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J-GLOBAL ID:200901099432162669
Update date: Feb. 14, 2024
KUROYANAGI Hidehito
クロヤナギ ヒデヒト | KUROYANAGI Hidehito
Affiliation and department:
Job title:
Professor
Homepage URL (2):
https://biochem.med.u-ryukyu.ac.jp/
,
https://biochem.med.u-ryukyu.ac.jp/en/
Research field (1):
Molecular biology
Research keywords (17):
リボソーム
, 次世代シーケンサー
, 分子遺伝学
, 変異体
, トランスクリプトーム
, 可視化
, モデル生物
, nuclear export
, bioinformatics
, transcriptome
, model organism
, gene expression
, development
, C. elegans
, reporter
, genetics
, alternative splicing
Research theme for competitive and other funds (30):
- 2023 - 2025 Elucidation of pathogenesis mechanisms and exploration of therapeutic strategies using mouse models of dilated cardiomyopathy
- 2020 - 2023 Tissue-specific pre-mRNA processing in living animals
- 2020 - 2023 疾患特異的スプライシングバリアントをターゲットにした乳がん治療・診断法の確立
- 2020 - 2021 Nutrition signals and gene expression networks to launch larval development in nematodes
- 2020 - 2021 Functional Analysis of RBM20 Whose Mutation Causes Dilated Cardiomyopathy
- 2017 - 2019 Transcription-coupled pre-mRNA processing in living animal
- 2017 - 2018 代謝酵素遺伝子ノンコーディングmRNAの食餌による発現制御機構の解明
- 2015 - 2018 Mechanisms of tissue-specific pre-mRNA processing(Fostering Joint International Research)
- 2015 - 2017 転写産物の高精細プロファイリングによる転写と転写後プロセシングの共役機構の解明
- 2014 - 2017 mRNA前駆体の組織特異的転写後プロセシングの制御機構の解明
- 2015 - 2016 転写産物の高精細プロファイリングによる転写と転写後プロセシングの共役機構の解明
- 2015 - 2016 代謝酵素遺伝子ノンコーディングmRNAの食餌による発現制御機構の解明
- 2014 - 2016 Regulation mechanisms for tissue-specific post-transcriptional pre-mRNA processing.
- 2014 - 2015 Alternative splicing regulation of the titin gene in dilated cardiomyopathy.
- 2013 - 2014 転写産物の高精細プロファイリングによる転写と転写後プロセシングの共役機構の解明
- 2012 - 2013 Regulation of pre-mRNA splicing by ribosomal proteins
- 2008 - 2012 Deciphering Splicing Codes for Proteome Diversity.
- 2008 - 2009 選択的スプライシングを受ける遺伝子の探索とシス・エレメントの体系的解析
- 2007 - 2008 Decipher the mechanism to generate proteome diversity with area specificity in mammalian central nervous system
- 2007 - 2008 Elucidation of alternative splicing regulation mechanisms byutilizing in vivo visualization system.
- 2005 - 2005 生体における組織特異的選択的スプライシング制御機構の解明
- 2004 - 2005 新規リン酸化酵素阻害剤によるスプライシング制御とエイズウイルスの複製阻害
- 2004 - 2005 Manipulation of aberrant splicing.
