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J-GLOBAL ID:202001015283710975   Update date: Jan. 17, 2025

Kento Kasahara

Kento Kasahara
Affiliation and department:
Research field  (2): Basic physical chemistry ,  Bio-, chemical, and soft-matter physics
Research keywords  (9): Molecular dynamics simulation ,  混雑環境 ,  生物物理学 ,  ダイナミクス理論 ,  理論化学 ,  物理化学 ,  分子性統計力学 ,  液体の積分方程式理論 ,  溶液化学
Research theme for competitive and other funds  (7):
  • 2022 - 2027 クライオ電顕によるDOCKシグナロソームの動的構造の解明
  • 2023 - 2026 分子動力学と分光実験に基づく膜透過現象に対する共溶媒効果の究明
  • 2021 - 2026 Cross-scale data-driven modeling of biomolecular dynamics in the cells
  • 2023 - 2024 Dynamics analysis of cosolvent effects on membrane permeation processes
  • 2022 - 2023 Dynamics analysis of the effects of heterogeneous environments on protein-substrate binding processes
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Papers (33):
  • Kazuya Okita, Yusei Maruyama, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi. Flexible framework of computing binding free energy using the energy representation theory of solution. The Journal of Chemical Physics. 2025. 162. 3. 034103
  • Stefan Hervø-Hansen, Kazuya Okita, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi. Solvent-Environment Dependence of the Excess Chemical Potential and Its Computation Scheme Formulated through Error Minimization. Journal of Chemical Theory and Computation. 2025. in press
  • Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi. Molecular theory of membrane permeation phenomena. Journal of the Japan Association of Solution Chemistry. 2024. 6. 21-30
  • Yuya Matsubara, Ryo Okabe, Ren Masayama, Nozomi Morishita Watanabe, Hiroshi Umakoshi, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi. A methodology of quantifying membrane permeability based on returning probability theory and molecular dynamics simulation. The Journal of Chemical Physics. 2024. 161. 2
  • Kokoro Shikata, Kento Kasahara, Nozomi Morishita Watanabe, Hiroshi Umakoshi, Kang Kim, Nobuyuki Matubayasi. Influence of cholesterol on hydrogen-bond dynamics of water molecules in lipid-bilayer systems at varying temperatures. The Journal of Chemical Physics. 2024. 161. 1
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Lectures and oral presentations  (15):
  • 分子動力学と2分子反応理論に基づく 分子会合過程の記述
    (次世代若手研究者による応用計算・理論化学研究会2023 2024)
  • Protein-ligand binding kinetics based on diffusion-influenced reaction theory and molecular dynamics
    (Telluride Workshop 2024)
  • Atomistic description of molecular binding kinetics based on returning probability theory and molecular dynamics
    (UCR (University of California, Riverside) Chemistry Department Seminar 2023)
  • 分子動力学と統計力学に基づくタンパク質-リガンド結合の速度論解析
    (文部科学省 スーパーコンピュータ「富岳」成果創出加速プログラム 「物理-化学連携による持続的成長に向けた高機能・長寿命材料の探索・制御」 研究フォーラム(第1回) 2023)
  • Elucidating Protein-Ligand Binding Kinetics Based on Bimolecular Reaction Theory
    (The 6th International Conference on Molecular Simulation (ICMS) 2023)
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Education (2):
  • 2014 - 2018 京都大学大学院 工学研究科 分子工学専攻 博士課程
  • 2012 - 2014 京都大学大学院 工学研究科 分子工学専攻 修士課程
Work history (4):
  • 2020/04 - 現在 Osaka University
  • 2023/11 - 2023/12 University of California Riverside Department of Chemistry Visiting Scholar
  • 2018/04 - 2020/03 RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research Laboratory for Biomolecular Function Simulation Research scientist
  • 2015/04 - 2017/03 Japan Society for the Promotion of Science
Committee career (2):
  • 2023/04 - 現在 溶液化学研究会若手の会 実行委員
  • 2021/06 - 現在 溶液化学研究会 編集委員
Awards (4):
  • 2022/10 - 溶液化学研究会 溶液化学研究会奨励賞 溶液統計力学と分子動力学に基づく分子会合過程の理論的解析
  • 2016/10 - 分子科学会 第10回分子科学討論会 分子科学会優秀講演賞 分子性液体における拡散律速反応
  • 2016/06 - 理論化学研究会(現 理論化学会) 第19回理論化学討論会 最優秀ポスター賞 分子性液体における拡散律速反応ダイナミクス
  • 2013/10 - 溶液化学研究会 第36回溶液化学シンポジウム ポスター賞 SSSV方程式の三次元化および電解質溶液への適用
Association Membership(s) (5):
日本生物物理学会 ,  蛋白質科学会 ,  溶液化学研究会 ,  分子科学会 ,  日本化学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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