Takumi Ueda

ウエダタクミ | Takumi Ueda

Affiliation and department：
Job title： Professor
Homepage URL (1)： http://kaken.nii.ac.jp/d/r/20451859.ja.html

Research field (1)： Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry

Research keywords (28)： NMR , 膜タンパク質 , 転移交差飽和法 , タンパク質-タンパク質相互作用 , 構造生物学 , 光合成明反応 , photosynthesis , CCR1 , オピオイド受容体 , 生化学 , アドレナリン受容体 , 交差飽和法 , 電子移動反応 , フェレドキシン , Membrane protein , ケモカイン受容体 , protein-protein interaction , electron transfer , 過渡的相互作用 , マルチドメイン蛋白質 , 膜蛋白質 , GPCR , Segmental labeling , 核磁気共鳴法 , transferred cross saturation , 循環的電子伝達 , 光化学系I , Protein Trans-Splicing

Research theme for competitive and other funds (15)：

2021 - 2023 薬物とGPCRの弱い相互作用が滞在時間に応じて生体応答を制御する機構の解明
2020 - 2023 核磁気共鳴法によるG蛋白質共役型受容体の活性制御機構の解明
2017 - 2022 in situ functional analyses of membrane proteins by NMR
2019 - 2021 動的構造平衡情報に基づく数理解析によるGPCRのシグナル制御機構の解明
2018 - 2020 核磁気共鳴法による分子夾雑系膜環境におけるG蛋白質共役型受容体の機能解明

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Papers (49)：

Marin Yokomine, Jumpei Morimoto, Yasuhiro Fukuda, Takumi Ueda, Koh Takeuchi, Koji Umezawa, Hideo Ago, Hiroaki Matsuura, Go Ueno, Akinobu Senoo, et al. A High-Resolution Structural Characterization and Physicochemical Study of How a Peptoid Binds to an Oncoprotein MDM2. Chemical Science. 2024
Jumpei Morimoto, Yota Shiratori, Marin Yokomine, Takumi Ueda, Takayuki Nakamuro, Kiyofumi Takaba, Saori Maki-Yonekura, Koji Umezawa, Koichiro Miyanishi, Yasuhiro Fukuda, et al. Bottom-up design of peptide nanoshapes in water using oligomers of N-methyl-L/D-alanine. 2023
Yuki Hosono, Satoshi Uchida, Moe Shinkai, Chad E Townsend, Colin N Kelly, Matthew R Naylor, Hsiau-Wei Lee, Kayoko Kanamitsu, Mayumi Ishii, Ryosuke Ueki, et al. Amide-to-ester substitution as a stable alternative to N-methylation for increasing membrane permeability in cyclic peptides. Nature communications. 2023. 14. 1. 1416-1416
Jungyeon Kim, Hiroka Kobayashi, Marin Yokomine, Yota Shiratori, Takumi Ueda, Koh Takeuchi, Koji Umezawa, Daisuke Kuroda, Kouhei Tsumoto, Jumpei Morimoto, et al. Residue-based program of a β-peptoid twisted strand shape via a cyclopentane constraint. Organic & biomolecular chemistry. 2022
Yoshimitsu Itoh, Shuo Chen, Ryota Hirahara, Takeshi Konda, Tsubasa Aoki, Takumi Ueda, Ichio Shimada, James J Cannon, Cheng Shao, Junichiro Shiomi, et al. Ultrafast water permeation through nanochannels with a densely fluorous interior surface. Science (New York, N.Y.). 2022. 376. 6594. 738-743

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MISC (103)：

上田卓見, 幸福裕, 竹内恒, 今井駿輔, 白石勇太郎, 嶋田一夫. 溶液NMR法によるGPCRの活性と直結する動的構造平衡の解明-Function-Related Conformational Dynamics of GPCRs Revealed by Solution NMR-ミニ特集生理学的環境での生体高分子の挙動の観察可能性の追求. 日本結晶学会誌 = Journal of the Crystallographic Society of Japan. 2022. 64. 4. 279-284
幸福裕, 今井駿輔, 上田卓見, 嶋田一夫. GPCRのNMR・ESR解析-Dynamics of GPCR revealed by NMR/ESR-特集 Gタンパク質共役型受容体(GPCR)の新展開. 細胞. 2021. 53. 5. 280-284
白石勇太郎, 夏目芽依, 幸福裕, 今井駿輔, 中田國夫, 水越利巳, 上田卓見, 岩井秀夫, 嶋田一夫. 健康・医療・創薬に貢献する物理系薬学研究の最前線 Gタンパク質共役型受容体のシグナル伝達制御機構の解明. 日本薬学会年会要旨集. 2019. 139年会. 1. 136-136
上田卓見, 幸福裕, 嶋田一夫. NMR法による脂質がGPCRの活性を制御する機構の解明. Annual report = 低温科学研究センター年報 / 低温科学研究センター編集委員会編. 2019. 11. 17-22
上田卓見, 嶋田一夫. NMR 解析の最前線:分子間相互作用と動的構造. 月刊細胞. 2019. 51. 596-599

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Professional career (1)：

薬学博士 (東京大学大学院薬学系研究科)

Work history (2)：

2019/05 - 現在 Graduate School of Pharmaceutical Sciences, The University of Tokyo Division of Physical Chemistry Associate Professor
2007/01 - 2019/04 The University of Tokyo

Association Membership(s) (4)：

THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN , THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN , THE NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SOCIETY OF JAPAN , 日本蛋白質科学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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