- 2004 - 2004 選択的スプライシングを制御する遺伝子および制御される遺伝子の探索
- 2003 - 2004 Dynamics of Synaptic Proteins in C.elegans
- 2001 - 2002 線虫のシナプス後部タンパク質の動態と機能の解析
- 2001 - 2002 Analyses of Localization and Function of C. elegans Synaptic Proteins
- 1998 - 1998 脳神経系において発現しているチロシンホスファターゼの機能の研究
- 拡張型心筋症の病態形成機構の解明
- mRNA前駆体プロセシングを制御する細胞暗号の解明
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Papers (56):
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Hirotatsu Imai, Daisuke Utsumi, Hidetsugu Torihara, Kenzo Takahashi, Hidehito Kuroyanagi, Akio Yamashita. Simultaneous measurement of nascent transcriptome and translatome using 4-thiouridine metabolic RNA labeling and translating ribosome affinity purification. Nucleic Acids Research. 2023
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Jue Ju, Tomohiko Aoyama, Yuka Yashiro, Seisuke Yamashita, Hidehito Kuroyanagi, Kozo Tomita. Structure of the Caenorhabditis elegans m6A methyltransferase METT10 that regulates SAM homeostasis. Nucleic Acids Research. 2023
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Hirotatsu Imai, Daisuke Utsumi, Hidetsugu Torihara, Kenzo Takahashi, Hidehito Kuroyanagi, Akio Yamashita. Simultaneous measurement of nascent transcriptome and translatome using 4-thiouridine metabolic RNA labeling and translating ribosome affinity purification. 2023
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Tatsuya Fujikawa, Fumihiro Sanada, Yoshiaki Taniyama, Kana Shibata, Naruto Katsuragi, Nobutaka Koibuchi, Kaori Akazawa, Yuko Kanemoto, Hidehito Kuroyanagi, Kenzo Shimazu, et al. Periostin Exon-21 Antibody Neutralization of Triple-Negative Breast Cancer Cell-Derived Periostin Regulates Tumor-Associated Macrophage Polarization and Angiogenesis. Cancers. 2021. 13. 20. 5072-5072
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Tatsuya Fujikawa, Fumihiro Sanada, Yoshiaki Taniyama, Kana Shibata, Naruto Katsuragi, Nobutaka Koibuchi, Kaori Akazawa, Yuko Kanemoto, Hidehito KUROYANAGI, Kenzo Shimazu, et al. Periostin Exon-21 Antibody Neutralization of Triple-Negative Breast Cancer Cell-Derived Periostin Regulates Tumor-Associated Macrophage Polarization and Angiogenesis. Cancers. 2021
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MISC (14):
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Josh Arribere, Hidehito Kuroyanagi, Heather Hundley. mRNA Editing, Processing and Quality Control in Caenorhabditis elegans. Genetics. 2020. 215. 3. 531-568
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Dawn Elizabeth Barnes, Hidehito Kuroyanagi, Kanako Ono, Euiyoung (Tommy) Kwak, Shoichiro Ono. A Novel Alternative Exon of the Caenorhabditis Elegans Lev-11 Tropomyosin Gene is used to Express a Head-Muscle-Specific Isoform. FASEB JOURNAL. 2016. 30
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Dawn Elizabeth Barnes, Hidehito Kuroyanagi, Kanako Ono, Euiyoung (Tommy) Kwak, Shoichiro Ono. A Novel Alternative Exon of the Caenorhabditis Elegans Lev-11 Tropomyosin Gene is used to Express a Head-Muscle-Specific Isoform. FASEB JOURNAL. 2016. 30
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桑迫香奈子, 高橋真梨, 黒柳秀人, 武藤 裕. 組織特異的にスプライシング反応を制御するRBFOXファミリーRNA結合タンパク質およびSUP-12によるRNAの協働的な認識の機構. ライフサイエンス 新着論文レビュー. 2014
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Hidehito Kuroyanagi. Genetic analyses of alternative pre-mRNA processing in C. elegans. GENES & GENETIC SYSTEMS. 2013. 88. 6. 336-336
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Books (5):
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遺伝学の百科事典(仮)
丸善出版株式会社 2020
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遺伝子発現制御機構 -クロマチン,転写制御,エピジェネティクス-
株式会社 東京化学同人 2017 ISBN:9784807909179
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ノンコーディングRNA -RNA分子の全体像を俯瞰する-
株式会社 化学同人 2016 ISBN:9784759817256
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Alternative pre-mRNA Splicing: Theory and Protocols
Wiley-VCH 2012 ISBN:9783527326068
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キーワードで理解する 転写イラストマップ
2004 ISBN:9784897065793
Lectures and oral presentations (38):
