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J-GLOBAL ID:201801012102365069   Update date: Apr. 22, 2024

Ootsuki Ryo

Ootsuki Ryo
Affiliation and department:
Other affiliations (6):
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Homepage URL  (1): https://www.researchgate.net/profile/Ryo_Ootsuki
Research field  (1): Biodiversity and systematics
Research keywords  (13): Nanopore long-read sequencing ,  膨張顕微鏡法 ,  植物系統分類学 ,  教養教育 ,  地図学 ,  顕微鏡技術 ,  NGS ,  外邦図 ,  地理学 ,  ゲノム解読 ,  無配生殖 ,  生殖様式 ,  シダ植物
Research theme for competitive and other funds  (3):
  • 2014 - 2017 Mitochondrial genome complete sequencing and technological development of computer scientific "cell fractionation method" in fern
  • 2012 - 2016 Analysis of evolution of sexual reproductive system in Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex, comparing sex-chromosome like regions
  • 2009 - 2011 Mechanisms of obtaining genetic diversity in apogamous fern species
Papers (16):
  • Kazuharu Misawa, Ryo Ootsuki. A simple method for estimating time-irreversible nucleotide substitution rates in the SARS-CoV-2 genome. NAR Genomics and Bioinformatics. 2024
  • Kohei Takahashi, Shigekatsu Suzuki, Hiroko Kawai-Toyooka, Kayoko Yamamoto, Takashi Hamaji, Ryo Ootsuki, Haruyo Yamaguchi, Masanobu Kawachi, Tetsuya Higashiyama, Hisayoshi Nozaki. Reorganization of the ancestral sex-determining regions during the evolution of trioecy in Pleodorina starrii. Communications biology. 2023. 6. 1. 590-590
  • Hiroyuki Sekimoto, Ayumi Komiya, Natsumi Tsuyuki, Junko Kawai, Naho Kanda, Ryo Ootsuki, Yutaka Suzuki, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Masahiro Kasahara, et al. A divergent RWP-RK transcription factor determines mating type in heterothallic Closterium. New Phytologist. 2023
  • Ryosuke Imai, Yoshiaki Tsuda, Atsushi Ebihara, Sadamu Matsumoto, Ayumi Tezuka, Atsushi J Nagano, Ryo Ootsuki, Yasuyuki Watano. Author Correction: Mating system evolution and genetic structure of diploid sexual populations of Cyrtomium falcatum in Japan. Scientific reports. 2021. 11. 1. 19132-19132
  • Kohei Takahashi, Hiroko Kawai-Toyooka, Ryo Ootsuki, Takashi Hamaji, Yuki Tsuchikane, Hiroyuki Sekimoto, Tetsuya Higashiyama, Hisayoshi Nozaki. Three sex phenotypes in a haploid algal species give insights into the evolutionary transition to a self-compatible mating system. Evolution; international journal of organic evolution. 2021. 75. 11. 2984-2993
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MISC (37):
  • 高橋昂平, 鈴木重勝, 豊岡博子, 山本荷葉子, 浜地貴志, 大槻涼, 山口晴代, 河地正伸, 東山哲也, 野崎久義, et al. 緑藻Pleodorina starriiにおける3性共存進化に伴うゲノム中性決定領域の再編成. 日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM). 2023. 87th
  • 高橋昂平, 豊岡博子, 山本荷葉子, 浜地貴志, 大槻涼, 鈴木重勝, 山口晴代, 河地正伸, 東山哲也, 東山哲也, et al. 緑藻ボルボックス系列Pleodorina starriiにおける3つの性表現型を決定する分子遺伝学的基盤の解明. 藻類. 2022. 70. 1
  • 高橋昂平, 豊岡博子, 山本荷葉子, 浜地貴志, 大槻涼, 鈴木重勝, 山口晴代, 河地正伸, 東山哲也, 東山哲也, et al. 3つの性別を持つ緑藻Pleodorina starriiの発見と本種における性決定の分子遺伝学的基盤. 日本植物分類学会大会研究発表要旨集. 2022. 21st (CD-ROM)
  • 大槻涼. HRM解析を用いた三倍体無配生殖型ヤブソテツの遺伝的分離の検証. 日本植物分類学会大会研究発表要旨集. 2022. 21st (CD-ROM)
  • 大槻涼. 三倍体ゲノムのアセンブル-”異質”と”同質”のあいだ-. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2021. 23rd
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Books (2):
  • Cleaved Amplified Polymorphic Sequences (CAPS) Markers in Plant Biology
    2014
  • 地図からの発想
    古今書院 2005
Lectures and oral presentations  (38):
  • 自作 近赤外線DHMによるライブイメージング
    (日本植物形態学会第34回総会・大会 2022)
  • 三倍体ゲノムのアセンブル-“異質”と“同質”のあいだ-
    (日本進化学会第22回大会)
  • 顕微鏡を用いた市民参加型ワークショップの試み〜日本シダの会での事例〜
    (日本植物分類学会第18回大会)
  • 植物における膨張顕微鏡法の応用
    (日本植物形態学会第30回大会 2018)
  • レプリカ膨張顕微鏡法の開発
    (日本植物学会第82大会 2018)
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Education (4):
  • 2009 - 2011 Tokyo Metropolitan University Graduate School of Science and Engineering Department of Biological Sciences
  • 2006 - 2009 Tokyo Metropolitan University Graduate School of Science and Engineering Department of Biological Sciences
  • 2005 - 2006 The University of Tokyo Faculty of Science
  • 2001 - 2005 Komazawa University Faculty of Letters Department of Geography Environmental Study Program
Professional career (1):
  • 博士(理学) (首都大学東京)
Work history (10):
  • 2023/04 - 現在 Hosei University
  • 2020/09 - 現在 J. F. Oberlin University College of Performing and Visual Arts
  • 2020/04 - 現在 Japan Women's University Faculty of Science Department of Chemical and Biological Sciences
  • 2019/04 - 現在 Rikkyo University Zenkari
  • 2018/04 - 現在 東京都立井草高等学校 外部指導員
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Awards (1):
  • 2012/03 - Acta Phytotaxonomica et Geobotanica 論文賞
Association Membership(s) (5):
SOCIETY OF EVOLUTIONARY STUDIES, JAPAN ,  THE JAPANESE SOCIETY OF PLANT MORPHOLOGY ,  THE BOTANICAL SOCIETY OF JAPAN ,  THE ASSOCIATION OF JAPANESE GEOGRAPHERS ,  JAPANESE SOCIETY FOR PLANT SYSTEMATICS
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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