Kobayashi Naoya

コバヤシナオヤ | Kobayashi Naoya

Homepage URL (1)： https://mswebs.naist.jp/LABs/hirota/index.html

Research field (2)： Biophysics , Molecular biology

Research keywords (9)：タンパク質デザイン , タンパク質工学 , 合成生物学 , タンパク質複合体構造設計 , de novoタンパク質構造設計 , キメラタンパク質構造設計 , タンパク質安定化設計 , 人工遺伝子ライブラリ設計 , de novo protein design

Research theme for competitive and other funds (8)：

2024 - 2026 異種タンパク質の自在な組合せを可能にするキメラタンパク質複合体のボトムアップ設計
2021 - 2025 Comprehensive understanding and application of protein 3D domain swapping
2022 - 2024 Bottom-up construction of protein complexes by computational design focusing on secondary structure motifs
2021 - 2022 多種多様な新規人工タンパク質構造のデザインと網羅的評価系の開発
2020 - 2021 Creation of novel artificial proteins that complement the functions of essential genes

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Papers (10)：

Koya Sakuma, Naohiro Kobayashi, Toshihiko Sugiki, Toshio Nagashima, Toshimichi Fujiwara, Kano Suzuki, Naoya Kobayashi, Takeshi Murata, Takahiro Kosugi, Rie Tatsumi-Koga, et al. Design of complicated all-α protein structures. Nature Structural & Molecular Biology. 2024
Takahiro Sakai, Tsuyoshi Mashima, Naoya Kobayashi, Hideaki Ogata, Lian Duan, Ryo Fujiki, Kowit Hengphasatporn, Taizo Uda, Yasuteru Shigeta, Emi Hifumi, et al. Structural and thermodynamic insights into antibody light chain tetramer formation through 3D domain swapping. Nature communications. 2023. 14. 1. 7807-7807
Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai. Protein Cages and Nanostructures Constructed from Protein Nanobuilding Blocks. Methods in Molecular Biology. 2023. 79-94
Akihiko Nakamura, Naoya Kobayashi, Nobuyasu Koga, Ryota Iino. Positive Charge Introduction on the Surface of Thermostabilized PET Hydrolase Facilitates PET Binding and Degradation. ACS Catalysis. 2021. 11. 8550-8564
Shun Hirota, Tsuyoshi Mashima, Naoya Kobayashi. Use of 3D domain swapping in constructing supramolecular metalloproteins. Chemical Communications. 2021. 57. 91. 12074-12086

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MISC (18)：

小林直也. タンパク質ナノ構造体設計の"標準規格". 現代化学. 2024. 2024年7月. 8
小林直也. タンパク質と他分子の複合体構造を予測するAI・生成するAI. 実験医学. 2024. 42. 3
Naoya Kobayashi, Koya Sakuma. Generative models for proteins in post-AlphaFold era make computational protein design accessible to all. 2023. 41. 16. 2601-2608
小林直也. 標的タンパク質の構造情報のみから結合タンパク質の設計が可能になった. ファルマシア. 2022. 58. 12
小林直也, 川上了史, 新井亮一. 人工タンパク質ナノブロック複合体の設計開発. 生化学. 2019. 91. 255-259

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Patents (2)：

ドメインスワップ二量体人工タンパク質
耐熱性βグルコシダーゼ

Works (1)：

ColabGCNdesign
Naoya Kobayashi 2022 -

Education (3)：

2013 - 2016 信州大学大学院総合工学系研究科生命機能・ファイバー工学専攻
2011 - 2013 信州大学大学院工学系研究科応用生物科学専攻
2007 - 2011 Shinshu University Faculty of Textile Science and Technology Division of Applied Biology

Professional career (1)：

博士(工学) (信州大学)

Work history (7)：

2021/04 - 現在 Nara Institute of Science and Technology Functional Supramolecular Chemistry Laboratory, Division of Materials Science Assistant Professor
2020/04 - 2021/03 日本学術振興会特別研究員(PD)
2018/04 - 2020/03 National Institutes of Natural Sciences
2017/05 - 2018/03 Institute for Molecular Science
2017/04 - 2017/04 Shinshu University Faculty of Textile Science and Technology

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Awards (4)：

2021/06 - 公益社団法人新化学技術推進協会第10回新化学技術研究奨励賞
2020/02 - 公益財団法人井上科学振興財団第36回井上研究奨励賞
2016/08 - 公益社団法人日本生物工学会中部支部 2016年度日本生物工学会中部支部長賞
2016/06 - 一般社団法人日本蛋白質科学会第16回日本蛋白質科学会年会若手研究奨励賞

Association Membership(s) (5)：

Computational Protein Science , 「細胞をつくる」研究会 , 日本化学会バイオテクノロジー部会 , 日本生物物理学会 , 日本蛋白質科学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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