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J-GLOBAL ID：201801007272096255   Update date: Nov. 12, 2024

SASAGAWA Yohei

ササガワ ヨウヘイ | SASAGAWA Yohei
Affiliation and department：
Institute of Science Tokyo Department of Functional Genome Informatics, Division of Medical Genomics, Medical Research Institute

About Institute of Science Tokyo Department of Functional Genome Informatics, Division of Medical Genomics, Medical Research Institute


Job title： Associate Professor
Homepage URL  (1)： https://twitter.com/ecPDCNRA
Research field  (2)： Molecular biology ,  Genomics
Research keywords  (7)： minutes amount of RNA ,  Quartz-Seq ,  experimental technique ,  technical development ,  transcriptome ,  genomics ,  single-cell RNA-seuencing
Research theme for competitive and other funds  (4)：
  • 2019 - 2022 逆転写酵素による鋳型非依存的な塩基付与の法則の理解と完全長cDNA合成の精緻化
  • 2014 - 2017 Chromatin structure as a determinant of transcriptional activity
  • 2014 - 2017 Technical development of single-cell multi-omics
  • 2012 - 2014 Technical development for novel Single-cell RNA-seq
Papers (17)：
  • Yasuyuki Shima, Henrik Skibbe, Yohei Sasagawa, Noriko Fujimori, Yoshimi Iwayama, Ayako Isomura-Matoba, Minoru Yano, Takumi Ichikawa, Itoshi Nikaido, Nobutaka Hattori, et al. Distinctiveness and continuity in transcriptome and connectivity in the anterior-posterior axis of the paraventricular nucleus of the thalamus. Cell Reports. 2023. 42. 10. 113309-113309
  • Nao Ogura, Yohei Sasagawa, Tasuku Ito, Toshiaki Tameshige, Satomi Kawai, Masaki Sano, Yuki Doll, Akira Iwase, Ayako Kawamura, Takamasa Suzuki, et al. WUSCHEL-RELATED HOMEOBOX 13 suppresses de novo shoot regeneration via cell fate control of pluripotent callus. Science Advances. 2023. 9. 27
  • Hitomi Takada, Yohei Sasagawa, Mika Yoshimura, Kaori Tanaka, Yoshimi Iwayama, Tetsutaro Hayashi, Ayako Isomura-Matoba, Itoshi Nikaido, Akira Kurisaki. Single-cell transcriptomics uncovers EGFR signaling-mediated gastric progenitor cell differentiation in stomach homeostasis. Nature Communications. 2023
  • Chia-Wen Lin, Dian E Septyaningtrias, Hsu-Wen Chao, Mikiko Konda, Koji Atarashi, Kozue Takeshita, Kota Tamada, Jun Nomura, Yohei Sasagawa, Kaori Tanaka, et al. A common epigenetic mechanism across different cellular origins underlies systemic immune dysregulation in an idiopathic autism mouse model. Molecular psychiatry. 2022. 27. 8. 3343-3354
  • Yasuyuki Shima, Henrik Skibbe, Yohei Sasagawa, Noriko Fujimori, Itoshi Nikaido, Nobutaka Hattori, Tadafumi Kato. Distinctiveness and continuity in transcriptome and connectivity in the anterior-posterior axis of the paraventricular nucleus of thalamus. bioRxiv (preprint). 2022
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MISC (38)：
  • (プレスリリース) 芽を生み出すかどうか、植物カルス細胞の分化を運命づける因子をつきとめた 植物の器官再生能力を制御する新たな仕組みを発見. 2023
  • 高田仁実, 笹川洋平, 芳村美佳, 田中かおり, 岩山佳美, 林哲太郎, 的場綾子, 二階堂愛, 栗崎晃. (プレスリリース) 最前線で胃を守れ ~胃粘膜を保護する幹細胞分化制御のしくみを解明~. 2023
  • 笹川 洋平, 田中 かおり, 林 哲太郎, 二階堂 愛. 1細胞RNA解析で世界最高成績 -国際的な性能比較研究で証明-. 2020
  • 高田仁実, 笹川洋平, 芳村美佳, 田中かおり, 二階堂愛, 栗崎晃. 胃の恒常性維持を司る幹細胞分化制御機構の解析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd
  • Satoru Ishihara, Yohei Sasagawa, Takeru Kameda, Mana Umeda, Hayato Yamashita, Naoe Kotomura, Masayuki Abe, Yohei Shimono, Itoshi Nikaido. Local states of chromatin compaction at transcription start sites control transcription levels. bioRxiv. 2019
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Patents (2)：
Books (6)：
  • 1細胞解析技術
    ニューサイエンス社 2023
  • シングルセル解析でなにがわかるか (DOJIN BIOSCIENCE SERIES)
    2020
  • バイオイノベーションに向けて~バイオテクノロジーの新技術からの新しい視点~
    シーエムシー出版 2019
  • 実験医学別冊 次世代シークエンス解析スタンダード NGSのポテンシャルを活かしきるWET&DRY
    羊土社 2014
  • 次世代シークエンス解析スタンダード NGSのポテンシャルを活かしきるWET&DRY
    羊土社 2014 ISBN:9784758101912
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Lectures and oral presentations  (19)：
  • 特別な装置を必要としない大規模 Single Cell RNA-Seq 法 PIP-seq の検証
    (NGS EXPO 2024 2024)
  • 長鎖 DNA シーケンサーによる cDNA 解析技術の導入
    (NGS EXPO 2024 2024)
  • ヒトiPS 細胞由来神経細胞におけるゲノムワイドなマイクロエキソンの検出
    (NGS EXPO 2024 2024)
  • 多拠点連携して 高出力トランスクリプトームデータを生産する
    (Laboratory Automation 勉強会 2022.6 2022)
  • 1細胞RNAシーケンス法Quartz-Seq2の開発と表現型スクリーニング法への応用
    (ギルソン社ピペットマン生誕50周年記念 研究フォーラム 2022)
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Work history (7)：
  • 2021/05 - 現在 RIKEN Laboratory for Bioinformatics ResearchRIKEN Center for Biosystems Dynamics Research Visiting Scientist
  • 2021/04 - 現在 Division of Medical Genomics, Medical Research Institute Tokyo Medical and Dental University Department of Functional Genome Informatics Associate professor
  • 2019/06 - 現在 Knowledge Palette, Inc. Adviser
  • 2019/04 - 2021/03 RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research: Wako, Saitama, Japan Laboratory for Bioinformatics Research Senior Scientist
  • 2018/04 - 2019/03 RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research: Wako, Saitama, Japan Laboratory for Bioinformatics Research Senior Scientist
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※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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