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J-GLOBAL ID：201401052506561394   Update date: Nov. 19, 2024

Seno Shigeto

セノオ シゲト | Seno Shigeto
Affiliation and department：
Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering

About Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering


Homepage URL  (1)： http://www.ist.osaka-u.ac.jp/japanese/introduction/professors/bioinformatic-engineering/genome-information-engineering/shigeto-seno.html
Research field  (2)： Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics
Research keywords  (9)： 発現プロファイル ,  バイオインフォマティクス ,  類似構造探索 ,  遺伝子発現解析 ,  ゲノム ,  生物情報学 ,  トランスクリプトーム解析 ,  生体イメージング ,  細胞トラッキング
Research theme for competitive and other funds  (24)：
  • 2022 - 2025 細胞動画像とオミクスデータの統合による細胞コミュニティの解析手法の開発
  • 2022 - 2025 Establishment of intraoperative surgical margin assessment using human live tissue in breast conserving surgery
  • 2022 - 2025 時空間情報を統合した1細胞発現解析手法の開発
  • 2022 - 2025 骨イメージングではじめる動的多細胞コミュニティ学
  • 2022 - 2024 The study on the brown adipose tissue-derived novel factors which are related to the regulation of muscle regeneration
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Papers (133)：
  • Yu Yamaoka, Weng Ian Chan, Shigeto Seno, Kanako Iwamori, So-ichiro Fukada, Hideo Matsuda. Quantifying the recovery process of skeletal muscle on hematoxylin and eosin stained images via learning from label proportion. Scientific Reports. 2024. 14. 1
  • Kazufumi Hosoda, Keigo Nishida, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Hideki Kashioka, Izumi Ohzawa. A single fast Hebbian-like process enabling one-shot class addition in deep neural networks without backbone modification. Frontiers in Neuroscience. 2024. 18
  • Yu Miyamoto, Junichi Kikuta, Takahiro Matsui, Tetsuo Hasegawa, Kentaro Fujii, Daisuke Okuzaki, Yu-chen Liu, Takuya Yoshioka, Shigeto Seno, Daisuke Motooka, et al. Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation. Nature. 2024
  • Lidan Zhang, Hayato Saito, Tatsuyoshi Higashimoto, Takayuki Kaji, Ayasa Nakamura, Kanako Iwamori, Ryoko Nagano, Daisuke Motooka, Daisuke Okuzaki, Akiyoshi Uezumi, et al. Regulation of muscle hypertrophy through granulin: Relayed communication among mesenchymal progenitors, macrophages, and satellite cells. Cell Reports. 2024. 43. 4
  • Jotaro Tachino, Yuki Togami, Hisatake Matsumoto, Tsunehiro Matsubara, Shigeto Seno, Hiroshi Ogura, Jun Oda. Plasma Proteomics Profile-Based Comparison of Torso Versus Brain Injury: A Prospective Cohort Study. The journal of trauma and acute care surgery. 2024
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MISC (23)：
  • 舘野丈太郎, 松本寿健, 瀬尾茂人, 北村哲久, 片山祐介, 小倉裕司, 織田順. 外傷におけるフェノタイプ分類の開発と応用. 日本集中治療医学会学術集会(Web). 2024. 51st
  • 舘野丈太郎, 瀬尾茂人, 松本寿健, 平山敦士, 北村哲久, 中尾俊一郎, 片山祐介, 小倉裕司, 織田順. 外傷フェノタイプに基づくトラネキサム酸の治療効果推定(日本国内多施設コホート研究). 日本集中治療医学会学術集会(Web). 2024. 51st
  • 舘野 丈太郎, 松本 寿健, 戸上 由貴, 松原 庸博, 瀬尾 茂人, 小倉 裕司, 織田 順. 血漿プロテオミクスプロファイルによる体幹部外傷と外傷性脳損傷の比較 前向きコホート研究. 日本救急医学会雑誌. 2023. 34. 12. 641-641
