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J-GLOBAL ID：202001014442288795   Update date: May. 29, 2024

Okahashi Nobuyuki

オカハシ ノブユキ | Okahashi Nobuyuki
Affiliation and department：
Osaka University Graduate School of Information Science and Technology

About Osaka University Graduate School of Information Science and Technology


Other affiliations (1)：
  • RIKEN  RIKEN Center for Integrative Medical Sciences 
Research field  (2)： Systems genomics ,  Applied biofunctional and bioprocess engineering
Research keywords  (5)： Metabolic engineering ,  Gut microbiome ,  Cancer metabolism ,  Mass spectrometry ,  13C metabolic flux analysis
Research theme for competitive and other funds  (5)：
  • 2020 - 2023 13C代謝フラックス解析を用いた分化細胞の代謝計測と運命制御
  • 2020 - 2023 微生物の新規代謝物-酵素遺伝子の統合オミクス推定法の開発
  • 2021 - 代謝フラックス解析を用いたがん幹細胞特異的代謝の解明
  • 2017 - 2019 Elucidation of the resolution mechanism of inflammation via central carbon metabolism and 12/15-lipoxygenase in eosinophil
  • 2015 - 2017 遊離代謝物を用いた13C代謝フラックス解析法の構築と動物細胞代謝プロセスへの応用
Papers (37)：
  • Takeo Taniguchi, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda. 13C-metabolic flux analysis reveals metabolic rewiring in HL-60 neutrophil-like cells through differentiation and immune stimulation. Metabolic Engineering Communications. 2024. e00239-e00239
  • Chinatsu Matsuyama, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Teppei Niide, Kiyotaka Y. Hara, Yoko Hirono-Hara, Jun Ishii, Hiroshi Shimizu, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda. Metabolome analysis of metabolic burden in Escherichia coli caused by overexpression of green fluorescent protein and delta-rhodopsin. Journal of Bioscience and Bioengineering. 2024. 137. 3. 187-194
  • Masahiko Sugimura, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Jun Ishii, Fumio Matsuda. Improved 2,3-Butanediol Production Rate of Metabolically Engineered Saccharomyces cerevisiae by Deletion of RIM15 and Activation of Pyruvate Consumption Pathway. International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24. 22. 16378-16378
  • Kazuki Nishimoto, Nobuyuki Okahashi, Masaharu Maruyama, Yoshihiro Izumi, Kohta Nakatani, Yuki Ito, Junko Iida, Takeshi Bamba, Fumio Matsuda. Lipidome and metabolome analyses reveal metabolic alterations associated with MCF-7 apoptosis upon 4-hydroxytamoxifen treatment. Scientific Reports. 2023. 13. 1
  • Futa Yatabe, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Jun Ishii, Fumio Matsuda. Improvement of ethanol and 2,3-butanediol production in Saccharomyces cerevisiae by ATP wasting. Microbial Cell Factories. 2023. 22. 1
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MISC (12)：
  • Takeo Taniguchi, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda. Development of 13C-Metabolic Flux Analysis for HL-60 Neutrophil-like Cell Using GC-MS. Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan. 2023. 71. 4. 155-159
  • 岡橋伸幸. 宿主受容体に作用する腸内細菌代謝物. 生物工学会誌. 2023. 101. 11. 597-597
  • 腸内細菌が産生する脂質代謝物の構造と機能. Journal of Japanese Biochemical Society. 2023. 95. 4. 428-435
  • Yuki Yamada, Keita Murakami, Nobuyuki Okahashi, Atsuhiko Toyama, Junko Iida, Fumio Matsuda. 13C-tracer Analysis of Phospholipids by LC-QTOF/MS. Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan. 2022. 70. 4. 241-244
  • 岡橋伸幸, 有田誠. 腸内細菌が生成する脂質代謝物の構造と機能. 肥満研究. 2022. 28. 1. 10-15
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Patents (2)：
  • 情報処理方法、情報処理装置、及びプログラム
  • 同位体分布データ作成方法
Books (6)：
  • 決定版質量分析活用スタンダード : 代謝物からタンパク質、食品・環境の分析まで質量分析のポテンシャルを活かしきる戦略とプロトコール
    羊土社 2023 ISBN:9784758122641
  • Mass Spectrometry for Lipidomics: Methods and Applications
    2023 ISBN:3527350152
  • メタボロミクス実践ガイド
    羊土社 2021 ISBN:9784758122511
  • メタボロミクス実践ガイド
    羊土社 2021 ISBN:9784758122511
  • ヒトマイクロバイオーム Vol.2 解析技術の進展とデータ駆動型・ターゲット機能型研究最前線
    NTS(エヌ・ティー・エス) 2020 ISBN:9784860436599
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Lectures and oral presentations  (29)：
  • 微生物代謝物の網羅計測とゲノムデータとの統合
    (日本微生物生態学会第36回浜松大会 2023)
  • シーケンシングデータを取った後の解析 ~オミクスデータの統合解析事例~
    (NGS expo 2023 2023)
  • DIAリピドミクスを用いた低温ストレス下の出芽酵母の脂質解析
    (第17回メタボロームシンポジウム 2023)
  • Untargeted analysis of microbial metabolites using mass spectrometry
    (3rd International BMS Symposium 2023 in Kyoto 2023)
  • グラム陰性腸内細菌のLipid Aの構造解析
    (第75回日本生物工学会大会 2023)
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Works (1)：
  • Isotope Calculation Gadgets
    2021 -
Education (3)：
  • 2014 - 2017 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering
  • 2012 - 2014 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering
  • 2008 - 2012 Osaka University School of Engineering
Professional career (3)：
  • 博士(情報科学) (大阪大学)
  • 修士(情報科学) (大阪大学)
  • 学士(工学) (大阪大学)
Work history (5)：
  • 2019/12 - 現在 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering Associate professor
  • 2018/04 - 現在 RIKEN RIKEN Center for Integrative Medical Sciences Guest researcher
  • 2018/04 - 2019/11 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering Assistant professor
  • 2017/04 - 2018/03 RIKEN RIKEN Center for Integrative Medical Sciences Researcher
  • 2015/04 - 2017/03 Japan Society for the Promotion of Science
Committee career (17)：
  • 2023/12 - 現在 生物工学会関西支部 若手企画委員
  • 2019 - 現在 日本生物工学会 バイオインフォマティクス相談部会 運営委員
  • 2018 - 現在 日本生物工学会 バイオ計測サイエンス研究部会 運営委員
  • 2023/10 - 第17回メタボロームシンポジウム 実行委員
  • 2023/05 - 第71回質量分析総合討論会 実行委員
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Awards (5)：
  • 2016/03 - 化学工学会 第81年会本部大会学生賞 最優秀学生賞
  • 2015/06 - 日本質量分析学会 第63回質量分析総合討論会ベストプレゼンテーション賞 ポスター発表部門優秀賞
  • 2015/03 - 化学工学会 第80年会本部大会学生賞 特別賞
  • 2014/10 - 日本生物工学会 第3回飛翔賞
  • 2014/05 - 日本質量分析学会 第62回質量分析総合討論会ベストプレゼンテーション賞 優秀賞
Association Membership(s) (4)：
日本農芸化学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本質量分析学会 ,  日本生物工学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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