TAKUMI HIGAKI

ヒガキタクミ | TAKUMI HIGAKI

Affiliation and department：
Homepage URL (2)： https://higaki-lab.net/ , https://higaki-lab.net/english/

Research field (2)： Morphology, anatomy , Plants: molecular biology and physiology

Research keywords (12)：植物細胞 , 生物画像解析 , バイオイメージング , バイオイメージインフォマティクス , アクチン繊維 , Microtubules , Membrane traffic , Vacuole , Cell division , タバコBY-2細胞 , 気孔 , シロイヌナズナ

Research theme for competitive and other funds (10)：

2022 - 2028 Advanced Bioimaging Support
2020 - 2023 Multi-dimensional bioimage analyses with machine learning to reveal the dynamics of membrane vesicles and microtubules in stomatal guard cells
2018 - 2023 Imaging analysis on cell geometry during mechanical optimization in leaves
2016 - 2021 先端バイオイメージング支援プラットフォーム
2017 - 2019 Large-scale live cell imaging for elucidation of plant organogenesis

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Papers (114)：

Sayuri Tanaka, Yuuki Matsushita, Yuga Hanaki, Takumi Higaki, Naoya Kamamoto, Katsuyoshi Matsushita, Tetsuya Higashiyama, Koichi Fujimoto, Minako Ueda. HD-ZIP IV genes are essential for embryo initial cell polarization in the radial axis initiation inArabidopsis. 2024
Kazune Ezaki, Hiroyuki Koga, Noriko Takeda-Kamiya, Kiminori Toyooka, Takumi Higaki, Shingo Sakamoto, Hirokazu Tsukaya. Precocious cell differentiation occurs in proliferating cells in leaf primordia in Arabidopsis angustifolia3 mutant. Frontiers in Plant Science. 2024. 15
Yukiko Hiromoto, Naoki Minamino, Suzuka Kikuchi, Yusuke Kimata, Hikari Matsumoto, Sakumi Nakagawa, Minako Ueda, Takumi Higaki. Comprehensive and quantitative analysis of intracellular structure polarization at the apical-basal axis in elongating Arabidopsis zygotes. Scientific reports. 2023. 13. 1. 22879-22879
Keiji Nakajima, Takumi Higaki, Takashi Ueda, Masahiko Inami. Gaining new insights in plant biology through human-machine collaboration. Plant And Cell Physiology. 2023
Kotomi Kikukawa, Hisako Takigawa-Imamura, Kouichi Soga, Toshihisa Kotake, Takumi Higaki. Smooth Elongation of Pavement Cells Induced by RIC1 Overexpression Leads to Marginal Protrusions of the Cotyledon in Arabidopsis thaliana. Plant And Cell Physiology. 2023

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MISC (148)：

松本朋子, 檜垣匠, 高塚大知, 朽名夏麿, 尾形義之, 馳澤盛一郎, 梅田正明, 稲田のりこ. Arabidopsis thaliana Subclass I Actin Depolymerizing Factors Regulate Nuclear Structure and Gene Expression. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
LEE Hayoung, 森山奈津美, 野村康之, 檜垣匠, 佐藤綾人, 永野惇, 永野惇. Chemical transcriptomics enable comprehensive analysis of plant responses induced by various chemicals. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
菊川琴美, 今村寿子, 曽我康一, 小竹敬久, 檜垣匠. Multi-directional planar expansion of pavement cells facilitates round, fan-like cotyledon morphogenesis in Arabidopsis thaliana. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
松本光梨, 中川朔未, 檜垣匠, 津川暁, 石本志高, 野々山朋信, KANG Zichen, 植田美那子, 植田美那子. Live-cell imaging of Arabidopsis zygote reveals the mechanism of polar cell elongation. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
小野華歌, 野々山朋信, 康子辰, 石本志高, 植田美那子, 津川暁, 檜垣匠. タバコBY-2細胞のM/G1境界期における表層微小管の再形成機構の解析. 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集. 2023. 95th (CD-ROM)

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Patents (3)：

Books (1)：

Photobook植物細胞の知られざる世界
化学同人 2010 ISBN:4759811974

Lectures and oral presentations (215)：

深層学習を利用した細胞骨格のセグメンテーション手法の検討
(日本遺伝学会第95回大会 2023)
気孔運動制御因子PATROL1およびSH3P3の細胞内動態および植物成長に対する効果
(日本遺伝学会第95回大会 2023)
タバコBY-2細胞のM/G1境界期における表層微小管の再形成機構の解析
(日本遺伝学会第95回大会 2023)
Arabidopsis thaliana Subclass I Actin Depolymerizing Factors Regulate Nuclear Structure and Gene Expression
(日本植物生理学会年会(Web) 2023)
Chemical transcriptomics enable comprehensive analysis of plant responses induced by various chemicals
(日本植物生理学会年会(Web) 2023)

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Professional career (1)：

博士(生命科学) (東京大学)

Work history (6)：

2022/04 - 現在 Kumamoto University Unregistered
2021/10 - 2022/03 Kumamoto University Unregistered
2017/08 - 2021/09 Kumamoto University International Research Organization for Advanced Science and Technology Associate Proffessor
2016/04 - 2017/07 The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences Project Associate Professor
2011/04 - 2016/03 The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences Project Assistant Professor

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Committee career (9)：

2021/01 - 現在日本バイオイメージング学会理事
2020/01 - 現在 Journal of Plant Research Editorial Board Member
2017/06 - 現在 Frontiers in Plant Science Associate Editor
2017/01 - 現在日本バイオイメージング学会評議員
2017/01 - 現在日本バイオイメージング学会ホームページ編集委員

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Awards (9)：

2021/03 - 日本植物生理学会日本植物生理学会奨励賞画像解析技術の援用による植物細胞骨格研究
2020/12 - 日本メンデル協会 CYTOLOGIA奨励賞ライブイメージングと顕微鏡画像解析による植物細胞骨格の動態と機能の研究
2017/09 - 日本植物学会奨励賞定量的画像解析に基づく植物細胞骨格の研究
2017/04 - Bioimaging Society Young Scientist Travel Award Quantitative cell biology of plant stomata
2013/09 - 日本バイオイメージング学会奨励賞

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Association Membership(s) (4)：

BIOIMAGING SOCIETY , THE JAPANESE SOCIETY OF PLANT PHYSIOLOGISTS , THE BOTANICAL SOCIETY OF JAPAN , 日本建築学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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