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J-GLOBAL ID:201701006496919466
Update date: Sep. 02, 2024
Masahiko Kumagai
クマガイ マサヒコ | Masahiko Kumagai
Affiliation and department:
Research field (1):
Genomics
Research keywords (5):
バイオインフォマティクス
, 次世代シーケンサー
, 栽培化
, ゲノム
, 分子進化
Research theme for competitive and other funds (10):
- 2024 - 2029 The history of the relationship between rice and minor cereals: the use and evolution of cereals from the Jomon to early modern times, as deciphered by palaeogenomic analysis.
- 2020 - 2025 Archaeobotanical investigation to the exchange and transformation of rice, millet and wheat/barley food cultures
- 2021 - 2024 Ancient genomics study on histories of crop species utilization in Jananese Archiperago
- 2021 - 2023 Multi-profiling of Jomon people's nutrition, hygiene, and health status by coprolite genome analysis
- 2017 - 2020 Metagenome analyses of coprolite and dental calculus for prehistoric specimens from the Japanese Archipelago
- 2017 - 2020 Genome analysis of Yayoi people; its relevance for the origin of modern Japanese
- 2015 - 2020 Changes of paleoenvironment and Several stages of animal and plant utilization
- 2015 - 2018 Crop Cultivation Process Deciphered by Large-Scale Genome Sequence Analysis
- 2014 - 2016 Genomic analysis of ancient rice remains
- 2007 - 2009 古代イネDNA分析による栽培イネにおける人為選択標的遺伝子の進化的解析
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Papers (33):
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Koji Ishiya, Fuzuki Mizuno, Jun Gojobori, Masahiko Kumagai, Yasuhiro Taniguchi, Osamu Kondo, Masami Matsushita, Takayuki Matsushita, Li Wang, Kunihiko Kurosaki, et al. High-coverage genome sequencing of Yayoi and Jomon individuals shed light on prehistoric human population history in East Eurasian. 2024
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Keerthi S Guruge, Prasun Goswami, Kazuki Kanda, Amila Abeynayaka, Masahiko Kumagai, Mafumi Watanabe, Yukino Tamamura-Andoh. Plastiome: Plastisphere-enriched mobile resistome in aquatic environments. Journal of hazardous materials. 2024. 471. 134353-134353
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Keiko Gengyo-Ando, Masahiko Kumagai, Hideki Ando, Junichi Nakai. Domain 3a mutation of VPS33A suppresses larval arrest phenotype in the loss of VPS45 in Caenorhabditis elegans. microPublication biology. 2024. 2024
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Luca Nishimura, Akio Tanino, Mayumi Ajimoto, Takafumi Katsumura, Motoyuki Ogawa, Kae Koganebuchi, Daisuke Waku, Masahiko Kumagai, Ryota Sugimoto, Hirofumi Nakaoka, et al. Metagenomic analyses of 7000 to 5500 years old coprolites excavated from the Torihama shell-mound site in the Japanese archipelago. PloS one. 2024. 19. 1. e0295924
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Fuzuki Mizuno, Fuyuki Tokanai, Masahiko Kumagai, Koji Ishiya, Saburo Sugiyama, Michiko Hayashi, Kunihiko Kurosaki, Shintaroh Ueda. Bioarchaeological study of ancient Teotihuacans based on complete mitochondrial genome sequences and diet isotopes. Annals of human biology. 2023. 50. 1. 390-398
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MISC (13):
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熊谷 真彦, 坂井 寛章. ミニレビュー 大規模ゲノム情報を活かすプラットフォームTASUKE の開発と活用の現状. 農研機構研究報告. 2023. 2023. 13. 89-97
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真貝拓三, 池山菜緒, 熊谷真彦, 大森英之, 坂本光央, 大熊盛也, 三森眞琴. 低メタン産生牛に特徴的な新規の第一胃内細菌を発見. 農研機構畜産研究部門成果情報(Web). 2021. 2021
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上野勇一, 柳澤牧央, 木野紗由莉, 茂野悟, 熊谷真彦, 金森裕之, 大崎慎人, 高松大輔, 勝田賢, 丸山正, et al. 西太平洋で初めて分離されたバンドウイルカ由来ブルセラ菌(Brucella ceti). 農研機構動物衛生研究部門成果情報(Web). 2020. 2020
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熊谷真彦, 西川大貴, 川原善浩, 脇本泰暢, 伊藤龍太郎, 田部井紀雄, 田中剛, 伊藤剛. 大規模ゲノム情報比較のためのブラウザ TASUKE+. 農研機構高度解析センター成果情報(Web). 2019
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高橋有, ALISA Kongjaimun, 小林優生, 熊谷真彦, 坂井寛章, 佐藤万仁, 平野隆, 伊勢村武久, 齊藤大樹, 加賀秋人, et al. アズキ裂莢性因子およびジュウロクササゲ莢軟化因子の同定. 育種学研究. 2019. 21
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Books (6):
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日中共同研究成果報告書III 動物・植物・鉱物から探る古代中国(中村慎一編)
六一書房 2024
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東アジア考古科学の新展開(中村慎一監修、米田穣・佐々木由香・覚張隆史編)
雄山閣 2024
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日中共同研究成果報告書 中国江南の考古学(中村 慎一 編)
中国文明起源プロジェクト 2022
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河姆渡と良渚 : 中国稲作文明の起源(劉 斌、中村 慎一 編)
雄山閣 2020 ISBN:9784639026990
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アフロ・ユーラシアの考古植物学(庄田 慎矢 編)
クバプロ 2019 ISBN:9784878051616
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Lectures and oral presentations (9):
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ヤポネシアにおけるイネ受容の歴史をゲノム情報から探る
(日本遺伝学会大会 シンポジウム「遺伝学で明らかにする日本列島におけるヒトと動植物の共生の歴史」 2022)
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縄文糞石のDNAメタバーコーディングによる植物性摂食物の同定
(日本人類学会大会 2022)
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ヤポネシアにおけるイネ受容の歴史をゲノム情報から探る
(日本進化学会大会 シンポジウム「ヤポネシア人が食べてきた植物のゲノム解析」 2022)
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Genomics studies on Asian and African rice
(Studies in Asian and African Geolinguistics 4th meeting 2022)
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Multidisciplinary approach for tracing the intertangle spread of rice and millet in Northeast Asia.
(Transeurasian millets and beans, languages and genes 2019)
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Professional career (1):
- Ph.D. (The University of Tokyo)
Work history (5):
- 2020/04 - 現在 National Agriculture and Food Research Organization
- 2017/04 - 2020/03 National Agriculture and Food Research Organization
- 2014/03 - 2017/04 The University of Tokyo Graduate School of Science Department of Biological Sciences
- 2011/04 - 2014/03 独立行政法人 農業生物資源研究所 農業生物先端ゲノム研究センター ゲノムインフォマティックスユニット 特別研究員
- 2007/04 - 2010/03 Japan Society for the Promotion of Science
Association Membership(s) (4):
THE ANTHROPOLOGICAL SOCIETY OF NIPPON
, SOCIETY OF EVOLUTIONARY STUDIES, JAPAN
, 日本植生史学会
, 日本遺伝学会
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