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J-GLOBAL ID：201501038005861228   Update date: Jul. 30, 2024

Aoki Wataru

アオキ ワタル | Aoki Wataru
Affiliation and department：
Osaka University Graduate School of Engineering

About Osaka University Graduate School of Engineering


Homepage URL  (1)： http://www.tenko.kais.kyoto-u.ac.jp/
Research field  (5)： Genomics ,  Applied microbiology ,  Molecular biology ,  Systems genomics ,  Neuroscience - general
Research keywords  (8)： 生物工学 ,  微生物学 ,  オミックス解析 ,  合成生物学 ,  プロテインエンジニアリング ,  人工細胞 ,  セロミクス解析 ,  ニューラルネットワーク解析
Research theme for competitive and other funds  (11)：
  • 2021 - 2027 生命科学における還元的方法と構成的方法の統合による多様な生命現象の理解
  • 2023 - 2026 試験管内リボソーム進化工学によるリボソーム触媒活性の改変
  • 2022 - 2025 Screening of the proteins involved in uptake of ubiquinone in Saccharomyces cerevisiae using synthetic ubiquinone probes
  • 2022 - 2025 Elucidation of the pathogenesis of rapidly progressive interstitial pneumonia and development of therapeutic application.
  • 2019 - 2022 Development of new therapeutic strategies for driver mutation-positive lung cancer
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Papers (90)：
  • Mirai Mizutani, Seina Kuroda, Masahide Oku, Wataru Aoki, Takahiro Masuya, Hideto Miyoshi, Masatoshi Murai. Identification of proteins involved in intracellular ubiquinone trafficking in Saccharomyces cerevisiae using artificial ubiquinone probe. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 2024. 149147-149147
  • Toshiko Sato, Shuhei Matsuda, Wataru Aoki. Optimizing conditions to construct artificial cells using commercial in vitro transcription-translation system (PUREfrex2.0). Journal of Bioscience and Bioengineering. 2023
  • Hachiro Konaka, Yasuhiro Kato, Toru Hirano, Kohei Tsujimoto, JeongHoon Park, Taro Koba, Wataru Aoki, Yusei Matsuzaki, Masayasu Taki, Shohei Koyama, et al. Secretion of mitochondrial DNA via exosomes promotes inflammation in Behçet's syndrome. The EMBO journal. 2023. e112573
  • Takumi Miyazaki, Wataru Aoki, Naoki Koike, Toshiko Sato, Mitsuyoshi Ueda. Application of peptide barcoding to obtain high-affinity anti-PD-1 nanobodies. Journal of Bioscience and Bioengineering. 2023
  • Yukio Watanabe, Wataru Aoki, Mitsuyoshi Ueda. Ammonia Production Using Bacteria and Yeast toward a Sustainable Society. Bioengineering. 2023. 10. 1. 82-82
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MISC (41)：
  • Yuji Yamauchi, Mitsuyoshi Ueda, Wataru Aoki. Machine Learning-Guided Engineering of Cre-lox Recombination for Comprehensive Analysis of Neural Networks. The FASEB Journal. 2022. 36. S1
  • 小坂唯心, 小坂唯心, 宮脇佑実, 森めぐみ, 油屋駿介, 福山真央, 植田充美, 植田充美, 青木航, 青木航, et al. Reconstitution in vitro of ribosome biogenesis. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
  • Yuki Takaichi, Kaho Kajiwara, Wataru Aoki, Ueda Mitsuyoshi. Nanobody Libraries Using Protein Ligation. The FASEB Journal. 2021. 35. S1
  • Takumi Miyazaki, Yusei Matsuzaki, Mitsuyoshi Ueda, Wataru Aoki. Peptide barcoding for multiplex evaluation of affinities of nanobody libraries. The FASEB Journal. 2021. 35. S1
  • Yuji Yamauchi, Hidenori Matsukura, Mitsuyoshi Ueda, Wataru Aoki. Development of a Novel Sparse Labeling Method by Machine Learning-Guided Engineering of Cre-lox Recombination. The FASEB Journal. 2021. 35. S1
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Patents (4)：
  • 無細胞タンパク質合成系でのリボソームの製造方法
  • 溶媒中抗原回収システム及び溶媒中抗原回収方法
  • 無細胞タンパク質合成系でのリボソームの製造方法
  • 新規リンカーを用いた抗菌剤および診断薬
Books (30)：
  • アンモニアの低温・低圧合成と新しい利用技術 ~燃焼・混焼技術、水素キャリア~
    技術情報協会 2023 ISBN:9784861049538
  • 食品ロス削減と食品廃棄物資源化の技術
    シーエムシー出版 2023 ISBN:9784781317267
  • 大阪大学工業会誌TECHNO NET
    2023
  • 生物工学会誌
    2023
  • 論文図表を読む作法 : はじめて出会う実験&解析法も正しく解釈! : 生命科学・医学論文をスラスラ読むためのFigure事典
    羊土社 2022 ISBN:9784758122603
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Lectures and oral presentations  (186)：
  • リボソーム自己複製プロセスの構成的理解による物質と生命の境界探査
    (第6回ExCELLSシンポジウム 2024)
  • 試験管内でリボソームを生合成する
    (iSeminar 2024)
  • 試験管内でリボソームを生合成する
    (日本生物物理学会サブグループ「人工細胞モデル&分子ロボティクス」セミナー 2023)
  • 生命の試験管内再構成とその再発明への挑戦
    (関西ライフサイエンスリーディングサイエンティストセミナー 2023)
  • 自己複製する人工細胞創出に向けた、自律的セントラルドグマ関連タンパク質一斉定量法の開発
    (第46回日本分子生物学会年会 2023)
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Education (3)：
  • 2010 - 2013 Kyoto University Graduate School of Agriculture Division of Applied Life Sciences
  • 2008 - 2010 Kyoto University Graduate School of Agriculture Division of Applied Life Sciences
  • 2004 - 2008 Kyoto University Faculty of Agriculture
Professional career (1)：
  • 博士(農学) (京都大学)
Work history (8)：
  • 2023/04 - 現在 Osaka University Department of Biotechnology, Graduate School of Engineering Professor
  • 2019/12 - 現在 Barcodebody Co., Ltd. 技術委員
  • 2015/06 - 現在 京都バイオ計測センター 招聘研究員
  • 2022/02 - 2023/03 京都大学創発PI
  • 2015/05 - 2023/03 Kyoto University Graduate School of Agriculture
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Committee career (20)：
  • 2024/01 - 現在 The Journal of Biochemistry Associate Editor
  • 2024/01 - 現在 生物工学若手会 幹事
  • 2022/01 - 2023/12 生物工学若手会 会長
  • 2020/01 - 2022/12 生物工学若手会 副会長
  • 2019/12 - 2022/10 公益社団法人 日本生物工学会 生物工学会100周年記念事業準備タスクフォース
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Awards (2)：
  • 2021/10 - 日本生物工学会 第73回日本生物工学会大会 大会トピックス賞 遊離ナノボディのアフィニティをハイスループットに評価するペプチドバーコーディング
  • 2012/06 - 生物工学若手研究者の集い 生物工学若手研究者の集い(若手会)夏のセミナー 優秀研究発表賞 病原性プロテアーゼの存在を感知し、特異的に活性を発揮する新規ドラッグデザイン
Association Membership(s) (4)：
Japanese Society for Cell Synthesis Research ,  Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry ,  The Society for Biotechnology, Japan ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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