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J-GLOBAL ID：200901071216606810
Update date: Oct. 22, 2024
Kubo Minoru
クボ ミノル | Kubo Minoru
Affiliation and department：
Job title：
Professor
Other affiliations (1)：
Research field (3)：
Biophysics
, Structural biochemistry
, Biochemistry
Research keywords (6)：
生体系の時間分解計測
, 動的構造生物学
, 振動分光学
, Dynamic structural biology
, Vibrational spectroscopy
, Time-resolved analysis of biomolecular systems
Research theme for competitive and other funds (22)：
- 2024 - 2029 改変タンパク質が生成する新機能の時分割分光計測
- 2022 - 2025 二機能性タンパク質のダイナミックな構造と機能制御
- 2019 - 2024 時間分解構造解析を補完する精密顕微分光計測
- 2019 - 2022 新規時間分解計測手法を用いた呼吸系エネルギー変換機構の解明
- 2019 - 2021 生体触媒の誤作動状態を利用するメタンの直接的メタノール変換
- 2016 - 2021 Dynamic Structural Biology by Integrating Physics, Chemistry, and Computational Science
- 2019 - 2020 新たなる臓器保護剤の開発に向けたATP産生制御の構造生命科学
- 2016 - 2019 Elucidation of Reaction Mechanism of Bili Reductase by Multiple Methods Mainly Neutron Structure Analysis
- 2015 - 2018 Development of a micro-flow time-resolved IR spectrometer for analyzing short-lived reaction intermediates of enzymes
- 2017 - 時分割XFEL結晶構造解析と時分割赤外分光による蛋白質ダイナミクスの解析
- 2015 - 2017 SPring-8オンライン赤外分光光度計の開発とバイオ活性サイトの反応過渡種計測
- 2012 - 2017 無損傷・動的結晶構造解析による生体エネルギー変換過程の可視化
- 2012 - 2016 新規赤外分光法とXFEL結晶構造解析の融合によるタンパク質の動的精密構造解析
- 2012 - 2015 Vibrational coherence investigation of protein fluctuations for dynamic allostery
- 2011 - 2014 Real-time observation of proton-pumping of membrane protein complexes using a novel high-sensitivity IR spectrometer
- 2009 - 2010 Development of highly-sensitive time-resolved IR spectrometer to study the proton-pumping mechanisms of biomolecules
- 2007 - 2007 センサー蛋白質の情報検出・伝達機構に関するフェムト秒分光研究
- 2006 - 2006 時間分解紫外共鳴ラマン分光法の開発とそれを用いたセンサー蛋白質の活性化機構の解明
- 2002 - 2004 受容体タンパク質の活性化に対する振動エネルギー移動の理論的研究
- 2002 - 2003 グルタミン酸受容体の活性化のためのエネルギー移動に関する研究
- 2001 - 2002 グルタミン酸受容体の活性化を促すリガンドの設計
- 2001 - アゴニストから受容体へのエネルギー移動
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Papers (83)：
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Sachiko Yanagisawa, Takuto Kamei, Atsuhiro Shimada, Stephanie Gladyck, Siddhesh Aras, Maik Hüttemann, Lawrence I. Grossman, Minoru Kubo. Resonance Raman spectral analysis of the heme site structure of cytochrome c oxidase with its positive regulator CHCHD2. Journal of Inorganic Biochemistry. 2024. 260. 112673-112673
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Kaho Ueda, Wataru Sato, Sachiko Yanagisawa, Minoru Kubo, Masahiko Hada, Hiroshi Fujii. Resonance Raman study of oxoiron(IV) porphyrin π-cation radical complex: Porphyrin ligand effect on ν(Fe=O) frequency. Journal of Inorganic Biochemistry. 2024. 255. 112544
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Hongjie Li, Yoshiki Nakajima, Eriko Nango, Shigeki Owada, Daichi Yamada, Kana Hashimoto, Fangjia Luo, Rie Tanaka, Fusamichi Akita, Koji Kato, et al. Oxygen-evolving photosystem II structures during S1-S2-S3 transitions. Nature. 2024. 626. 7999. 670-677
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Alexander M. Wolff, Eriko Nango, Iris D. Young, Aaron S. Brewster, Minoru Kubo, Takashi Nomura, Michihiro Sugahara, Shigeki Owada, Benjamin A. Barad, Kazutaka Ito, et al. Mapping protein dynamics at high spatial resolution with temperature-jump X-ray crystallography. Nature Chemistry. 2023. 15. 11. 1549-1558
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Shinya Ariyasu, Kai Yonemura, Chie Kasai, Yuichiro Aiba, Hiroki Onoda, Yuma Shisaka, Hiroshi Sugimoto, Takehiko Tosha, Minoru Kubo, Takashi Kamachi, et al. Catalytic Oxidation of Methane by Wild-Type Cytochrome P450BM3 with Chemically Evolved Decoy Molecules. ACS Catalysis. 2023. 13. 8613-8623
