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J-GLOBAL ID：201801008319443001
Update date: Nov. 01, 2024
Seki Masahide
セキ マサヒデ | Seki Masahide
Affiliation and department：
Research field (3)：
Molecular biology
, Systems genomics
, Genomics
Research theme for competitive and other funds (7)：
- 2023 - 2026 ターゲット特異的な長鎖DNAメチル化解析法の開発と乳がんでの応用解析
- 2020 - 2025 Multi-layered regulatory system of plant resilience under fluctuating environment
- 2020 - 2025 植物の不均一環境変動へのレジリエンスを支える転写開始点制御機構
- 2021 - 2024 一細胞CRISPRスクリーニング法を駆使した機能的GWAS-SNP検出法の確立
- 2021 - 2024 神経細胞の生存を支えるレトログレードシグナルの解明に関する細胞工学研究
- 2021 - 2023 Development of method for long-read whole genome methylation analysis from small amount of DNA
- 2019 - 2021 Development of novel measurement methods for RNA synthesis and degradation using nanopore sequencing
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Papers (85)：
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Kenzui Taniue, Anzu Sugawara, Chao Zeng, Han Han, Xinyue Gao, Yuki Shimoura, Atsuko Nakanishi Ozeki, Rena Onoguchi-Mizutani, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, et al. The MTR4/hnRNPK complex surveils aberrant polyadenylated RNAs with multiple exons. Nature communications. 2024. 15. 1. 8684-8684
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Shin-Ichi Tomizawa, Rachel Fellows, Michio Ono, Kazushige Kuroha, Ivana Dočkal, Yuki Kobayashi, Keisuke Minamizawa, Koji Natsume, Kuniko Nakajima, Ikue Hoshi, et al. A non-canonical bivalent gene Wfdc15a controls spermatogenic protease and immune homeostasis. Development (Cambridge, England). 2024
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Dahlia Eldeeb, Hiroyuki Okada, Yutaka Suzuki, Masahide Seki, Junichi Tanaka, Kenji Mishima, Ung-Il Chung, Shinsuke Ohba, Hironori Hojo. Exploring the Role of DNMT1 in Dental Papilla Cell Fate Specification during Mouse Tooth Germ Development through Integrated Single-Cell Transcriptomics and Bulk RNA Sequencing. Journal of oral biosciences. 2024
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Norifusa Iwahashi, Hironobu Umakoshi, Masamichi Fujita, Tazuru Fukumoto, Tatsuki Ogasawara, Maki Yokomoto-Umakoshi, Hiroki Kaneko, Hiroshi Nakao, Namiko Kawamura, Naohiro Uchida, et al. Single-cell and spatial transcriptomics analysis of human adrenal aging. Molecular metabolism. 2024. 101954-101954
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Tazuru Fukumoto, Hironobu Umakoshi, Norifusa Iwahashi, Tatsuki Ogasawara, Maki Yokomoto-Umakoshi, Hiroki Kaneko, Masamichi Fujita, Naohiro Uchida, Hiroshi Nakao, Namiko Kawamura, et al. Steroids-producing nodules: a two-layered adrenocortical nodular structure as a precursor lesion of cortisol-producing adenoma. EBioMedicine. 2024. 105087-105087
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MISC (81)：
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岩瀬晃康, 内島泰信, 瀬谷大貴, 来田真友子, 東山大毅, 松居一悠, 田口明糸, 山本尚吾, 福田史朗, 野村征太郎, et al. シングルセルマルチオミクス及び空間発現情報に基づく心臓神経堤細胞の分化運命決定機構解析. 日本解剖学会総会・全国学術集会抄録集(CD-ROM). 2023. 128th
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岩瀬晃康, 内島泰信, 瀬谷大貴, 来田真友子, 野村征太郎, 興梠貴英, 宿南知佐, 秋山治彦, 関真秀, 鈴木穣, et al. シングルセルマルチオミクスと空間情報に基づく心臓神経堤細胞の血管/非血管細胞への分化運命決定機構~発生学的起源から病態を考える~. 日本動脈硬化学会総会・学術集会プログラム・抄録集(Web). 2023. 55th
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芳賀 泰彦, 座波 紗子, 鈴木 穣, 関 真秀. 【がんゲノム医療時代の分子腫瘍学】(第1部)がんの分子病理学(序論) 解析法 次世代シークエンシング 次世代シークエンシングの原理. 病理と臨床. 2022. 40. 臨増. 064-069
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谷 彰一郎, 岡田 寛之, 関 真秀, 鈴木 穣, 齋藤 琢, 田中 栄, 鄭 雄一, 北條 宏徳, 大庭 伸介. ヒト多能性幹細胞由来の三次元骨組織誘導とシングルセル・マルチオーム解析を用いたヒト骨形成機構の解明. 日本整形外科学会雑誌. 2022. 96. 3. S628-S628
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岩瀬晃康, 内島泰信, 瀬谷大貴, 来田真友子, 東山大毅, 松居一悠, 田口明糸, 山本尚吾, 福田史朗, 野村征太郎, et al. シングルセルマルチオミクスで明らかにする心臓神経堤細胞の血管/非血管細胞への分化運命決定様式. 日本血管生物医学会学術集会プログラム・抄録集. 2022. 30th (CD-ROM)
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Books (16)：
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遺伝子医学 通巻33号(復刊8号)(2020年7月)(Vol.10 No.3)特集/Long read sequencer
メディカルドゥ 2020
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遺伝子医学 通巻33号(復刊8号)(2020年7月)(Vol.10 No.3)特集/Long read sequencer
メディカルドゥ 2020
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シングルセル解析でなにがわかるか
化学同人 2020 ISBN:9784759817348
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実験医学 2020年6月号 Vol.38 No.9
羊土社 2020
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生体の科学 2020年 4月号 特集 ビッグデータ時代のゲノム医療
医学書院 2020
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Lectures and oral presentations (8)：
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Development and application of methods for targeted long-read methylation analysis from small amount of DNA
(2024)
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次世代シークエンス技術の現状と展望
(第8回日本HTLV-1学会学術集会 2022)
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Development of methods for whole genome long-read methylation sequencing
(The 15th Annual Meeting of the Japanese Society for Epigenetics 2022)
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DNA methylation analysis using long-read sequencing
(UTokyo-NTU Joint Conference 2021 2021)
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ナノポアシークエンサーを用いた肺腺癌細胞株のトランスクリプトーム解析
(平成29年度若手研究者シンポジウム「若手研究者が拓く最新ゲノム解析研究の道」 2017)
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Professional career (1)：
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