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J-GLOBAL ID:201301002181466018   Update date: Nov. 11, 2024

Yuu Hirose

ヒロセ | Yuu Hirose
Affiliation and department:
Job title: Associate Professor
Homepage URL  (1): http://www.tut.ac.jp/university/faculty/ens/703.html
Research field  (5): Biophysics ,  Ecology and environmental science ,  Plants: molecular biology and physiology ,  Systems genomics ,  Genomics
Research keywords  (13): Microbiology ,  Genome resequencing ,  Amplicon sequencing ,  Genome analysis ,  Transcriptome ,  Next Generation Sequencer ,  algae ,  Chromatic acclimation ,  Phycobilisome ,  Photoreceptor ,  Photosynthesis ,  Cyanobacteria ,  Photoresponse
Research theme for competitive and other funds  (11):
  • 2023 - 2028 Photosynthesis ubiquity: Supramolecular complexes and their regulations to enable ph otosynthesis all around the globe
  • 2023 - 2028 制御系の進化から解き明かす始原的光合成超分子の環境適応原理
  • 2022 - 2025 シアノバクテリア光センサーのプロトン化状態の解明に資する構造基盤
  • 2019 - 2022 Analysis of diverse structural changes in the phycobilisome during chromatic acclimation
  • 2015 - 2020 Plankton in polar regions-toward an understanding of their characteristics
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Papers (84):
  • Takayuki Nagae, Mitsuhiro Takeda, Tomoyasu Noji, Keisuke Saito, Hiroshi Aoyama, Yohei Miyanoiri, Yutaka Ito, Masatsune Kainosho, Yuu Hirose, Hiroshi Ishikita, et al. Direct evidence for a deprotonated lysine serving as a H-bond “acceptor” in a photoreceptor protein. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2024. 121. 36
  • Takanari Kamo, Takaaki Matsushita, Masako Hamada, Tomotsumi Fujisawa, Toshihiko Eki, Masashi Unno, Yuu Hirose. Probing Bilin-Protein Interaction in the Protochromic Photocycle of Cyanobacteriochrome RcaE by Site-Directed Mutagenesis. Plant And Cell Physiology. 2024. pcae085
  • Kyosuke Nishino, Hiromitsu Inoue, Yuu Hirose, Atsushi Nakabachi. Microbiome of psyllids of the family Aphalaridae, including Aphalara itadori, a biocontrol agent against Reynoutria spp. Entomologia Experimentalis et Applicata. 2024
  • Takayuki Nagae, Yuya Fujita, Tatsuya Tsuchida, Takanari Kamo, Ryoka Seto, Masako Hamada, Hiroshi Aoyama, Ayana Sato-Tomita, Tomotsumi Fujisawa, Toshihiko Eki, et al. Green/red light-sensing mechanism in the chromatic acclimation photosensor. Science Advances. 2024. 10. 24
  • Kosuke Yamamoto, Shintaro Tochikawa, Yuuki Miura, Shogo Matsunobu, Yuu Hirose, Toshihiko Eki. Sensing chemical-induced DNA damage using CRISPR/Cas9-mediated gene-deletion yeast-reporter strains. Applied Microbiology and Biotechnology. 2024. 108. 1. 188
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MISC (51):
  • 広瀬 侑. IPTG は安いグレードでも大丈夫?. 日本ゲノム微生物学会ニュースレター. 2023. 26. 22-22
  • 飯塚佑介, 永江峰幸, 青山洋史, 伊集院良祐, 伊藤隆, 広瀬侑, 三島正規. シアノバクテリアの光センサーのX線結晶構造解析と,NMRによるプロトン化状態の解析. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2022. 22nd (Web)
  • 三島正規, 永江峰幸, 小泉太貴, 青山洋史, 伊集院良祐, 伊藤隆, 広瀬侑. 15N NMR studies on the protonation state of the cyanobacterial photoreceptor protein. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
  • 飯塚佑介, 永江峰幸, 青山洋史, 伊集院良祐, 伊藤隆, 広瀬侑, 三島正規. Analyses of protonation state of chromophore of the cyanobacterial photoreceptor protein. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
  • 広瀬侑, 大坪嘉行, 三澤直美, 米川千夏, 長尾信義, 志村遥平, 藤澤貴智, 兼崎友, 加藤浩, 片山光徳, et al. NIESコレクションのシアノバクテリアのゲノム解析. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2022. 16th (Web)
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Books (3):
  • 光合成研究と産業応用最前線
    NTS出版 2014 ISBN:9784860434120
  • 藻類オイル生産技術研究の最前線
    NTS出版 2013 ISBN:9784864690850
  • 光合成研究法
    北海道大学低温科学研究所 2009
Lectures and oral presentations  (96):
  • Principle and diversity of the chromatic acclimation in Cyanobacteria
    (The 9th Asian Pacific Phycological Forum (APPF2024) 2024)
  • 船底防汚塗料の新しい評価法の確立
    (2024)
  • シアノバクテリアの光受容体研究の進展
    (第18回日本ゲノム微生物学会年会 2024)
  • 微細藻類の陸上養殖による有用物質生産の実用化
    (異分野融合学会豊橋フォーラム2023 2023)
  • シアノバクテリアが光の色を見分ける仕組み
    (日本農芸化学会中部支部第197回例会 2023)
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Education (3):
  • 2008 - 2011 The University of Tokyo Graduate School of Science Department of Biological Sciences
  • 2006 - 2008 The University of Tokyo Graduate School of Arts and Sciences Multi-Disciplinary Sciences Life Sciences
  • 2002 - 2006 Hokkaido University Faculty of Agriculture Department of Bioscience and Chemistry
Professional career (1):
  • 博士(理学) (東京大学)
Work history (8):
  • 2024/02 - 現在 合同会社サイナルジ 代表
  • 2022/04 - 現在 Toyohashi University of Technology Graduate School of Engineering Department of Applied Chemistry an Life Science
  • 2019/04 - 2022/03 Toyohashi University of Technology Graduate School of Engineering Department of Applied Chemistry an Life Science
  • 2013/12 - 2019/03 Toyohashi University of Technology
  • 2011/10 - 2013/11 Toyohashi University of Technology Electronics-Inspired Interdisciplinary Research Institute(
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Committee career (4):
  • 2024/04 - 現在 豊橋技術科学大学 TUT Research編集委員
  • 2024/04 - 現在 日本光合成学会 ホームページ担当委員
  • 2017 - 現在 日本ゲノム微生物学会 ニュースレター編集委員
  • 2014 - 2022 日本ゲノム微生物学会若手の会 世話人
Awards (7):
  • 2022/03 - 豊橋技術科学大学 研究活動表彰若手賞
  • 2016/04 - 文部科学省 文部科学大臣表彰 若手科学者賞
  • 2016/03 - 日本ゲノム微生物学会 若手賞
  • 2011/05 - 日本光合成学会 優秀発表賞
  • 2011/03 - 東京大学大学院理学系研究科 研究奨励賞
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Association Membership(s) (6):
日本植物学会 ,  THE JAPANESE SOCIETY OF MICROBIAL ECOLOGY ,  THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN ,  Society of Genome Microbiology, Japan ,  THE JAPANESE SOCIETY OF PHOTOSYNTHESIS RESEARCH ,  THE JAPANESE SOCIETY OF PLANT PHYSIOLOGISTS
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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