Seki Masahide

セキマサヒデ | Seki Masahide

Affiliation and department：

Research field (3)： Molecular biology , Systems genomics , Genomics

Research theme for competitive and other funds (7)：

2023 - 2026 ターゲット特異的な長鎖DNAメチル化解析法の開発と乳がんでの応用解析
2020 - 2025 Multi-layered regulatory system of plant resilience under fluctuating environment
2020 - 2025 植物の不均一環境変動へのレジリエンスを支える転写開始点制御機構
2021 - 2024 一細胞CRISPRスクリーニング法を駆使した機能的GWAS-SNP検出法の確立
2021 - 2024 神経細胞の生存を支えるレトログレードシグナルの解明に関する細胞工学研究

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Papers (84)：

Shin-Ichi Tomizawa, Rachel Fellows, Michio Ono, Kazushige Kuroha, Ivana Dočkal, Yuki Kobayashi, Keisuke Minamizawa, Koji Natsume, Kuniko Nakajima, Ikue Hoshi, et al. A non-canonical bivalent gene Wfdc15a controls spermatogenic protease and immune homeostasis. Development (Cambridge, England). 2024
Dahlia Eldeeb, Hiroyuki Okada, Yutaka Suzuki, Masahide Seki, Junichi Tanaka, Kenji Mishima, Ung-Il Chung, Shinsuke Ohba, Hironori Hojo. Exploring the Role of DNMT1 in Dental Papilla Cell Fate Specification during Mouse Tooth Germ Development through Integrated Single-Cell Transcriptomics and Bulk RNA Sequencing. Journal of oral biosciences. 2024
Norifusa Iwahashi, Hironobu Umakoshi, Masamichi Fujita, Tazuru Fukumoto, Tatsuki Ogasawara, Maki Yokomoto-Umakoshi, Hiroki Kaneko, Hiroshi Nakao, Namiko Kawamura, Naohiro Uchida, et al. Single-cell and spatial transcriptomics analysis of human adrenal aging. Molecular metabolism. 2024. 101954-101954
Tazuru Fukumoto, Hironobu Umakoshi, Norifusa Iwahashi, Tatsuki Ogasawara, Maki Yokomoto-Umakoshi, Hiroki Kaneko, Masamichi Fujita, Naohiro Uchida, Hiroshi Nakao, Namiko Kawamura, et al. Steroids-producing nodules: a two-layered adrenocortical nodular structure as a precursor lesion of cortisol-producing adenoma. EBioMedicine. 2024. 105087-105087
Warattaya Wattanathavorn, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Supranee Buranapraditkun, Nakarin Kitkumthorn, Thanayod Sasivimolrattana, Parvapan Bhattarakosol, Arkom Chaiwongkot. Downregulation of LAMB3 Altered the Carcinogenic Properties of Human Papillomavirus 16-Positive Cervical Cancer Cells. International journal of molecular sciences. 2024. 25. 5

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MISC (81)：

岩瀬晃康, 内島泰信, 瀬谷大貴, 来田真友子, 東山大毅, 松居一悠, 田口明糸, 山本尚吾, 福田史朗, 野村征太郎, et al. シングルセルマルチオミクス及び空間発現情報に基づく心臓神経堤細胞の分化運命決定機構解析. 日本解剖学会総会・全国学術集会抄録集(CD-ROM). 2023. 128th
岩瀬晃康, 内島泰信, 瀬谷大貴, 来田真友子, 野村征太郎, 興梠貴英, 宿南知佐, 秋山治彦, 関真秀, 鈴木穣, et al. シングルセルマルチオミクスと空間情報に基づく心臓神経堤細胞の血管/非血管細胞への分化運命決定機構~発生学的起源から病態を考える~. 日本動脈硬化学会総会・学術集会プログラム・抄録集(Web). 2023. 55th
芳賀泰彦, 座波紗子, 鈴木穣, 関真秀. 【がんゲノム医療時代の分子腫瘍学】(第1部)がんの分子病理学(序論) 解析法次世代シークエンシング次世代シークエンシングの原理. 病理と臨床. 2022. 40. 臨増. 064-069
谷彰一郎, 岡田寛之, 関真秀, 鈴木穣, 齋藤琢, 田中栄, 鄭雄一, 北條宏徳, 大庭伸介. ヒト多能性幹細胞由来の三次元骨組織誘導とシングルセル・マルチオーム解析を用いたヒト骨形成機構の解明. 日本整形外科学会雑誌. 2022. 96. 3. S628-S628
岩瀬晃康, 内島泰信, 瀬谷大貴, 来田真友子, 東山大毅, 松居一悠, 田口明糸, 山本尚吾, 福田史朗, 野村征太郎, et al. シングルセルマルチオミクスで明らかにする心臓神経堤細胞の血管/非血管細胞への分化運命決定様式. 日本血管生物医学会学術集会プログラム・抄録集. 2022. 30th (CD-ROM)

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Books (16)：

遺伝子医学通巻33号(復刊8号)(2020年7月)(Vol.10 No.3)特集/Long read sequencer
メディカルドゥ 2020
遺伝子医学通巻33号(復刊8号)(2020年7月)(Vol.10 No.3)特集/Long read sequencer
メディカルドゥ 2020
シングルセル解析でなにがわかるか
化学同人 2020 ISBN:9784759817348
実験医学 2020年6月号 Vol.38 No.9
羊土社 2020
生体の科学 2020年 4月号特集ビッグデータ時代のゲノム医療
医学書院 2020

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Lectures and oral presentations (8)：

Development and application of methods for targeted long-read methylation analysis from small amount of DNA
(2024)
次世代シークエンス技術の現状と展望
(第8回日本HTLV-1学会学術集会 2022)
Development of methods for whole genome long-read methylation sequencing
(The 15th Annual Meeting of the Japanese Society for Epigenetics 2022)
DNA methylation analysis using long-read sequencing
(UTokyo-NTU Joint Conference 2021 2021)
ナノポアシークエンサーを用いた肺腺癌細胞株のトランスクリプトーム解析
(平成29年度若手研究者シンポジウム「若手研究者が拓く最新ゲノム解析研究の道」 2017)

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Professional career (1)：

博士(生命科学) (東京大学大学院)

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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