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J-GLOBAL ID:200901047298077862   Update date: Sep. 30, 2024

Shibata Daisuke

シバタ ダイスケ | Shibata Daisuke
Affiliation and department:
Other affiliations (5):
  • Gifu University
  • Osaka Metropolitan University  Graduate School of Agriculture 
  • JST  Center for Research and Development Strategy (CRDS) 
  • Japan Bioindustry Association
  • Kazusa DNA Research Institute
Research field  (4): Applied biochemistry ,  Genomics ,  Molecular biology ,  Environmental agriculture
Research keywords  (8): Green Energy Farm ,  Bioeconomy ,  Genomic fusion ,  Thermal-resistant enzymes ,  Non-targeted metabolite analysis ,  Multiple gene transfer ,  Lipoxygenase ,  Co-production of crops and electricity using solar panels
Research theme for competitive and other funds  (9):
  • 2014 - 2017 Simplification of lignin aromatic composition by bacterial lignan transformation systems
  • 2015 - 2017 波長選択型有機薄膜太陽電池を用いた施設園芸ゼロエネルギーファームの開発
  • 2013 - 2016 New approaches towards high-value added lignin production by the combination of metabolic engineering and organic chemistry
  • 2014 - 2015 What happens when a plant genome meets with other genome?
  • 2009 - 2013 事業名:「エネルギー植物の品種改良に係わる代謝情報と遺伝子発現情報に関する研究開発」
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Papers (267):
  • Koichiro Otake, Kazuto Kugou, Jekson Robertlee, Jun-ichirou Ohzeki, Koei Okazaki, Shigeru Hanano, Seiji Takahashi, Daisuke Shibata, Hiroshi Masumoto. De novo induction of a DNA -histone H3K9 methylation loop on synthetic human repetitive DNA in cultured tobacco cells. The Plant Journal. 2023. 114. 3. 668-682
  • Masaomi Yamamura, Masato Kumatani, Akira Shiraishi, Yu Matsuura, Keisuke Kobayashi, Ayano Suzuki, Atsushi Kawamura, Honoo Satake, Safendrri Komara Ragamustari, Shiro Suzuki, et al. Two O-Methyltransferases from Phylogenetically Unrelated Cow Parsley (Anthriscus sylvestris) and Hinoki-Asunaro (Thujopsis dolabrata var. hondae) as a Signature of Lineage-Specific Evolution in Lignan Biosynthesis. Plant & cell physiology. 2023. 64. 1. 124-147
  • Migiwa Takeda, Seiki Baba, Jiro Okuma, Yoshitsugu Hirose, Asuka Nishimura, Masaki Takata, Kohei Oda, Daisuke Shibata, Takashi Kumasaka, Yasuhiro Kondo. Metagenomic mining and structure-function studies of a hyper-thermostable cellobiohydrolase from hot spring sediment. Communications Biology. 2022. 5. 1
  • Nozomu Sakurai, Shinichi Yamazaki, Kunihiro Suda, Ai Hosoki, Nayumi Akimoto, Haruya Takahashi, Daisuke Shibata, Yuichi Aoki. The Thing Metabolome Repository family (XMRs): comparable untargeted metabolome databases for analyzing sample-specific unknown metabolites. Nucleic Acids Research. 2022. 51. D1. D660-D677
  • Junichirou Ohzeki, Kazuto Kugou, Koichiro Otake, Koei Okazaki, Seiji Takahashi, Daisuke Shibata, Hiroshi Masumoto. Introduction of a long synthetic repetitive DNA sequence into cultured tobacco cells. Plant Biotechnology. 2022. 39. 2. 101-110
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MISC (234):
  • 山崎真一, 櫻井望, 櫻井望, 櫻井望, 須田邦裕, 細木藍, 秋元奈弓, 高橋春弥, 柴田大輔, 青木裕一, et al. Integrated analysis of plant metabolic and genomic information using XMRs. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
