Okahashi Nobuyuki

オカハシノブユキ | Okahashi Nobuyuki

Affiliation and department：
Other affiliations (1)：

RIKEN RIKEN Center for Integrative Medical Sciences

Research field (2)： Systems genomics , Applied biofunctional and bioprocess engineering

Research keywords (5)： Metabolic engineering , Gut microbiome , Cancer metabolism , Mass spectrometry , 13C metabolic flux analysis

Research theme for competitive and other funds (5)：

2020 - 2023 13C代謝フラックス解析を用いた分化細胞の代謝計測と運命制御
2020 - 2023 微生物の新規代謝物-酵素遺伝子の統合オミクス推定法の開発
2021 - 代謝フラックス解析を用いたがん幹細胞特異的代謝の解明
2017 - 2019 Elucidation of the resolution mechanism of inflammation via central carbon metabolism and 12/15-lipoxygenase in eosinophil
2015 - 2017 遊離代謝物を用いた13C代謝フラックス解析法の構築と動物細胞代謝プロセスへの応用

Papers (38)：

Munehiro Furuichi, Takaaki Kawaguchi, Marie-Madlen Pust, Keiko Yasuma-Mitobe, Damian R. Plichta, Naomi Hasegawa, Takashi Ohya, Shakti K. Bhattarai, Satoshi Sasajima, Yoshimasa Aoto, et al. Commensal consortia decolonize Enterobacteriaceae via ecological control. Nature. 2024. 633. 878-886
Takeo Taniguchi, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda. 13C-metabolic flux analysis reveals metabolic rewiring in HL-60 neutrophil-like cells through differentiation and immune stimulation. Metabolic Engineering Communications. 2024. e00239-e00239
Chinatsu Matsuyama, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Teppei Niide, Kiyotaka Y. Hara, Yoko Hirono-Hara, Jun Ishii, Hiroshi Shimizu, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda. Metabolome analysis of metabolic burden in Escherichia coli caused by overexpression of green fluorescent protein and delta-rhodopsin. Journal of Bioscience and Bioengineering. 2024. 137. 3. 187-194
Masahiko Sugimura, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Jun Ishii, Fumio Matsuda. Improved 2,3-Butanediol Production Rate of Metabolically Engineered Saccharomyces cerevisiae by Deletion of RIM15 and Activation of Pyruvate Consumption Pathway. International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24. 22. 16378-16378
Kazuki Nishimoto, Nobuyuki Okahashi, Masaharu Maruyama, Yoshihiro Izumi, Kohta Nakatani, Yuki Ito, Junko Iida, Takeshi Bamba, Fumio Matsuda. Lipidome and metabolome analyses reveal metabolic alterations associated with MCF-7 apoptosis upon 4-hydroxytamoxifen treatment. Scientific Reports. 2023. 13. 1

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MISC (13)：

岡橋伸幸. 腸内細菌代謝物のノンターゲットメタボロミクス. ファルマシア. 2024. 60. 7. 658-662
Takeo Taniguchi, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda. Development of 13C-Metabolic Flux Analysis for HL-60 Neutrophil-like Cell Using GC-MS. Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan. 2023. 71. 4. 155-159
岡橋伸幸. 宿主受容体に作用する腸内細菌代謝物. 生物工学会誌. 2023. 101. 11. 597-597
腸内細菌が産生する脂質代謝物の構造と機能. Journal of Japanese Biochemical Society. 2023. 95. 4. 428-435
Yuki Yamada, Keita Murakami, Nobuyuki Okahashi, Atsuhiko Toyama, Junko Iida, Fumio Matsuda. 13C-tracer Analysis of Phospholipids by LC-QTOF/MS. Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan. 2022. 70. 4. 241-244

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Patents (2)：

情報処理方法、情報処理装置、及びプログラム
同位体分布データ作成方法

Books (6)：

決定版質量分析活用スタンダード : 代謝物からタンパク質、食品・環境の分析まで質量分析のポテンシャルを活かしきる戦略とプロトコール
羊土社 2023 ISBN:9784758122641
Mass Spectrometry for Lipidomics: Methods and Applications
2023 ISBN:3527350152
メタボロミクス実践ガイド
羊土社 2021 ISBN:9784758122511
メタボロミクス実践ガイド
羊土社 2021 ISBN:9784758122511
ヒトマイクロバイオーム Vol.2 解析技術の進展とデータ駆動型・ターゲット機能型研究最前線
NTS(エヌ・ティー・エス) 2020 ISBN:9784860436599

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Lectures and oral presentations (33)：

Comprehensive analysis of microbial lipidome using untargeted mass spectrometry
(Tohoku Forum for Creativity, Designing Foods for the Future 2024)
低温ストレス応答下のSaccharomyces cerevisiaeの包括的脂質解析
(第76回日本生物工学会大会 2024)
13C-metabolic flux analysis of glycerolipid metabolism in Saccharomyces cerevisiae
(Metabolomics 2024 2024)
Data-independent acquisitionリピドミクスを用いたグリセロ脂質代謝経路の13C代謝フラックス解析法の開発
(第72回質量分析総合討論会 2024)
微生物代謝物の網羅計測とゲノムデータとの統合
(日本微生物生態学会第36回浜松大会 2023)

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Works (1)：

Isotope Calculation Gadgets
2021 -

Education (3)：

2014 - 2017 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering
2012 - 2014 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering
2008 - 2012 Osaka University School of Engineering

Professional career (3)：

博士(情報科学) (大阪大学)
修士(情報科学) (大阪大学)
学士(工学) (大阪大学)

Work history (5)：

2019/12 - 現在 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering Associate professor
2018/04 - 現在 RIKEN RIKEN Center for Integrative Medical Sciences Guest researcher
2018/04 - 2019/11 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering Assistant professor
2017/04 - 2018/03 RIKEN RIKEN Center for Integrative Medical Sciences Researcher
2015/04 - 2017/03 Japan Society for the Promotion of Science

Committee career (17)：

2023/12 - 現在生物工学会関西支部若手企画委員
2019 - 現在日本生物工学会バイオインフォマティクス相談部会運営委員
2018 - 現在日本生物工学会バイオ計測サイエンス研究部会運営委員
2023/10 - 第17回メタボロームシンポジウム実行委員
2023/05 - 第71回質量分析総合討論会実行委員

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Awards (5)：

2016/03 - 化学工学会第81年会本部大会学生賞最優秀学生賞
2015/06 - 日本質量分析学会第63回質量分析総合討論会ベストプレゼンテーション賞ポスター発表部門優秀賞
2015/03 - 化学工学会第80年会本部大会学生賞特別賞
2014/10 - 日本生物工学会第3回飛翔賞
2014/05 - 日本質量分析学会第62回質量分析総合討論会ベストプレゼンテーション賞優秀賞

Association Membership(s) (4)：

日本農芸化学会 , 日本分子生物学会 , 日本質量分析学会 , 日本生物工学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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