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J-GLOBAL ID:201901004207398307   Update date: Jan. 30, 2024

Kawabata Takeshi

カワバタ タケシ | Kawabata Takeshi
Affiliation and department:
Job title: Specially appointed associate professor
Homepage URL  (1): http://www.sb.ecei.tohoku.ac.jp/lab/members/
Research field  (1): Biophysics
Research theme for competitive and other funds  (7):
  • 2017 - 2021 Multiscale atomic modeling based on electron microscopy 3D map using Gaussian mixture model
  • 2014 - 2017 Comparison and superposition of low-resolution density maps and atomic models using Gaussian mixture model
  • 2010 - 2012 A searching method for interacting chemical compounds for target proteins using 3D structures of compound-protein complexes
  • 2007 - 2008 Analysis of geometric shapes of binding sites on protein-ligand complex for prediction of molecular interactions
  • 2004 - 2004 タンパク質立体構造データベースに基づく分子間相互作用の解析
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Papers (67):
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MISC (12):
  • BEKKER Gert-Jan, KAWABATA Takeshi, KURISU Genji. Biological Structure Model Archive: An archive for computationally obtained data. 生物物理(Web). 2019. 59. Supplement 1-2
  • 木村 大樹, 藤田 幸, 川端 猛, 森 大輔, 岩山 佳美, 岡久 祐子, 池田 匡志, 岩田 仲生, 吉川 武男, 山下 俊英, et al. 統合失調症に強い関連を示した稀な遺伝子変異に基づく精神疾患の分子病態解明. 先進医薬研究振興財団研究成果報告集. 2018. 2017年度. 80-81
  • 木村 大樹, 藤田 幸, 川端 猛, 石塚 佳奈子, Wang Chenyao, 岩山 佳美, 岡久 祐子, 久島 周, 宇野 洋太, 岡田 俊, et al. 統合失調症発症に強い影響を及ぼす、頻度の低い稀な遺伝子変異を22q11.2欠失領域に存在するミエリン関連遺伝子のRTN4Rに同定した. 日本生物学的精神医学会・日本神経精神薬理学会合同年会プログラム・抄録集. 2017. 39回・47回. 190-190
  • A. R. Kinjo, G-J. Bekker, H. Suzuki, Y. Tsuchiya, T. Kawabata, Y. Ikegawa, G. Kurisu, H. Nakamura. Protein Data Bank Japan (PDBj): updated semantic web services and tools for large structures. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS. 2017. 46. S274-S274
  • 木村 大樹, 尾崎 紀夫, 藤田 幸, 川端 猛, 石塚 佳奈子, Wang Chenyao, 岩山 佳美, 岡久 祐子, 久島 周, 森川 真子, et al. 統合失調症発症に強い影響を及ぼす、頻度の低い稀な遺伝子変異を22q11.2欠失領域に存在するミエリン関連遺伝子のRTN4Rに同定した. 精神神経学雑誌. 2017. 2017特別号. S622-S622
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Books (6):
  • 実験医学増刊 Vol.40 No.17 バイオDBとウェブツール ラボで使える最新70選〜知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤
    羊土社 2022 ISBN:4758104069
  • バイオインフォマティクス入門 第2版
    慶應義塾大学出版会 2021 ISBN:4766427912
  • よくわかるバイオインフォマティクス入門 (KS生命科学専門書)
    講談社 2018 ISBN:4065138213
  • 見てわかる構造生命科学: 生命科学研究へのタンパク質構造の利用
    化学同人 2014 ISBN:4759815775
  • タンパク質の立体構造入門--基礎から構造バイオインフォマティクスへ (KS生命科学専門書)
    講談社 2010 ISBN:4061538810
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Professional career (1):
  • Ph.D (Agricultute) (The University of Tokyo)
Awards (1):
  • 2017/09 - The Biophysical Society of Japan Award for Outstanding Biophysics and Physicobiology Paper Takeshi Kawabata, Yusuke Sugihara, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura "LigandBox: A database for 3D structures of chemical compounds" BIOPHYSICS Vol.9 pp.113-121 (2013)
Association Membership(s) (3):
JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS ,  PROTEIN SCIENCE SOCIETY OF JAPAN ,  THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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