Hiraoka Satoshi

ヒラオカサトシ | Hiraoka Satoshi

Affiliation and department：
Homepage URL (1)： https://sites.google.com/site/shselfintro/

Research field (4)： Molecular biology , Applied microbiology , Ecology and environmental science , Genomics

Research keywords (4)： Environmental microbiology , bioinformatics , metaepigenomics , metagenomics

Research theme for competitive and other funds (7)：

2023 - 2025 Biodegradations of plastic materials under deep-sea mimic environment
2022 - 2025 深海微生物叢情報を利用した新規糖質分解酵素の探索及び機能解析と応用展開
2022 - 2025 高温環境微生物叢が持つエピゲノム機構の探究
2020 - 2023 海洋細菌叢が持つDNAメチル化機構の多様性と生態学的意義の解明
2020 - 2022 原核微生物が持つエピジェネティクスの理解に向けた海洋細菌群集のDNAメチル化修飾の系統網羅的解

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Papers (12)：

Tomomi Sumida, Satoshi Hiraoka, Keiko Usui, Akihiro Ishiwata, Toru Sengoku, Keith A Stubbs, Katsunori Tanaka, Shigeru Deguchi, Shinya Fushinobu, Takuro Nunoura. Genetic and functional diversity of β-N-acetylgalactosamine-targeting glycosidases expanded by deep-sea metagenome analysis. Nature communications. 2024. 15. 1. 3543
Michiko Takahashi, Satoshi Hiraoka, Yuki Matsumoto, Rikako Shibagaki, Takako Ujihara, Hiromichi Maeda, Satoru Seo, Keizo Nagasaki, Hiroaki Takeuchi, Shigenobu Matsuzaki. Host-encoded DNA methyltransferases modify the epigenome and host tropism of invading phages. bioRxiv. 2024
Yi Zhang, Yoshihiro Takaki, Yukari Yoshida-Takashima, Satoshi Hiraoka, Kanako Kurosawa, Takuro Nunoura, Ken Takai. A sequential one-pot approach for rapid and convenient characterization of putative restriction-modification systems. mSystems. 2023. e0081723
Satoshi Hiraoka, Minoru Ijichi, Hirohiko Takeshima, Yohei Kumagai, Ching-Chia Yang, Yoko Makabe-Kobayashi, Hideki Fukuda, Susumu Yoshizawa, Wataru Iwasaki, Kazuhiro Kogure, et al. Probe capture enrichment sequencing ofamoAgenes discloses diverse ammonia-oxidizing archaeal and bacterial populations. bioRxiv. 2023
Satoshi Hiraoka, Tomomi Sumida, Miho Hirai, Atsushi Toyoda, Shinsuke Kawagucci, Taichi Yokokawa, Takuro Nunoura. Diverse DNA modification in marine prokaryotic and viral communities. Nucleic acids research. 2022. 50. 3. 1531-1550

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MISC (2)：

澄田智美, 平岡聡史, 臼井けい子, 伏信進矢, 布浦拓郎. Discovery of novel β-N-acetylgalactosamine-targeting glycosidases using deep-sea metagenomic analysis. 日本微生物生態学会大会(Web). 2023. 36th
澄田智美, 平岡聡史, 臼井けい子, 石渡明弘, 伏信進矢, 布浦拓郎. 深海微生物叢情報を利用した新規糖質分解酵素の探索~新規酵素群の分子進化と機能の多様性を紐解く~. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th

Books (1)：

Lectures and oral presentations (28)：

地球微生物学とバイオインフォマティクス
(日本地球化学会第71回年会 2024)
環境微生物生態の理解を目指したメタゲノム解析研究の展開
(公益財団法人大隅基礎科学創成財団務微生物コンソーシアム 2024)
Culture-independent sequencing analysis of microbial community in deep-sea sediment
(JpGU2024 2024)
陸生温泉の微生物ストリーマーにおける希少微生物叢の発見
(日本地球惑星科学連合2024年大会 2024)
未培養系統が優占する環境微生物叢の代謝を理解するためのシーケンス解析
(第一回微生物代謝研究会 2024)

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Education (3)：

2015 - 2018 The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences
2013 - 2015 The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences Department of Computational Biology
2011 - 2013 The University of Tokyo Faculty of Science Undergraduate Program for Bioinformatics and Systems Biology

Professional career (1)：

Work history (3)：

2021/04 - 現在海洋研究開発機構(JAMSTEC) 生命理工学センター深海バイオリソース研究グループ研究員
2019/04 - 2021/03 海洋研究開発機構(JAMSTEC) 生命理工学センター深海バイオリソース研究グループ特任研究員
2018/04 - 2019/03 海洋研究開発機構(JAMSTEC) 海洋生命理工学研究開発センター深海バイオ・オープンイノベーションプラットフォーム特任研究員

Awards (2)：

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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