  • 川原崎 聡子, 瀬尾 茂人, 鄭 惠芬, 高橋 春弥, 野村 亘, 神戸 大朋, 松田 秀雄, 井上 和生, 河田 照雄, 後藤 剛. レポーター前駆脂肪細胞株を用いた新規UCP1発現調節遺伝子の探索. 肥満研究. 2022. 27. Suppl. 338-338
  • 藤原奈央子, 藤田賢一, 藤田賢一, 瀬尾茂人, 増田誠司, 増田誠司. Activity and substrate preference of the human nuclear exosome complex is modulated via association with specific cofactors. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2022. 2022
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Patents (2)：
  • 評価方法、評価装置およびプログラム
  • マルチプレックス大腸がんマーカーパネル
Books (3)：
  • 実験医学2024年9,10,11月号
    羊土社 2024
  • 医学のあゆみ 生体イメージングの最前線-絶え間ない技術革新と生命医科学の新展開
    医歯薬出版 2023
  • 骨格筋の維持機構を暴き、サルコペニアに挑む!
    羊土社 2020
Lectures and oral presentations  (202)：
  • AI時代のデータ解析プログラミング
    (NGS EXPO 2024 2024)
  • シングルセルデータ解析における前処理について
    (NGS EXPO 2023 2023)
  • 細胞動画像とオミクスデータの統合的情報解析方法の開発への取り組み
    (第46回 日本基礎老化学会大会 2023)
  • バイオインフォマティクスツールのエコシステム
    (NGS EXPO 2022 2022)
  • 細胞動画像とオミクスデータの統合による細胞コミュニティの解析手法の開発
    (学術変革(B)「セルコミュニティ」キックオフミーティング 2022)
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Education (3)：
  • 2003 - 2006 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering
  • 2001 - 2003 Osaka University Graduate School of Engineering Science
  • 1997 - 2001 Osaka University School of Engineering Science Direct Affiliates Department of Information and Computer Sciences
Professional career (1)：
  • 博士(情報科学) (大阪大学)
Work history (8)：
  • 2023/07 - 現在 大阪大学蛋白質研究所 蛋白質先端データ科学研究センター(兼任)
  • 2023/07 - 現在 大阪大学微生物病研究所 バイオインフォマティクスセンター(兼任)
  • 2023/04 - 現在 脳情報通信融合研究センター(兼任)
  • 2018/04 - 現在 大阪大学データビリティフロンティア機構(兼任)
  • 2017/11 - 現在 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology
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Committee career (12)：
  • 2024/04 - 現在 情報処理学会, バイオ情報学(BIO)研究会 運営委員
  • 2024/04 - 現在 情報処理学会, 数理モデル化と問題解決(MPS)研究会 編集委員
  • 2022/03 - 現在 NGS EXPO ファシリテーター
  • 2020 - 現在 ICBBE Technical Program Comittee
  • 2014/07 - 現在 Mathematical Modeling and Problem Solving”Satellite Workshop; International Conference on Parallel & Distributed Processing Techniques & Applications プログラム委員
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Awards (9)：
  • 2023/10 - Chem-Bio Informatics Society Excellent Poster Award A Graph Based Method of Pattern Mining for Spatial Transcriptome Data
  • 2022/11 - KICSS2022 Best Crowd Award Simulating reaction time for Eureka effect in visual object recognition using artificial neural network
  • 2021/03 - Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry The Excellent Paper Award Published in Bioscience, Biotechnology, & Biochemistry Long non-coding RNA 2310069B03Rik functions as a suppressor of Ucp1 expression under prolonged cold exposure in murine beige adipocytes
  • 2014/07 - 大阪大学 大阪大学総長奨励賞(研究部門)
  • 2014/06 - 情報処理学会 情報処理学会論文賞(IPSJ Outstanding Paper Award)
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Association Membership(s) (2)：
JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS ,  INFORMATION PROCESSING SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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