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J-GLOBAL ID:202001004641573576   Update date: Sep. 11, 2024

Fujiwara Toyofumi

フジワラ トヨフミ | Fujiwara Toyofumi
Affiliation and department:
Other affiliations (1):
Research field  (2): Biological, health, and medical informatics ,  Medical systems
Research keywords  (6): genetic disorder ,  難病 ,  rare disease ,  phenotype ,  AI ,  database
Research theme for competitive and other funds  (6):
  • 2024 - 2027 Research on medical implementation of rapid genetic diagnosis for sick newborn infants
  • 2023 - 2026 国際共有を前提とした症例情報統合化技術の開発
  • 2022 - 2025 日本語の症例報告への自動アノテーション技術の開発
  • 2021 - 2024 希少・遺伝性疾患の個別化医療および研究推進に向けた症例データベースの構築と公開
  • 2020 - 2023 希少・難治性疾患のゲノム医療推進に資する情報基盤の高度化とその応用
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Papers (16):
  • 高月 照江, 池田 秀也, 井手 隆広, 大田 達郎, 小野 浩雅, 片山 俊明, 川島 秀一, 申 在紋, 建石 由佳, 千葉 啓和, et al. 統合データベース探索フレームワークTogoDXの開発とその応用. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • 池田 秀也, 千葉 啓和, 藤原 豊史, 五斗 進, 井手 隆広, 川島 秀一, 箕輪 真理, 三橋 信孝, 守屋 勇樹, 内藤 雄樹, et al. TogoID: データベース統合の基盤となるID変換サービス. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • Yasunori Yamamoto, Toyofumi Fujiwara. Online tools for efficient paper writing. Human Genome Variation. 2022. 9. 1
  • Toyofumi Fujiwara, Jae-Moon Shin, Atsuko Yamaguchi. Advances in the development of PubCaseFinder, including the new application programming interface and matching algorithm. Human Mutation. 2022
  • Atsuko Yamaguchi, Jae-Moon Shin, Toyofumi Fujiwara. Gene Ranking based on Paths from Phenotypes to Genes on Knowledge Graph. The 10th International Joint Conference on Knowledge Graphs. 2021. 131-134
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MISC (16):
  • 地引 芳乃, 浅野 由衣, 仁宮 洸太, 申 在紋, 佐々木 貴規, 菊池 敦生, 藤原 豊史. 症例情報管理システムの構築と公開. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • A platform for integration and international sharing of the diverse knowledge of rare diseases. The CELL. 2021. 53. 13. 834-839
  • 仁宮 洸太, 高月 照江, 菊池 敦生, 櫛田 達矢, 山田 涼太, 浅野 由衣, 山本 泰智, Orion Buske, 片山 俊明, 桝屋 啓志, et al. 日本の難病に関する中心的基盤となる難病オントロジーNANDOと難病ポータルサイトNanbyoDataの正式リリース. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • 地引 芳乃, 土肥 栄祐, 仁宮 洸太, 建石 由佳, 山本 泰智, 佐々木 貴規, 藤原 豊史. 診療録からの症状半自動抽出システム「POET」の開発. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • Diagnosis Support for Rare and Genetic Diseases Using Ontologies. 2020. 35. 4. 480-486
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Books (4):
  • 実験医学 2024年1月号 Vol.42 No.1
    羊土社 2024
  • みんなのバイオDX 実験医学 2021年12月号 Vol.39 No.19
    羊土社 2021
  • バリアントデータ検索&活用変異・多型情報を使いこなす達人レシピ 実験医学別冊
    羊土社 2020
  • Precision Medicine 2019年12月臨時増刊号
    北隆館 2019
Lectures and oral presentations  (56):
  • Advancements and prospects of PubCaseFinder, a generic name for three services related to rare and genetic diseases
    (2023)
  • Building of the Nanbyo Disease Ontology (NANDO) and portal site for intractable disease information(NanbyoData)
    (2023)
  • PubCaseFinder: Advancements and Prospects in Rare and Genetic Disease Search Services
    (2023)
  • PubCaseFinder: 希少・遺伝性疾患に特化した症例情報管理システムの開発
    (第30回日本遺伝子診療学会大会 2023)
  • PubCaseFinder CaseSharing: A management system for case information on rare diseases
    (2023)
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Works (5):
  • PanelSearch
    Toyofumi Fujiwara 2023 - 現在
  • CaseSharing
    Toyofumi Fujiwara 2023 - 現在
  • Nanbyo Disease Ontology
    Toyofumi Fujiwara 2020 -
  • NanbyoData
    Toyofumi Fujiwara 2020 -
  • PubCaseFinder
    Toyofumi Fujiwara 2017 -
Education (1):
  • 2015 - 2018 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻
Professional career (1):
  • 博士(医科学) (東京大学)
Work history (6):
  • 2024/04 - 現在 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 バイオデータ研究拠点 特任准教授
  • 2024/04 - 現在 Joint Support-Center for Data Science Research, Research Organization of Information and Systems Database Center for Life Science
  • 2023/12 - 現在 国立研究開発法人国立国際医療研究センター ゲノム医科学プロジェクト 客員研究員
  • 2023/12 - 2024/03 National Center of Neurology and Psychiatry
  • 2019/04 - 2024/03 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任助教
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Awards (2):
  • 2021/10 - 日本人類遺伝学会第66回大会 / 第28回日本遺伝子診療学会大会 大会賞 診療録からの症状半自動抽出システムPOETの開発
  • 2019/10 - American Society of Human Genetics Reviewers' Choice Abstracts PubCaseFinder and PhenoTouch for differential diagnosis in rare disease.
Association Membership(s) (2):
日本人類遺伝学会 ,  日本遺伝子診療学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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