Rchr
J-GLOBAL ID:201401007076551297
Update date: Oct. 01, 2024
Takumi Ueda
ウエダ タクミ | Takumi Ueda
Affiliation and department:
Job title:
Professor
Homepage URL (1):
http://kaken.nii.ac.jp/d/r/20451859.ja.html
Research field (1):
Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry
Research keywords (28):
NMR
, 膜タンパク質
, 転移交差飽和法
, タンパク質-タンパク質相互作用
, 構造生物学
, 光合成明反応
, photosynthesis
, CCR1
, オピオイド受容体
, 生化学
, アドレナリン受容体
, 交差飽和法
, 電子移動反応
, フェレドキシン
, Membrane protein
, ケモカイン受容体
, protein-protein interaction
, electron transfer
, 過渡的相互作用
, マルチドメイン蛋白質
, 膜蛋白質
, GPCR
, Segmental labeling
, 核磁気共鳴法
, transferred cross saturation
, 循環的電子伝達
, 光化学系I
, Protein Trans-Splicing
Research theme for competitive and other funds (16):
- 2024 - 2028 Protein Backbone Cyclization and Application to Precise Solution Structure Analysis
- 2021 - 2023 薬物とGPCRの弱い相互作用が滞在時間に応じて生体応答を制御する機構の解明
- 2020 - 2023 核磁気共鳴法によるG蛋白質共役型受容体の活性制御機構の解明
- 2017 - 2022 in situ functional analyses of membrane proteins by NMR
- 2019 - 2021 動的構造平衡情報に基づく数理解析によるGPCRのシグナル制御機構の解明
- 2018 - 2020 核磁気共鳴法による分子夾雑系膜環境におけるG蛋白質共役型受容体の機能解明
- 2016 - 2019 Development of methods for studying conformational dynamics of ubiquitin-ubiquitin binding protein complex
- 2016 - 2018 高次元NMRデータ解析法の開発およびGPCRの機能解明への応用
- 2014 - 2016 スパース性を使った新規多次元NMRスペクトル再構成法の開発とGPCR研究への応用
- 2013 - 2015 Structural elucidation of the mechanism underlying biased signaling of GPCRs
- 2009 - 2014 Structural analyses of the metastable ligand-receptor interactions
- 2013 - 2014 医学上重要なGPCRのシグナル制御機構の構造生物学的解明
- 2011 - 2012 GPCRのシグナル伝達機構の構造生物学的解明
- 2011 - 2012 Structural elucidation of the sequential signal transduction mechanism in two-component system
- 2008 - 2009 Structural elucidation of the efficient electron transport between photosynthetic membrane proteins and electron carrier
- 2007 - 2008 NMRを用いたフェレドキシン-キノン還元酵素の機能解明
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Papers (48):
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Yuko Otani, Asami Ichinose, Xihong Wang, Zhihan Huang, Akitomo Kasahara, Mayumi Ishii, Eri Watanabe, Kayoko Kanamitsu, Kempei Tai, Hiroyuki Kusuhara, et al. An N-ortho-nitrobenzylated benzanilide amino acid enables control of the conformation and membrane permeability of cyclic peptides. Chemical communications (Cambridge, England). 2024. 60. 69. 9242-9245
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Koh Takeuchi, Takumi Ueda, Misaki Imai, Miwa Fujisaki, Mie Shimura, Yuji Tokunaga, Yutaka Kofuku, Ichio Shimada. Affinity-directed substrate/H+-antiport by a MATE transporter. Structure (London, England : 1993). 2024. 32. 8. 1150-1164
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Marin Yokomine, Jumpei Morimoto, Yasuhiro Fukuda, Takumi Ueda, Koh Takeuchi, Koji Umezawa, Hideo Ago, Hiroaki Matsuura, Go Ueno, Akinobu Senoo, et al. A High-Resolution Structural Characterization and Physicochemical Study of How a Peptoid Binds to an Oncoprotein MDM2. Chemical Science. 2024. 15. 19. 7051-7060
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Wenchao Zhu, Shiori Takeuchi, Shosei Imai, Tohru Terada, Takumi Ueda, Yusuke Nasu, Takuya Terai, Robert E Campbell. Author Correction: Chemigenetic indicators based on synthetic chelators and green fluorescent protein. Nature chemical biology. 2023. 19. 6. 790-790
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Jumpei Morimoto, Yota Shiratori, Marin Yokomine, Takumi Ueda, Takayuki Nakamuro, Kiyofumi Takaba, Saori Maki-Yonekura, Koji Umezawa, Koichiro Miyanishi, Yasuhiro Fukuda, et al. Bottom-up design of peptide nanoshapes in water using oligomers of N-methyl-L/D-alanine. 2023
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MISC (103):
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上田 卓見, 幸福 裕, 竹内 恒, 今井 駿輔, 白石 勇太郎, 嶋田 一夫. 溶液NMR法によるGPCRの活性と直結する動的構造平衡の解明-Function-Related Conformational Dynamics of GPCRs Revealed by Solution NMR-ミニ特集 生理学的環境での生体高分子の挙動の観察可能性の追求. 日本結晶学会誌 = Journal of the Crystallographic Society of Japan. 2022. 64. 4. 279-284
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幸福 裕, 今井 駿輔, 上田 卓見, 嶋田 一夫. GPCRのNMR・ESR解析-Dynamics of GPCR revealed by NMR/ESR-特集 Gタンパク質共役型受容体(GPCR)の新展開. 細胞. 2021. 53. 5. 280-284
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白石 勇太郎, 夏目 芽依, 幸福 裕, 今井 駿輔, 中田 國夫, 水越 利巳, 上田 卓見, 岩井 秀夫, 嶋田 一夫. 健康・医療・創薬に貢献する物理系薬学研究の最前線 Gタンパク質共役型受容体のシグナル伝達制御機構の解明. 日本薬学会年会要旨集. 2019. 139年会. 1. 136-136
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上田 卓見, 幸福 裕, 嶋田 一夫. NMR法による脂質がGPCRの活性を制御する機構の解明. Annual report = 低温科学研究センター年報 / 低温科学研究センター編集委員会 編. 2019. 11. 17-22
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上田 卓見, 嶋田 一夫. NMR 解析の最前線:分子間相互作用と動的構造. 月刊細胞. 2019. 51. 596-599
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Professional career (1):
Work history (2):
- 2019/05 - 現在 Graduate School of Pharmaceutical Sciences, The University of Tokyo Division of Physical Chemistry Associate Professor
- 2007/01 - 2019/04 The University of Tokyo
Association Membership(s) (4):
THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN
, THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
, THE NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SOCIETY OF JAPAN
, 日本蛋白質科学会
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