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J-GLOBAL ID:202101001861606996   Update date: Jan. 18, 2023

Okada Daigo

オカダ ダイゴ | Okada Daigo
Affiliation and department:
Research field  (4): Statistical science ,  Genomics ,  Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics
Research keywords  (3): aging ,  Statistical Genetics ,  Computational Biology
Research theme for competitive and other funds  (4):
  • 2021 - 2023 幾何学と関数データ解析による医学・生命科学の時空間データマイニング
  • 2021 - 2021 2021年度第I期若手研究者スタートアップ研究費
  • 2019 - 2021 情報幾何を用いた、細胞集団プロファイルの異同とその生物学的背景の統合解析
  • 2020 - 2021 1細胞発現データセットを対象とした機械学習
Papers (10):
  • Daigo Okada, Cheng Zheng, Jian Hao Cheng. Mathematical model for the relationship between single-cell and bulk gene expression to clarify the interpretation of bulk gene expression data. Computational and structural biotechnology journal. 2022. 20. 4850-4859
  • Daigo Okada, Yosuke Okamoto, Toshiro Io, Miho Oka, Daiki Kobayashi, Suzuka Ito, Ryo Yamada, Kuniaki Ishii, Kyoichi Ono. Comparative Study of Transcriptome in the Hearts Isolated from Mice, Rats, and Humans. Biomolecules. 2022. 12. 6
  • Daigo Okada, Cheng Zheng, Jian Hao Cheng, Ryo Yamada. Cell population-based framework of genetic epidemiology in the single-cell omics era. BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. 2021. e2100118
  • Daigo Okada, Jian Hao Cheng, Cheng Zheng, Ryo Yamada. Data-driven comparison of multiple high-dimensional single-cell expression profiles. Journal of human genetics. 2021
  • Daigo Okada, Naotoshi Nakamura, Kazuya Setoh, Takahisa Kawaguchi, Koichiro Higasa, Yasuharu Tabara, Fumihiko Matsuda, Ryo Yamada. Genome-wide association study of individual differences of human lymphocyte profiles using large-scale cytometry data. Journal of human genetics. 2020. 66. 6. 557-567
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MISC (3):
  • 岡田大瑚. 「注目論文:Our Focus on Genetics」大規模サイトメトリーデータを用いた、ヒトリンパ球プロファイルの個人差を対象とするゲノムワイド関連解析. 2021
  • 岡田大瑚, 中村直俊, 瀬藤和也, 川口喬久, 奈良原舞子, 日笠幸一郎, 田原康玄, 松田文彦, 山田亮. 多次元尺度法を用いたフローサイトメトリーデータからの特徴統計量の抽出およびトランスクリプトームデータとの対応関係の評価. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2016. 39th
  • 中村直俊, 岡田大瑚, 瀬藤和也, 川口喬久, 奈良原舞子, 日笠幸一郎, 田原康玄, 松田文彦, 山田亮. 多次元フローサイトメトリーデータの分布異同定量に基づくヒト免疫応答の個人差の解析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2016. 39th
Lectures and oral presentations  (25):
  • Delve into inter-gene-set relationships using single-cell transcriptomic data
    (2022)
  • ATAC shape information provided biological insight
    (2022)
  • A mathematical model for the relationship between single cell expression profile and the bulk gene expression analysis
    (2022)
  • Information geometric approach to embed multiple single cell expression profiles into low dimensional coordinate space
    (Pacifichem 2021 2021)
  • Search and classification of DNA methylation biomarkers of aging focusing on nonlinear age-related changes
    (2021)
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Education (4):
  • 2018 - 2021 京都大学大学院 医学研究科 医科学専攻 博士課程
  • 2016 - 2018 京都大学大学院 医学研究科 医科学専攻 修士課程
  • 2012 - 2016 Kyoto University Faculty of Agriculture Faculty of Agriculture
  • 2009 - 2012 海城高等学校
Professional career (3):
  • 博士(医科学) (京都大学)
  • 修士(医科学) (京都大学)
  • 学士(農学) (京都大学)
Work history (2):
  • 2021/04 - 現在 京都大学大学院医学研究科 ゲノム医学センター 助教
  • 2019/04 - 2021/03 日本学術振興会特別研究員DC2
Awards (1):
  • 2021 - 第2回京都大学医薬系研究交流サロン Best Presentation Award
Association Membership(s) (5):
日本基礎老化学会 ,  日本分子生物学会 ,  酵母遺伝学フォーラム ,  日本人工知能学会 ,  日本人類遺伝学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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