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MISC (13)：
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片山哲郎, 木村哲就, 久保稔. タンパク質微結晶を測定する時間分解顕微分光技術. 生体の科学. 2024. 75. 225-230
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久保稔. SACLA時分割結晶構造解析による動的構造生物学研究~酵素反応の可視化に向けた分子動画~. 放射光. 2020. 33. 266-270
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Eriko Nango, Minoru Kubo, Kensuke Tono, So Iwata. Pump-Probe Time-Resolved Serial Femtosecond Crystallography at SACLA: Current Status and Data Collection Strategies. Applied Sciences. 2019. 9. 24. 5505-5505
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Takehiko TOSHA, Minoru KUBO. Visualization of Enzymatic Reactions Using SACLA. Seibutsu Butsuri. 2019. 59. 4. 205-207
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Kubo, M. Time-resolved, damage-free crystallography of proteins with X-ray free electron lasers. Japanese Journal of Optics (in Japanese). 2018. 47. 431-434
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Books (6)：
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Methods Enzymol. (Vol. 709: Time-Resolved Methods in Structural Biology, Chapter 4) "Time-resolved IR spectroscopy for monitoring protein dynamics in microcrystals"
Elsevier 2024 ISBN:9780443314568
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Ultrafast Electronic and Structural Dynamics (Chapter 15) "Time-resolved studies of protein structural dynamics"
Springer Nature Singapore 2024
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タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングの応用事例(第1章 第6節)『ラマン分光法の構造生物学的利用』
技術情報協会 2023
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ヘムタンパク質の科学(第5章第2節)『反応ダイナミクスの時間分解測定』
(株)エヌ・ティー・エス 2022
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膜タンパク質工学ハンドブック(第1編 第1章)『構造・解析-X線自由電子レーザーによる膜タンパク質の構造解析』
(株)エヌ・ティー・エス 2020
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Education (3)：
- 2000 - 2003 Hokkaido University
- 1998 - 2000 Waseda University Graduate School of Science and Engineering
- 1994 - 1998 Waseda University School of Science and Engineering
Professional career (1)：
- Ph.D. (Hokkaido University)
Work history (12)：
- 2021/04 - 現在 University of Hyogo Graduate School of Science
- 2018/07 - 2021/03 University of Hyogo Graduate School of Life Science
- 2014/04 - 2018/06 理化学研究所 放射光科学総合研究センター 専任研究員
- 2012/10 - 2016/03 JST さきがけ研究員(兼任)
- 2012/10 - 2014/03 理化学研究所 放射光科学総合研究センター 研究員
- 2012/04 - 2012/09 University of Hyogo of Life Science, Graduate School
- 2008/01 - 2012/03 University of Hyogo of Life Science, Graduate School
- 2007/04 - 2007/12 日本学術振興会 海外特別研究員 (ノースイースタン大学 物理学科)
- 2006/10 - 2007/03 ノースイースタン大学 物理学科 博士研究員
- 2004/04 - 2006/09 National Institutes of Natural Sciences
- 2003/04 - 2004/03 日本学術振興会 特別研究員 (PD) (大阪大学 大学院基礎工学研究科)
- 2002/04 - 2003/03 日本学術振興会 特別研究員 (DC2) (北海道大学 大学院理学研究科)
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Committee career (5)：
- 2023/06 - 現在 日本生物物理学会 代議員
- 2022/01 - 現在 日本生物物理学会 ウェブサイト編集委員
- 2019/06 - 2021/06 日本生物物理学会 代議員
- 2020/01 - 2020/12 日本生物物理学会 分野別専門委員(放射光)
- 2017/01 - 2017/12 日本生物物理学会 分野別専門委員(赤外・ラマン)
Awards (3)：
- 2023/07 - 令和5年度兵庫県立大学研究活動教員表彰 優秀研究活動賞
- 2016/10 - 第42回内藤コンファレンス ポスター賞(第45回内藤記念特定研究助成金贈呈)
- 2011/12 - 平成23年度日本分光学会年次講演会 若手講演賞
Association Membership(s) (3)：
The Spectroscopical Society of Japan
, The Biophysical Society of Japan
, 量子生命科学会
