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J-GLOBAL ID：201101025093291181   Update date: Mar. 12, 2024

Ito Satoshi

イトウ サトシ | Ito Satoshi
Research field  (5)： Systems genomics ,  Fluid engineering ,  Information networks ,  Computer systems ,  Software
Research keywords  (5)： Bioinformatics ,  HPC ,  CFD ,  並列計算 ,  有限要素法
Research theme for competitive and other funds  (2)：
  • 2021 - 2023 GPUを用いたオミックスデータの高速解析基盤開発
  • アプリケーションミドルウェアの開発
Papers (21)：
  • Satoshi Ito, Kenji Ono, Satoru Miyano. Large-scaleWGS Analysis on the supercomputer Fugaku. Proceedings of the 2024 14th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics. 2024
  • Satoshi Ito, Satoru Miyano, Kenji Ono. Acceleration of BAM I/O on distributed file systems. 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). 2023. 3299-3304
  • Masahiro Kanai, Shea J. Andrews, Mattia Cordioli, Christine Stevens, Benjamin M. Neale, Mark Daly, Andrea Ganna, Gita A. Pathak, Akiko Iwasaki, Juha Karjalainen, et al. A second update on mapping the human genetic architecture of COVID-19. Nature. 2023. 621. 7977. E7-E26
  • Qingbo S Wang, Ryuya Edahiro, Ho Namkoong, Takanori Hasegawa, Yuya Shirai, Kyuto Sonehara, Hiromu Tanaka, Ho Lee, Ryunosuke Saiki, Takayoshi Hyugaji, et al. The whole blood transcriptional regulation landscape in 465 COVID-19 infected samples from Japan COVID-19 Task Force. Nature communications. 2022. 13. 1. 4830-4830
  • Ho Namkoong, Ryuya Edahiro, Tomomi Takano, Hiroshi Nishihara, Yuya Shirai, Kyuto Sonehara, Hiromu Tanaka, Shuhei Azekawa, Yohei Mikami, Ho Lee, et al. DOCK2 is involved in the host genetics and biology of severe COVID-19. Nature. 2022. 609. 7928. 754-760
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MISC (3)：
Books (2)：
  • メディカル・サイエンス・ダイジェスト 2022年8月臨時増刊号 ビッグデータ解析に基づくがんの統合的理解と治療戦略
    ニュー・サイエンス社 2022
  • 並列有限要素解析〈2〉並列構造解析ソフトウェアFrontSTRを使いこなす
    培風館 2008 ISBN:4563067393
Lectures and oral presentations  (30)：
  • ヒト全ゲノム解析プログラムGenomonのスーパーコンピュータ「富岳」向け最適化と性能評価
    (情報処理学会研究報告(Web) 2021)
  • DNAアライメントプログラムBWA-MEMのArm SVE移植と「富岳」試作機での性能評価
    (情報処理学会研究報告(Web) 2020)
  • Introduction of HPC studies in Bioinformatics
    (2019)
  • ペタフロップス級スパコンのススメ-GFKの京コンピュータへの移植を例に-
    (日本生化学会大会(Web) 2015)
  • 陽解法カーネルのための自動チューニング記述言語ppOpen-ATの新機能について
    (計算工学講演会論文集(CD-ROM) 2013)
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Awards (1)：
  • 2002 - 日本機械学会 計算力学部門 学生優秀講演表彰
Association Membership(s) (2)：
情報処理学会 ,  日本機械学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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