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Alternative splicing through m6A modification at a 3' splice site for SAM synthetase homeostasis
(第2回RNAJオンラインミーティング「mRNA/miRNAの代謝」 2020)
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Homeostasis of S-adenosylmethionine (SAM) synthetase genes in C. elegans by alternative pre-mRNA splicing through m6A modification at the 3' spice site
(第42回日本分子生物学会年会 2019)
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Analysis of RBM20 mutations associated with dilated cardiomyopathy
(2019)
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Alternative splicing regulation of the S-adenosylmethionine synthase (sams) genes through adenosine methylation at their 3’ splice sites
(線虫研究の未来を創る会 2019 2019)
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Nascent RNA sequencing reveals pre-mRNA processing dynamics governed by splicing regulators
(線虫研究の未来を創る会 2019 2019)
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Works (4):
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Cytoskeleton. Cover Image, Volume 75, Issue 10
Eichi Watabe, Shoichiro Ono, Hidehito Kuroyanagi 2018 -
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Molecular and Cellular Biology. Cover Image, Volume 28, Issue 14
Hidehito Kuroyanagi, Genta Ohno, Shohei Mitani, Masatoshi Hagiwara 2008 -
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Genes & Development. Cover Image, Volume 22, Issue 3
Ohno G, Hagiwara M, Kuroyanagi H 2008 -
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Nature Methods. Cover Image, Volume 3, Issue 11
Hidehito Kuroyanagi, Tetsuo Kobayashi, Shohei Mitani, Masatoshi Hagiwara 2006 -
Education (2):
- 1994 - 1999 The University of Tokyo Graduate School, Division of Science
- 1989 - 1994 The University of Tokyo Faculty of Science
Professional career (1):
- Dr. Sci (The University of Tokyo)
Work history (11):
- 2021/05/01 - 現在 Tokyo Medical and Dental University Graduate School of Medical and Dental Sciences Medical and Dental Sciences - - Visiting Lecturer
- 2012/04/01 - 2021/03/31 Tokyo Medical and Dental University Medical Research Institute Medical Genomics Associate Professor
- 2020/08 - 2021/03 Tokyo Medical and Dental University Medical Hospital
- 2019/10 - 2021/03 Tokyo Medical and Dental University -
- 2017/03/01 - 2018/07/31 University of California, Los Angeles (UCLA) Department of Microbiology, Immunology and Molecular Genetics (MIMG) Visiting Associate Professor
- 2008/10/01 - 2012/03/31 科学技術振興機構 さきがけ「RNAと生体機能」 さきがけ研究者(兼任)
- 2008/04/01 - 2012/03/31 Tokyo Medical and Dental University Biomedical Science PhD Program / Graduate School of Biomedical Science Associate Professor
- 2003/09/01 - 2008/03/31 Tokyo Medical and Dental University Biomedical Science PhD Program / Graduate School of Biomedical Science Junior Associate Professor
- 2000/04/01 - 2003/08/31 Tokyo Medical and Dental University Graduate School of Medical and Dental Sciences
- 1999/04/01 - 2000/03/31 山之内製薬株式会社 創薬研究本部 分子医学研究所 博士研究員
- 1997/04/01 - 1999/03/31 日本学術振興会 特別研究員
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Committee career (8):
- 2020/04 - 2022/03 日本RNA学会 第11期評議員
- 2018/04 - 2020/03 日本RNA学会 第10期評議員
- 2017/12 - 2018/11 独立行政法人日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
- 2016/04 - 2018/03 日本RNA学会 第9期評議員
- 2012/08 - 2017/03 文部科学省科学技術政策研究所科学技術動向研究センター 専門調査員
- 2014/04 - 2016/03 日本RNA学会 第8期庶務幹事
- 2014/12 - 2015/11 独立行政法人日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
- 2013/12 - 2014/11 独立行政法人日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
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Awards (4):
- 2014/10 - 東京医科歯科大学 東京医科歯科大学優秀研究賞
- 2009/04 - 文部科学大臣 平成21年度科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞 生体内可視化技術の開発によるスプライシング暗号の研究
- 2008/02 - 東京医科歯科大学難治疾患研究所 2007年難治疾患研究所優秀論文賞
- 2007/02 - 東京医科歯科大学難治疾患研究所 2006年難治疾患研究所優秀論文賞
Association Membership(s) (6):
日本分子生物学会
, 日本神経科学学会
, 日本RNA学会
, 日本ケミカルバイオロジー学会
, Genetics Society of America
, The RNA Society
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