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J-GLOBAL ID：202001009091740650
Update date: Oct. 07, 2024
Kokaji Toshiya
コカジ トシヤ | Kokaji Toshiya
Affiliation and department：
Research field (2)：
Biological, health, and medical informatics
, Systems genomics
Research theme for competitive and other funds (1)：
- 2021 - 2024 Transomics analysis of glucose-responsive metabolic regulation through crosstalk between the liver and muscle and its alterations associated with obesity
Papers (17)：
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Yifei Pan, Atsushi Hatano, Satoshi Ohno, Keigo Morita, Toshiya Kokaji, Yunfan Bai, Hikaru Sugimoto, Riku Egami, Akira Terakawa, Dongzi Li, et al. Time and dose selective glucose metabolism for glucose homeostasis and energy conversion in the liver. npj Systems Biology and Applications. 2024. 10. 1
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Chen Xing, Yuichi Sakumura, Toshiya Kokaji, Katsuyuki Kunida, Noriaki Sasai. Stepwise Bayesian Machine Learning Uncovers a Novel Gene Regulatory Network Component in Neural Tube Development. 2024
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Yunfan Bai, Keigo Morita, Toshiya Kokaji, Atsushi Hatano, Satoshi Ohno, Riku Egami, Yifei Pan, Dongzi Li, Katsuyuki Yugi, Saori Uematsu, et al. Trans-omic analysis reveals opposite metabolic dysregulation between feeding and fasting in liver associated with obesity. iScience. 2024. 27. 3. 109121-109121
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Agnes Lee Chen Ong, Toshiya Kokaji, Arisa Kishi, Yoshihiro Takihara, Takuma Shinozuka, Ren Shimamoto, Ayako Isotani, Manabu Shirai, Noriaki Sasai. Erratum: Acquisition of neural fate by combination of BMP blockade and chromatin modification. iScience. 2023. 26. 11. 108257-108257
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Hideki Maehara, Toshiya Kokaji, Atsushi Hatano, Yutaka Suzuki, Masaki Matsumoto, Keiichi I. Nakayama, Riku Egami, Takaho Tsuchiya, Haruka Ozaki, Keigo Morita, et al. DNA hypomethylation characterizes genes encoding tissue-dominant functional proteins in liver and skeletal muscle. Scientific Reports. 2023. 13. 1
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MISC (4)：
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小鍛治 俊也, 幡野 敦, 柚木 克之, 黒田 真也. 【マルチオミクスを使って得られた最新知見 糖尿病・がん・腸内細菌研究における実例と解析法】マウス肝臓における肥満特異的な代謝制御トランスオミクスネットワーク構築. 実験医学. 2020. 38. 8. 1289-1294
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黒田 真也, 小鍛治 俊也, 伊藤 有紀, 幡野 敦, 山本 香織, 柚木 克之, 中山 敬一, 松本 雅記, 曽我 朋義. インスリン作用のトランスオミクス解析. 糖尿病. 2016. 59. Suppl.1. S-334
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小鍛治 俊也, 久保田 浩行, 伊藤 有紀, 柚木 克之, 藤井 雅史, 宇田 新介, 国田 勝行, 曽我 朋義, 黒田 真也. 健常および肥満マウスの肝臓および筋肉におけるグルコース負荷に対する代謝変動の網羅的解析. 日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集. 2015. 88回・38回. [2P0851]-[2P0851]
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佐野 貴規, 川田 健太郎, 角田 裕晶, 久保田 浩行, 柚木 克之, 宇田 新介, 国田 勝行, 小鍛治 俊也, 鈴木 穣, 黒田 真也. RNA-Seqを用いたインスリン依存的選択的スプライシング変動の網羅的解析. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2013. 86回. 1P-310
Lectures and oral presentations (2)：
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ウェット研究者のための「オミクスデータからパスウェイ仮説を立てる」
(第71回日本実験動物学会総会 2024)
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Comparative transomic analysis of glucose-responsive regulation of liver metabolism in obese ob/ob and wild-type mice
(第44回日本分子生物学会年会 2021)
Education (3)：
- 2014 - 2018 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻
- 2012 - 2014 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻
- 2008 - 2012 The University of Tokyo Faculty of Science Undergraduate Program for Bioinformatics and Systems Biology
Work history (2)：
- 2021/04 - 現在 Nara Institute of Science and Technology
- 2018/04 - 2021/03 The University of Tokyo Graduate School of Science
Association Membership(s) (3)：
日本オミックス医学会
, 分子生物学会
, 日本バイオインフォマティクス学会