  • 櫻井望, 櫻井望, 櫻井望, 山崎真一, 須田邦裕, 細木藍, 秋元奈弓, 高橋春弥, 柴田大輔, 青木裕一, et al. Databases for discovering plant species-specific unknown metabolites. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
  • 高田 理江, 花野 滋, 宮本 託志, 滝澤 理仁, 冨永 逹, 柴田 大輔, 櫻井 望, 平川 英樹, 小林 優. 20 未利用地から農地への転換に伴う土壌微生物群集構造変化の解析(関西支部講演会 2021年度支部講演会). 日本土壌肥料学会講演要旨集. 2022. 68. 201-201
  • 大竹興一郎, 久郷和人, 大関淳一郎, JEKSON Robertlee, 岡崎孝映, 花野滋, 花野滋, 高橋征司, 柴田大輔, 舛本寛. De novo induction of DNA-Histone methylation: Application of human chromatin manipulation system to plant cells. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
  • 毛利 晋輔, 高橋 春弥, 坂井 麻衣子, 脇 尚子, 高橋 慎吾, 相澤 宏一, 菅沼 大行, 荒 武, 真鍋 祐樹, 菅原 達也, et al. メタボロミクスによる代謝物一斉評価系を活用したトマトに含まれるアディポネクチン様活性化合物の探索. 日本栄養・食糧学会大会講演要旨集. 2021. 75回. 134-134
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Patents (1):
  • 転写因子群の根に於ける異所的発現誘導による地上部様器官の形成
Books (26):
  • カーボンニュートラル2050アウトルック
    日本電気協会新聞部 2022 ISBN:9784905217992
  • 植物バイオテクノロジー
    実教出版 2022 ISBN:9784407204599
  • バイオエコノミー時代のバイオテクノロジーの役割
    日本農薬学会誌 2020 年 45 巻 2 号 2020
  • 脱炭素のための持続可能な農業-作物生産と再生可能エネルギー生産の両立-
    生存圏研究 第15号 p. 38-46 (2019) 2019
  • バイオエコノミー社会におけるバイオマス利用の動向
    バイオサイエンスとインダストリー 2019
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Lectures and oral presentations  (130):
  • Japan’s bioeconomy strategy and sustainable agriculture
    (Meeting at Central University of Rajasthan 2024)
  • Expectations and Challenges for Agricultural Solar Power Generation
    (2023)
  • 特別講演「バイオエコノミーが農業に与えるインパクト」
    (2021年度日本土壌肥料学会中部支部例会 中部土壌肥料研究会例会 2021)
  • 脱炭素社会にむけたバイオエコノミーと農業 -再生可能エネルギー生産との両立-
    (神戸大学農学部講演会 2021)
  • 脱炭素化に向けた農林水産業の政策動向 ~農林水産省「みどりの食料システム戦略」~
    (2021)
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Works (1):
  • MassBase
    2008 - 現在
Education (2):
  • 1978 - 1983 Kyoto University Graduate School of Agriculture
  • 1973 - 1977 Kobe University Faculty of Agriculture
Professional career (1):
  • Ph.D. (Agriculture) (Kyoto University)
Work history (51):
  • 2024/04 - 現在 Gifu University
  • 2022/04 - 現在 Osaka Metropolitan University Graduate School of Agriculture
  • 2021/05 - 現在 Japan Science and Technology Agency Center for Research and Development Strategy (CRDS)
  • 2017/10 - 現在 Kyoto University Institute of Advanced Energy
  • 2021/06 - 2025/06 一般財団法人バイオインダストリー協会 参与
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Committee career (23):
  • 2020/05 - 2024/03 国立研究開発法人新エネルギー・産業技術総合開発機構 NEDO技術委員
  • 2017/10 - 2024/03 グリーンエネルギーファーム産学共創パートナーシップ プロデューサー
  • 2023/12 - 岐阜大学 Gifu joint degree symposium 2023 実行委員
  • 2017 - 2023/03 一般財団法人バイオインダストリー協会 バイオインダストリー奨励賞選考副委員長
  • 2020/03 - 2022/02 京都大学生存圏研究所 生存圏フォーラム 会長
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Awards (4):
  • 2016 - 日本農芸化学会の2016年大会トピックス賞 経口投与で抗うつ薬様作用を示す大豆由来ペプチドの腸-脳相関
  • 2014/09 - 京都大学「国民との科学・技術対話」ワーキンググループ 京都大学アカデミックデイ賞 「トマトって、なに?」
  • 2012/07 - 日本植物細胞分子生物学会 学術賞 「植物科学とバイオテクノロジー研究に貢献するリソース基盤整備」
  • 2007 - Award of Excellence for the Best Paper Catalog of Micro-Tom tomato responses to common fungal, bacterial, and viral pathogens Journal of General Plant Pathology 71(1):8-22 (2005)
Association Membership(s) (3):
日本植物細胞分子生物学会 ,  日本植物生理学会 ,  日本農芸化学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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