Matsuda Tomoki

Affiliation and department：

Research field (4)： Molecular biology , Biophysics , Cell biology , Structural biochemistry

Research keywords (1)：蛋白質科学、バイオイメージング、蛍光蛋白質、光遺伝学、構造生物学、細胞間相互作用

Research theme for competitive and other funds (15)：

2023 - 2028 領域研究「細胞外情報を統御するマルチモーダルECM」の統括と運営
2023 - 2028 Development of technology for visualization and optical manipulation of ECM dynamics and infrastructure for in vivo analysis
2020 - 2025 記憶を司るシナプス微小構造の時空間ダイナミクス
2021 - 2024 心筋再生療法のメカニズム究明のための心筋ミトコンドリア機能のイメージング
2021 - 2022 Interplay of developmental clock and extracellular environment in brain formation

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Papers (78)：

Yusuke Hara, Aya Ichiraku, Tomoki Matsuda, Ayuko Sakane, Takuya Sasaki, Takeharu Nagai, Kazuki Horikawa. High-affinity tuning of single fluorescent protein-type indicators by flexible linker length optimization in topology mutant. Communications Biology. 2024. 7. 1
Kai Lu, Tetsuichi Wazawa, Tomoki Matsuda, Daria M. Shcherbakova, Vladislav V. Verkhusha, Takeharu Nagai. Near-infrared PAINT localization microscopy via chromophore replenishment of phytochrome-derived fluorescent tag. Communications Biology. 2024. 7. 1
Tomoki Matsuda, Shinya Sakai, Kei-ichi Okazaki, Takeharu Nagai. Improvement of the Green-Red Förster Resonance Energy Transfer-Based Ca2+ Indicator by Using the Green Fluorescent Protein, Gamillus, with a Trans Chromophore as the Donor. ACS Sensors. 2024
Takashi Kanadome, Natsumi Hoshino, Takeharu Nagai, Takeshi Yagi, Tomoki Matsuda. Protocol to visualize trans-interaction of clustered protocadherin using cIPAD, a fluorescent indicator, in cultured human cells and mouse neurons. STAR Protocols. 2024. 5. 1. 102844-102844
Takashi Kanadome, Natsumi Hoshino, Takeharu Nagai, Takeshi Yagi, Tomoki Matsuda. Visualization of trans-interactions of a protocadherin-α between processes originating from single neurons. iScience. 2023. 26. 7. 107238-107238

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MISC (25)：

京卓志, 永井健治, 松田知己. 蛍光タンパク質プローブによる細胞間相互作用の可視化. 医学のあゆみ. 2023. 286. 5. 329-335
松田知己, 服部満, 永井健治. 蛍光・生物発光タンパク質を利用した機能分子の開発. 材料の科学と工業. 2022. 28. 3. 243-246
松田知己, 永井健治. 多色の光増感蛍光タンパク質を用いた複数機能の個別破壊. 多色の光増感蛍光タンパク質を用いた複数機能の個別破壊. 2020. 4. 4. 61-65
服部満, 松田知己, 永井健治. バイオセンサ. 炎症と免疫. 2020. 28. 3. 243-246
松田知己, 永井健治. 光増感蛍光タンパク質を用いた多色機能破壊. 細胞. 2020. 52. 2. 47-50

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Books (10)：

先端の分析法
エヌ・ティー・エス 2022 ISBN:9784860437374
Optogenetics : light-sensing proteins and their applications in neuroscience and beyond
Springer 2021 ISBN:9811587620
Live cell imaging : methods and protocols
Humana Press 2021 ISBN:9781071612576
発光イメージング実験ガイド : 機能イメージングから細胞・組織・個体まで蛍光で観えないものを観る!
羊土社 2019 ISBN:9784758122405
生きてるものは全部観る!イメージングの選び方・使い方100+
羊土社 2018 ISBN:9784758103756

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Education (4)：

Professional career (2)：

Work history (8)：

2024/04 - 現在 Kitasato University Department of Biosciences, School of Science
2013/09 - 2024/03 Osaka University The Institute of Scientific and Industrial Research
2012/04 - 2013/08 Osaka University The Institute of Scientific and Industrial Research
2008/04 - 2012/03 Hokkaido University Research Institute for Electronic Science
2007/07 - 2008/03 財団法人医療機器センター派遣先:北海道大学電子科学研究所非常勤職員

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Committee career (3)：

Association Membership(s) (4)：

日本分子生物学会 , 日本生物物理学会 , 日本生化学会 , 日本蛋白質科学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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