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J-GLOBAL ID:201801007338248752
Update date: Oct. 27, 2024
Kashima Makoto
カシマ マコト | Kashima Makoto
Affiliation and department:
Job title:
Lecturer
Homepage URL (1):
https://www.lab.toho-u.ac.jp/sci/biomol/kashima/index.html
Research field (3):
Biological, health, and medical informatics
, Plant genetics and breeding
, Developmental biology
Research keywords (7):
zebrafish
, rice
, プラナリア
, 環境応答
, NGS
, PIWI
, 幹細胞
Research theme for competitive and other funds (23):
- 2024 - 2027 Prediction modeling for photosynthetic dynamics of multiple rice cultivars by field transcriptome
- 2024 - 2027 リソソームストレスに対するNrf2活性化のメカニズムと意義
- 2024 - 2027 Studying on contributing to ensuring fertility and avoiding developmental toxicity risks in paediatric cancer patients
- 2023 - 2027 Role of transcription factor Tfcp2l1 in growth spurt phenomena in zebrafish
- 2023 - 2026 低温適応を担うCa2+-CaMKIIシグナリング
- 2023 - 2026 Development of a treatment method for maxillofacial dysplasia caused by parathyroid hormone (PTH) signaling disorder
- 2022 - 2026 淡水棲マミズクラゲがもつ3つの謎(性決定、芽体形成、生物伝播)の解明に迫る
- 2023 - 2026 低温適応を担うCa2+-CaMKIIシグナリング
- 2022 - 2025 Accumulation mechanism of senescence cells in aging and the challenge for anti-aging
- 2022 - 2025 プラナリア成体多能性幹細胞の維持を可能とする分子の探索
- 2021 - 2025 Molecular/genetic basis underlying the fish social vision
- 2022 - 2025 OGR1オルソログを利用した微量金属特異性を感知するOGR1のアミノ酸配列の決定
- - 2024 さまざまな農作物の ハイブリッド種子生産の効率化と 品種創出の加速化を目指した新技術開発
- 2022 - 2023 環境依存的な性決定機構のトリガー細胞の同定
- 2021 - 2022 委託研究
- 2021 - 2022 J-RDMMモデル生物プロジェクト
- 2020 - 2021 委託研究
- 2019 - 2021 Identification of the targets of nuclear PIWI-piRNA complexes important for the planarian adult pluripotent stem cell system
- 2019 - 2020 委託研究
- 2019 - 2019 成体多能性幹細胞維持の実現に向けた、プラナリアを用いたケミカルスクリーニング
- 2018 - 全能性を支える分子基盤としてのPIWIタンパク質の分子機能解析
- 2016 - 2017 Analysis of cooperative function of PIWI proteins in gene regulation during self-renewal and differentiation of planarian pluripotent stem cells
- 2013 - 2016 Piwiタンパク質によるプラナリア全能性体性幹細胞の維持機構の解明
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Papers (39):
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Shujie Liu, Lin Xu, Makoto Kashima, Rika Narumi, Yoshifumi Takahata, Eriko Nakamura, Hirotoshi Shibuya, Masaru Tamura, Yuki Shida, Toshihiro Inubushi, et al. Expression analysis of genes including Zfhx4 in mice and zebrafish reveals a temporospatial conserved molecular basis underlying craniofacial development. Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists. 2024
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Kazuki Omata, Makoto Kashima, Makiko Ohkido-Yamamoto, Noriyuki Murai, Kota Ishikawa, Hiromi Hirata, Takashi Kato. Canonical and Non-Canonical Functions of Erythropoietin and Its Receptor in Mature Nucleated Erythrocytes of Western Clawed Frog, Xenopus tropicalis. Zoological science. 2024. 41. 4. 329-341
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Kenta Watai, Kenichiro Sadamitsu, Seiji Wada, Makoto Kashima, Hiromi Hirata. Zebrafish trpm7 mutants show reduced motility in free movement. Development, growth & differentiation. 2024
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Ruochong Wang, Futaba Kato, Rio Yasui Watson, Aaron M Beedle, Jarrod A Call, Yugo Tsunoda, Takeshi Noda, Takaho Tsuchiya, Makoto Kashima, Ayuna Hattori, et al. The RNA-binding protein Msi2 regulates autophagy during myogenic differentiation. Life science alliance. 2024. 7. 5
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Kenichiro Sadamitsu, Fabien Velilla, Minori Shinya, Makoto Kashima, Yukiko Imai, Toshihiro Kawasaki, Kenta Watai, Miho Hosaka, Hiromi Hirata, Noriyoshi Sakai. Establishment of a zebrafish inbred strain, M-AB, capable of regular breeding and genetic manipulation. Scientific reports. 2024. 14. 1. 7455-7455
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MISC (33):
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貞光謙一郎, 鹿島誠, 平田普三. Characterization of GABAA receptor subunits. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
