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J-GLOBAL ID：201801013210684835
Update date: May. 22, 2024
Okiyama Yoshio
Okiyama Yoshio
Affiliation and department：
Research keywords (10)：
interaction analysis
, physical chemistry
, quantum chemistry
, nucleic acid
, protein
, solvent effect
, molecular force field
, molecular dynamics
, in silico drug design
, fragment molecular orbital (FMO) method
Research theme for competitive and other funds (2)：
- 2023 - 2026 Construction of a predictive model for antigen-antibody interaction energies using the FMO database
- 2015 - 2017 Development of high-resolution interaction-energy-space decomposition analysis for the next-generation in silico drug discovery
Papers (52)：
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Kaori Sakaguchi, Yoshio Okiyama, Shigenori Tanaka. In Silico Search for Drug Candidates Targeting the PAX8-PPARγ Fusion Protein in Thyroid Cancer. International Journal of Molecular Sciences. 2024. 25. 10. 5347-5347
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Hirotomo Moriwaki, Yusuke Kawashima, Chiduru Watanabe, Kikuko Kamisaka, Yoshio Okiyama, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma. FMOe: Preprocessing and visualizing package of the fragment molecular orbital method for Molecular Operating Environment and its applications in covalent ligand and metalloprotein analyses. 2024
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Chiduru Watanabe, Shigenori Tanaka, Yoshio Okiyama, Hitomi Yuki, Tatsuya Ohyama, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma. Quantum Chemical Interaction Analysis between SARS-CoV-2 Main Protease and Ensitrelvir Compared with Its Initial Screening Hit. The Journal of Physical Chemistry Letters. 2023. 14. 15. 3609-3620
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Akiko Ohno, Yoshio Okiyama, Akihiko Hirose, Kiyoshi Fukuhara. The position of the nitro group affects the mutagenicity of nitroarenes. Toxicology and Applied Pharmacology. 2022. 441. 115974-115974
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Shigenori Tanaka, Shusuke Tokutomi, Ryo Hatada, Koji Okuwaki, Kazuki Akisawa, Kaori Fukuzawa, Yuto Komeiji, Yoshio Okiyama, Yuji Mochizuki. Dynamic Cooperativity of Ligand-Residue Interactions Evaluated with the Fragment Molecular Orbital Method. The Journal of Physical Chemistry B. 2021. 125. 24. 6501-6512
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MISC (31)：
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渡邉千鶴, 田中成典, 沖山佳生, 大山達也, 神坂紀久子, 幸瞳, 高谷大輔, 福澤薫, 本間光貴. FMO法を用いたSARS-CoV-2メインプロテアーゼ-阻害薬S-217622結合メカニズムの解明. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2022. 50th (CD-ROM)
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堺大輔, 半田佑磨, 平井優樹, 奥脇弘次, 古石誉之, 米持悦生, 沖山佳生, 田中成典, 福澤薫. FMO法を用いたJAK2とイミダゾピロロピリジン系化合物の結合性および選択性評価. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2021. 49th (CD-ROM)
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望月祐志, 望月祐志, 坂倉耕太, 渡邊啓正, 奥脇弘次, 加藤幸一郎, 渡辺尚貴, 沖山佳生, 福澤薫, 福澤薫, et al. FMOプログラムABINIT-MPの整備状況2020. 日本コンピュータ化学会年会講演予稿集. 2020. 2020
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堺大輔, 半田佑磨, 町田大樹, 平井優樹, 奥脇弘次, 沖山佳生, 古石誉之, 福澤薫, 米持悦生. FMO法を用いたJAK2とイミダゾピロロピリジン系化合物の結合性評価. 日本薬学会関東支部大会講演要旨集. 2020. 64th
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山川和也, 飯島洋, 沖山佳生, 古石誉之, 福澤薫, 米持悦生. COMT賦活化における基質認識機構の理論的解析. 日本コンピュータ化学会年会講演予稿集. 2019. 2019
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Lectures and oral presentations (2)：
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フラグメント分子軌道法から古典力場を捉え直す
(第19回創薬インフォマティクス研究会&第11回FMO研究会共催「FMO法に基づいた新規な力場の構築に向けて」 2016)
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FMO計算プログラムABINIT-MPの開発と溶媒効果
(第8回FMO研究会「ナノバイオ分子計算とデザイン」 2014)
Professional career (1)：
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