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J-GLOBAL ID：201801007000788824   Update date: Aug. 29, 2024

Ozaki Haruka

オザキ ハルカ | Ozaki Haruka
Affiliation and department：
筑波大学 医学医療系

About 筑波大学 医学医療系


Job title： 准教授
Homepage URL  (1)： https://yuifu.github.io/
Research field  (2)： Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics
Research keywords  (5)： Single cell omics ,  Omics biology ,  Genome science ,  Computational biology ,  Bioinformatics
Research theme for competitive and other funds  (8)：
  • 2023 - 2027 Elucidation of the mechanism of thoracic aortic disease based on extracellular matrix and development of novel therapeutic strategy
  • 2021 - 2026 Construction mechanism of basic design for adaptive neuronal circuits
  • 2022 - 2025 敵対的生成ネットワークによる自在な発現特異性を有するプロモータ塩基配列の設計
  • 2022 - 2025 多階層シングルセル解析を応用した骨再生機構の解明と新規再生療法の基盤構築
  • 2022 - 2025 多階層シングルセル解析を応用した骨再生機構の解明と新規再生療法の基盤構築
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Papers (34)：
  • Shinya Nakata, Kanako Iwasaki, Hiromasa Funato, Masashi Yanagisawa, Haruka Ozaki. Neuronal subtype-specific transcriptomic changes in the cerebral neocortex associated with sleep pressure. Neuroscience research. 2024
  • Hideki Maehara, Toshiya Kokaji, Atsushi Hatano, Yutaka Suzuki, Masaki Matsumoto, Keiichi I. Nakayama, Riku Egami, Takaho Tsuchiya, Haruka Ozaki, Keigo Morita, et al. DNA hypomethylation characterizes genes encoding tissue-dominant functional proteins in liver and skeletal muscle. Scientific Reports. 2023. 13. 1
  • Saeko Tahara, Takaho Tsuchiya, Hirotaka Matsumoto, Haruka Ozaki. Transcription factor-binding k-mer analysis clarifies the cell type dependency of binding specificities and cis-regulatory SNPs in humans. BMC genomics. 2023. 24. 1. 597-597
  • Takashi Inagaki, Akari Kato, Koichi Takahashi, Haruka Ozaki, Genki N. Kanda. LLMs can generate robotic scripts from goal-oriented instructions in biological laboratory automation. 2023
  • Shodai Taguchi, Yasuyuki Suda, Kenji Irie, Haruka Ozaki. Automation of yeast spot assays using an affordable liquid handling robot. SLAS Technology. 2023
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MISC (22)：
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Lectures and oral presentations  (5)：
  • Millefy によるリードカバレージの細胞間不均一性の可視化
    (シングルセルゲノミクス研究会2019 2019)
  • Future perspectives on environmental DNA research from single-cell RNA sequencing analyses
    (The 66th Annual Meeting of the Ecological Society of Japan 2019)
  • Inferring activity and targets of enhancers in single cells through single-cell enhancer RNA analyses
    (International Workshop for Systems Genetics 2018 2018)
  • シングルセル・インフォマティクスによる細胞機能の理解
    (名古屋大学創薬科学研究科主催 第85回創薬科学セミナー 2018)
  • (サイトメトリー研究者のための)1細胞オミクス計測データ解析のフロンティア
    (第28回日本サイトメトリー学会学術集会 2018)
Education (3)：
  • 2012 - 2015 The University of Tokyo
  • 2010 - 2012 The University of Tokyo
  • 2006 - 2010 University of Tokyo Faculty of Science Department of Biochemistry and Biophysics
Professional career (1)：
  • Ph.D. (The University of Tokyo)
Work history (6)：
  • 2018/08 - 現在 RIKEN RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research Laboratory for Bioinformatics Research Senior Visiting Scientist
  • 2018/06 - 現在 University of Tsukuba
  • 2018/06 - 現在 University of Tsukuba Faculty of Medicine
  • 2018/04 - 2018/06 理化学研究所 生命機能科学研究センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット 基礎科学特別研究員
  • 2016/04 - 2018/03 理化学研究所 情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット 基礎科学特別研究員
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Awards (2)：
  • 2021/11 - 筑波大学 令和3年度筑波大学若手研究奨励賞
  • 2021 - Japanese Society for Bioinformatics Oxford Journals-JSBi Prize Elucidation of transcriptional regulation diversity through sequencing data analysis
Association Membership(s) (2)：
JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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