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J-GLOBAL ID:201801006926847941   Update date: Oct. 04, 2024

Nakamura Yoji

Nakamura Yoji
Research field  (1): Marine/Aquatic life sciences
Research keywords  (3): バイオインフォマティクス ,  比較ゲノム ,  分子進化
Research theme for competitive and other funds  (12):
  • 2021 - 2024 マグロの雌雄を決定する遺伝子およびその作用機序の解明
  • 2020 - 2024 In search of genes related to the life-history polymorphism in the Japanese eel Anguilla japonica: a population genomics approach
  • 2019 - 2022 Role of NPR1 gene in regulating Susabi-nori (Porphyra yezoensis) immunity
  • 2017 - 2020 Comparative Biology of Parmales and diatoms to explore the origin and sucess of diatoms
  • 2014 - 2018 Biology of Pramles, a sister picoplanktonic group of diatoms
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Papers (78):
  • Yoji Nakamura, Motoshige Yasuike, Taiki Fuji, Satoshi Suyama, Miyuki Mekuchi. Draft genome sequence and tissue expression panel of Pacific saury (Cololabis saira). DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes. 2024. 31. 3
  • Takao Hayashida, Satoshi Soma, Yoji Nakamura, Kentaro Higuchi, Yukinori Kazeto, Koichiro Gen. Transcriptome characterization of gonadal sex differentiation in Pacific bluefin tuna, Thunnus orientalis (Temminck et Schlegel). Scientific Reports. 2023. 13. 1
  • Hiroki Ban, Shinya Sato, Shinya Yoshikawa, Kazumasa Yamada, Yoji Nakamura, Mutsuo Ichinomiya, Naoki Sato, Romain Blanc-Mathieu, Hisashi Endo, Akira Kuwata, et al. Genome analysis of Parmales, the sister group of diatoms, reveals the evolutionary specialization of diatoms from phago-mixotrophs to photoautotrophs. Communications biology. 2023. 6. 1. 697-697
  • Kazutoshi Yoshitake, Atushi Fujiwara, Aiko Matsuura, Masashi Sekino, Motoshige Yasuike, Yoji Nakamura, Reiichiro Nakamichi, Masaaki Kodama, Yumiko Takahama, Akinori Takasuka, et al. Estimation of tuna population by the improved analytical pipeline of unique molecular identifier-assisted HaCeD-Seq (haplotype count from eDNA). SCIENTIFIC REPORTS. 2021. 11. 1
  • Yoji Nakamura, Kentaro Higuchi, Kazunori Kumon, Motoshige Yasuike, Toshinori Takashi, Koichiro Gen, Atushi Fujiwara. Prediction of the Sex-Associated Genomic Region in Tunas (Thunnus Fishes). International journal of genomics. 2021. 2021. 7226353-7226353
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MISC (73):
  • Yuki Yamamoto, Shun Tokioka, Masashi Sekino, Yoji Nakamura, Reiichiro Nakamichi, Motoshige Yasuike. II-1. Population genetic structure of spear squid Heterololigo bleekeri inferred from SNPs data. Nippon Suisan Gakkaishi (Japanese Edition). 2024. 90. 2. 153
  • 宇治督, 佐野菜採, 佐野菜採, 安池元重, 中村洋路, 關野正志, 細谷将. スジアラPlectropomus leopardus連鎖地図の作製. 日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM). 2023. 2023
  • 宇治督, 佐野菜摘, 山口智史, 三好花歩, 風藤行紀, 奥澤公一, 安池元重, 中村洋路, 關野正志, 細谷将. Genetic structure analysis of Coral trout, Plectropomus leopardus, using Gras-Di genotyping technology. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
  • 宇治督, 山口智史, 安池元重, 中村洋路, 關野正志, 細谷将. GRAS-Di法におけるスジアラPlectropomus leopardusに適したプライマーセットの検討. 日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM). 2021. 2021
  • 坂井貴光, 中村洋路, 山崎雅俊, 米加田徹, 佐藤純, 藤原篤志, 安池元重, 森広一郎. Microsporidium seriolaeのゲノム解析. 日本魚病学会大会プログラムおよび講演要旨. 2019. 2019. 30
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Books (1):
  • Marine Metagenomics: Technological Aspects and Applications
    Springer 2019 ISBN:9789811381331
Lectures and oral presentations  (9):
  • NGSと水産研究
    (第201回農林交流センターワークショップ「次世代シーケンサーの解析技術」 2016)
  • ゲノム情報からみたエドワジエラ症原因菌の多様性
    (第17回マリンバイオテクノロジー学会大会 2015)
  • ノリゲノム解読~紅藻のモデル生物として~
    (平成26年度日本水産学会春季大会 2014)
  • 水産生物のゲノム解読
    (NGSワークショップ 2014)
  • 海産紅藻スサビノリのゲノム解読
    (マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集 2013)
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Professional career (1):
  • Ph.D (The Graduate University for Advanced Studies)
Work history (9):
  • 2020/07 - 現在 国立研究開発法人 水産研究・教育機構 水産資源研究所 水産資源研究センター 生命情報解析部 主任研究員
  • 2019/04 - 現在 Kitasato University School of Marine Biosciences
  • 2016/04 - 2020/07 国立研究開発法人 水産研究・教育機構 中央水産研究所 水産生命情報研究センター 主任研究員
  • 2014/04 - 2016/03 独立行政法人 水産総合研究センター 中央水産研究所 水産遺伝子解析センター 主任研究員
  • 2013/08 - 2014/03 独立行政法人 水産総合研究センター 中央水産研究所 水産遺伝子解析センター 研究員
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※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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