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J-GLOBAL ID：201901014265841461
Update date: Nov. 17, 2024
Ogata Kosuke
オガタ コウスケ | Ogata Kosuke
Affiliation and department：
Research field (1)：
Genomics
Research keywords (4)：
Protein phosphorylation
, Liquid chromatography
, Mass spectrometry
, Proteomics
Research theme for competitive and other funds (6)：
Papers (24)：
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Ryohtaroh Matsumoto, Kosuke Ogata, Daisuke Takahashi, Yusuke Kinashi, Takahiro Yamada, Ryo Morita, Keisuke Tanaka, Kouya Hattori, Mayumi Endo, Yumiko Fujimura, et al. AP-1B regulates interactions of epithelial cells and intraepithelial lymphocytes in the intestine. Cellular and Molecular Life Sciences. 2024
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Tsuyoshi Tabata, Akiyasu C Yoshizawa, Kosuke Ogata, Chih-Hsiang Chang, Norie Araki, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama. UniScore, a unified and universal measure for peptide identification by multiple search engines. 2024
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Ayano Nakai-Kasai, Kosuke Ogata, Yasushi Ishihama, Toshiyuki Tanaka. Leveraging Pretrained Deep Protein Language Model to Predict Peptide Collision Cross Section. 2024
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Tatsuya Sagawa, Eisuke Kanao, Kosuke Ogata, Koshi Imami, Yasushi Ishihama. Prediction of Protein Half-lives from Amino Acid Sequences by Protein Language Models. 2024
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Kenko Otonari, Yuri Asami, Kosuke Ogata, Yasushi Ishihama, Shiroh Futaki, Miki Imanishi. Highly sequence-specific, timing-controllable m6A demethylation by modulating RNA-binding affinity of m6A erasers. Chemical Communications. 2024
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MISC (37)：
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富岡郁那, 富岡亮太, 小形公亮, 森一晟, 森一晟, 有田誠, 有田誠, 今見孝志, 杉山直幸, 石濱泰, et al. Spatial Proteome Imaging by Machine-gun Proteomics. 質量分析総合討論会講演要旨集. 2023. 71st
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Kosuke Ogata, Asato Maeda, Yuka Muramarsu, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama. Deep profiling of proteome structural changes with enzymatic reactions. 2022
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小形公亮, 石濱泰. カルシウムイオンの添加によるリン酸化タンパク質のトリプシン消化効率の改善. 第45回日本分子生物学会年会. 2022
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小形公亮, 石濱泰. 小さなセルの大きな世界-高感度分析技術が照らしだすシングルセルプロテオーム. 化学. 2022. 77. 5
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前田朝登, 小形公亮, 杉山直幸, 石濱泰. Sensing protein conformational changes by in vitro phosphorylation tagging. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
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Lectures and oral presentations (28)：
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酵素反応による基質選択的サブプロテオーム解析法の開発
(第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(PPF2023) 2023)
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Enzyme-based marking of proteome structures (EZMAP) to identify structural features of the proteome
(AOMSC-KSMS 2023 2023)
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プロテオームにおける限定的タンパク質消化産物の選択的計測
(第35回バイオメディカル分析科学シンポジウム 2023)
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質量分析によるプロテオーム立体構造解析のための酵素反応の開拓
(日本プロテオーム学会 2023年大会 2023)
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プロテオーム試料を基質とした酵素反応における基質タンパク質構造の影響
(第71回質量分析総合討論会 2023)
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Professional career (1)：
Work history (3)：
- 2024/07 - 現在 Swiss Federal Institute of Technology in Zurich Academic Guest
- 2022/04 - 現在 京都大学大学院薬学研究科 創発医薬科学専攻生体分子計測学分野 助教
- 2019/05 - 2022/03 Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Kyoto University Molecular Cellular Bioanalysis Assistant Professor
Awards (10)：
- 2024/07 - 日本プロテオーム学会 奨励賞 冷却固相抽出法、ナノスケール同重体固相標識法ならびにモチーフ選択的シグナル増幅法による高感度定量リン酸化プロテオミクスの開発
- 2023/09 - PPF2023 第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム 若手研究者奨励賞
- 2023/07 - 第35回バイオメディカル分析科学シンポジウム 星野賞優秀発表賞
- 2023/05 - AOHUPO 2023 travel award
- 2023/03 - 日本質量分析学会 AOMSC2023トラベルグラント
- 2022/11 - HUPO2022 Travel Award
- 2022/06 - 日本質量分析学会 2022年度日本質量分析学会論文賞
- 2021/06 - 10th AOHUPO Presentation Award
- 2020/01 - AOMSC travel award
- 2019/04 - Keystone Scholarship Award
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Association Membership(s) (7)：
ヒトプロテオーム機構
, American Society for Mass Spectrometry
, 日本分子生物学会
, 日本質量分析学会
, クロマトグラフィー科学会
, 日本薬学会
, 日本プロテオーム学会