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萩原幹花, 塩尻カオリ, 鹿島誠, 鹿島誠, 栗田悠子, 永野惇, 石原正恵. Transcriptome reveals the damaged leaves response in beech. 日本生態学会大会講演要旨(Web). 2021. 68th
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出口亜由美, 西家和生, 杉田晴哉, OO Nay Lin, 鹿島誠, 三吉一光. The mode of inheritance and regulatory genes for resistance to powdery mildew in dahlia derived from Dahlia imperialis. 園芸学研究 別冊. 2021. 20. 1
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保坂美朋, 鹿島誠, 平田普三. Time course individual RNA-Seq enabled unbiased staging of the regeneration process in a planarian Dugesia japonica. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
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冨田敦幹, 冨田敦幹, 前田太郎, 前田太郎, 森山(毛利)奈津美, 野村康之, 栗田悠子, 鹿島誠, 冨田勝, 冨田勝, et al. Dose-dependent transcriptomic responses of Arabidopsis thaliana under the JA-SA treatment. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
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Patents (1):
Books (4):
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誰でも再現できるNGS「前」サンプル調製プロトコール : 生物種別DNA、RNA、クロマチン、シングルセル調製の極意
羊土社 2024 ISBN:9784758122726
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Direct-TRI とLasy-Seq を用いた低コスト・ハイスループットなbulk RNA-seq
羊土社 2023
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Direct-TRI and Lasy-Seq: a high-throughput RNA extraction and library preparation method for RNA-Seq
2021
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高校生でもできる! 次世代シークエンサー
羊土社 2015
Lectures and oral presentations (55):
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時系列RNA-Seqを用いたイネの葯発生過程ステージングの同定
(NGS EXPO2024 2024)
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プラナリア研究を加速させるデータ駆動型生物学アプローチ
(Looking back of studies on planarian regeneration and future directions 2024)
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Time-course individual RNA-Seq revealed a transcriptomic landscape of sex determination and importance of female-specific genes in zebrafish
(18th International zebrafish conference 2024)
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超低コストな時系列RNA-Seqが拓く、データ駆動型の表現型解析
(第64回日本先天性異常学会学術集会 2024)
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bulk RNA-Seqを用いた疑似時間解析のすゝめ
(NGS EXPO2023)
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Education (2):
- 2011 - 2016 京都大学大学院 理学研究科 生物科学専攻
- 2007 - 2011 Kyoto University Faculty of Science
Professional career (1):
Work history (4):
- 2023/04 - 現在 Toho University Faculty of Science Department of Biomolecular Science Lecturer
- 2019/09 - 2023/03 Aoyama Gakuin University
- 2016/04 - 2019/08 Ryukoku University
- 2013/04 - 2016/03 日本学術振興会 特別研究員 DC1
Committee career (8):
- 2024/06 - 現在 みんなの再生医療等委員会 分子生物学等委員
- 2024/03 - 2024/11 第10回ゼブラフィッシュ・メダカ創薬研究会 運営委員
- 2024/03 - 2024/06 JSDB Frontiers Prize審査委員
- 2023/03 - 2023/11 第9回ゼブラフィッシュ・メダカ創薬研究会 運営委員
- 2022/06 - 2022/12 NGS発生生物学現場の会2022世話人
- 2021/12 - 2022/11 第8回ゼブラフィッシュ・メダカ創薬研究会 運営委員
- 2020/11 - 2021/12 第 7回ゼブラフィッシュ・メダカ創薬研究会 プログラム委員
- 2017/02 - 2017/05 NGS現場の会 第五回研究会 アカデミックセッション 2D1 オーガナイザー
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Awards (9):
- 2021/11 - 10x Genomics 2021 10x Genomics Young Investigator Fellowship program 特別賞
- 2021/06 - Best presentation award Time-course individual RNA-Seq revealed a transcriptomic landscape of environmental sex determination in zebrafish
- 2016/03 - 京都大学 学位授与式 理学研究科 総代
- 2012/10 - Asia-Pacific Developmental Biology Conference 2012 Poster award
- 2012/10 - 日本発生生物学会 5. Asia-Pacific Developmental Biology Conference 2012 フェローシップ
- 2011/03 - 京都大学 総長賞
- 2010/11 - iGEM 2010 金賞
- 2009/11 - iGEM 2009 銀賞
- 京都大学 霊長類研究所 AS-HOPE 高次脳研究のための視察とEMBO会議への参加
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Association Membership(s) (4):
日本植物生理学会
, NGS現場の会
, THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
, JAPANESE SOCIETY OF DEVELOPMENTAL BIOLOGISTS
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