Research theme for competitive and other funds (17):
2024 - 2027 一細胞レベルでの高解像度発現解析と代謝産物の標的同定による天然物生物学
2022 - 2026 一細胞/一核RNA-seq解析による異形細胞の遺伝子発現アトラス
2020 - 2024 植物幹細胞の増殖・分化・老化のバランスによる花の数とサイズの制御機構
2023 - 2024 マスター転写因子による植物細胞運命の分岐点の制御
2022 - 2024 維管束-ミロシン細胞のワイヤリングにおけるオーキシンの作用機序
2021 - 2023 低分子化合物による脱春化の制御とその分子機構
2020 - 2022 The coordiated development of idioblast myrosin cells and vascular cells
2019 - 2022 Transcriptional network for the differentiation of idioblast
2021 - 2022 低温と低分子化合物によるヒストン脱メチル化酵素の発現制御とその応用
2019 - 2021 植物異形細胞における葉緑体分化抑制の分子メカニズムと生理的意義の解明
2019 - 2020 植物の春化の可逆性と農業への展開
2018 - 植物ホルモンによる脱春化応答の制御メカニズム
2017 - 2018 植物のマスター転写因子から探る孔辺細胞と異形細胞の分化メカニズム
2015 - 2017 bHLH型転写因子FAMAによる2つの異なる細胞の分化運命決定機構
2012 - 2015 孔辺細胞の起源から探る細胞系譜の進化機構
2008 - 2009 小胞輸送系を介した細胞の運命決定機構
2007 - 2008 ミロシン細胞分化における維管束とオーキシンの役割
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Papers (33):
Yuki Furuta, Haruka Yamamoto, Takeshi Hirakawa, Akira Uemura, Margaret Anne Pelayo, Hideaki Iimura, Naoya Katagiri, Noriko Takeda-Kamiya, Kie Kumaishi, Makoto Shirakawa, et al. Petal abscission is promoted by jasmonic acid-induced autophagy at Arabidopsis petal bases. Nature Communications. 2024. 15. 1
Makoto Shirakawa, Tomoki Oguro, Shigeo Sugano, Shohei Yamaoka, Mayu Sagara, Mai Tanida, Kyoko Sunuma, Takuya Iwami, Tatsuyoshi Nakanishi, Keita Horiuchi, et al. Co-option and neofunctionalization of stomatal executors for defense against herbivores in Brassicales. 2023
Izumi Yotsui, Hidenori Matsui, Shingo Miyauchi, Hidekazu Iwakawa, Katharina Melkonian, Titus Schlüter, Santiago Michavila, Takehiko Kanazawa, Yuko Nomura, Sara Christina Stolze, et al. LysM-mediated signaling in Marchantia polymorpha highlights the conservation of pattern-triggered immunity in land plants. Current Biology. 2023. 33. 17. 3732-3746
Yukun Wang, Makoto Shirakawa, Toshiro Ito. Arrest, Senescence and Death of Shoot Apical Stem Cells in Arabidopsis thaliana. Plant & cell physiology. 2023. 64. 3. 284-290
Taro Maeda, Shigeo S Sugano, Makoto Shirakawa, Mayu Sagara, Toshiro Ito, Satoshi Kondo, Atsushi J Nagano. Single-Cell RNA Sequencing of Arabidopsis Leaf Tissues Identifies Multiple Specialized Cell Types: Idioblast Myrosin Cells and Potential Glucosinolate-Producing Cells. Plant and Cell Physiology. 2023. 64. 2. 234-247
中西辰慶, 白川一, 白川一, 小黒友輝, 菅野茂夫, 山岡尚平, 相良真由, 谷田舞, 須沼京子, 石見拓也, et al. Co-option of Stomatal Transcription Factors for the Differentiation of Idioblast Myrosin Cells in Arabidopsis. 日本植物生理学会年会(Web). 2024. 65th
MORIYA Kenta, SHIRAKAWA Makoto, MATSUDA Yoriko, TAMURA Kentaro, NISHIHAMA Ryuichi, OKA Yoshito, MATSUSHITA Tomonao, HARA-NISHIMURA Ikuko, KOHCHI Takayuki, SHIMADA Tomoo. MpBHLH35 regulates setal formation in the sporophyte of Marchantia polymorpha. 日本植物生理学会年会(Web). 2021. 62nd