Fukunaga Tsukasa

フクナガツカサ | Fukunaga Tsukasa

Affiliation and department：

Research field (3)： Systems genomics , Genomics , Biological, health, and medical informatics

Research keywords (9)：シアノバクテリア , 比較ゲノム解析 , 表現型 , 遺伝子機能推定 , ゲノム進化 , データマイニング , 機械学習 , RNA二次構造 , バイオインフォマティクス

Research theme for competitive and other funds (8)：

Show all

Papers (33)：

Kaisei Hara, Natsuki Iwano, Tsukasa Fukunaga, Michiaki Hamada. DeepRaccess: high-speed RNA accessibility prediction using deep learning. Frontiers in Bioinformatics. 2023. 3
Motoyo Maruyama, Atsushi Sakai, Tsukasa Fukunaga, Yoshitaka Miyagawa, Takashi Okada, Michiaki Hamada, Hidenori Suzuki. Neat1 lncRNA organizes the inflammatory gene expressions in the dorsal root ganglion in neuropathic pain caused by nerve injury. Frontiers in Immunology. 2023. 14
Hitoshi Iuchi, Junna Kawasaki, Kento Kubo, Tsukasa Fukunaga, Koki Hokao, Gentaro Yokoyama, Akiko Ichinose, Kanta Suga, Michiaki Hamada. Bioinformatics approaches for unveiling virus-host interactions. Computational and structural biotechnology journal. 2023. 21. 1774-1784
Tsukasa Fukunaga, Junichi Iwakiri, Michiaki Hamada. Web Services for RNA-RNA Interaction Prediction. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2586. 175-195
Tsukasa Fukunaga, Michiaki Hamada. Fast RNA-RNA Interaction Prediction Methods for Interaction Analysis of Transcriptome-Scale Large Datasets. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2586. 163-173

ｍore...

Books (1)：

Lectures and oral presentations (5)：

フィコビリソームの系統プロファイル解析により明らかになった新規ステート遷移制御遺伝子
(2023年度ラン藻ゲノム交流会 2023)
高性能系統プロファイル法による機能未知遺伝子の機能推定
(第11回生命医薬情報学連合大会 2022)
次世代のRNA情報学を基盤としたトランスクリプトーム解析
(早稲田大学 BINDS発現機能インシリコ融合ユニットキックオフシンポジウム 2022)
The inverse Potts model improves accuracy of phylogenetic profiling
(第10回生命医薬情報学連合大会 2021)
遺伝子獲得/欠失速度の不均一性を考慮したゲノム進化史再構築
(日本進化学会第23回東京大会 2021)

Education (2)：

2011 - 2016 東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻
2007 - 2011 The University of Tokyo Faculty of Science Undergraduate Program for Bioinformatics and Systems Biology

Professional career (1)：

Work history (7)：

2023/04 - 現在 Waseda University Institue for Advanced Study
2021/04 - 2023/03 Waseda University
2017/10 - 2021/03 Waseda University Research Institute for Science and Engineering
2017/10 - 2021/03 The University of Tokyo
2018/02 - 2019/03 Osaka University

Show all

Committee career (3)：

Awards (3)：

2021 - 第十回生命医薬情報学連合大会優秀口頭発表賞 The inverse Potts model improves accuracy of phylogenetic profiling
2020 - 第九回生命医薬情報学連合大会ポスター賞統計的有意性を担保可能な系列パターンマイニングに基づく配列モチーフ検出ソフトウェアの開発
2016 - 第五回生命医薬情報学連合大会ポスター賞 RIblast: A high-speed RNA-RNA interaction prediction system for comprehensive lncRNA interactome analysis.

Association Membership(s) (5)：

JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS , 日本植物生理学会 , 日本ゲノム微生物学会 , 情報処理学会 , 日本RNA学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

Return to Previous Page