
羊土社 2010 ISBN:9784758101769
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Lectures and oral presentations (190)：
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血清・血漿検体の品質評価マーカーの開発
(日本プロテオーム学会2017年大会 2017)
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Peptidome Analysis of Human Plasma
(JPrOS 2016 2016)
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様々な前処理技術を用いた血漿プロテオミクス・ペプチドミクス
(第43回 BMSコンファレンス 2016 2016)
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血漿ペプチドミクス
(第64回質量分析総合討論会 オーラルセッション1 2016)
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血液一滴の可能性を拓く -様々なプロテオーム解析技術を用いた血中疾患関連タンパク質・ペプチドの探索-
(第3回新潟大学COI-S 生体液バイオマーカーセンター・セミナー 2016)
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Education (2)：
- - 1993 Kwansei Gakuin University Graduate School, Division of Natural Science 物理学
- - 1988 Kwansei Gakuin University Faculty of Science 物理
Professional career (1)：
Work history (9)：
- 2018/04/01 - 北里大学 理学部物理学科物性物理学講座 教授
- 2008/04 - 2018/03 北里大学 理学部物理学科生物物理学研究室 准教授
- 2006/05/01 - 2015/03/31 千葉大学 医学部附属病院疾患プロテオミクスセンター 客員准教授
- 2009/06/01 - 北里大学 理学部附属疾患プロテオミクスセンター センター長(兼務)
- 2005/04/01 - 2009/05/31 北里大学 理学部附属疾患プロテオミクスセンタープロテオミクス基盤部門 部門長(兼務)
- 1996/04 - 2008/03 北里大学 理学部物理学科生物物理学研究室 専任講師
- 1994/04/01 - 1997/03/31 三菱化学生命科学研究所 客員研究員
- 1994/04/01 - 1996/03/31 北里大学 理学部物理学科生体分子動力学研究室 助手
- 1993/04/01 - 1994/03/31 関西学院大学 理学部 日本学術振興会特別研究員
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Committee career (6)：
Awards (5)：
- 2020 - (日本プロテオーム学会) 日本プロテオーム学会学会賞 「学会賞 血漿ペプチド-ム分析法の開発と新規生理活性ペプチド探索への応用」
- 2015 - (日本電気泳動学会) 日本電気泳動学会学会賞(児玉賞) 「電気泳動を基盤とした体液疾患プロテオーム解析法の開発と応用」
- 2007 - (学校法人北里研究所) 森村豊明会奨励賞 「独自のペプチド分析技術を用いた新規診断マーカー探索法の確立と応用」
- 2003 - (The Fifth International Workshop on Advanced Genome) The Excellent Poster Award
- 1992 - (関西学院大学) 仁田記念賞
Association Membership(s) (5)：
THE MASS SPECTROMETRY SOCIETY OF JAPAN
, 日本生化学会
, 日本プロテオーム学会
, 日本医用マススペクトル学会
, 日本電気泳動学会
