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J-GLOBAL ID：202201019189007241
Update date: Nov. 19, 2024
Mizutani Sayaka
Mizutani Sayaka | Mizutani Sayaka
Affiliation and department：
Job title：
JSPS Research Fellow
Research field (4)：
Systems genomics
, Tumor biology
, Genomics
, Biological, health, and medical informatics
Research keywords (9)：
Bioinformatics
, Colorectal cancer
, Gut microbiome
, 口腔内細菌
, 免疫チェックポイント阻害剤
, Side effect
, Metagenome
, メタトランスクリプトーム解析
, メタボローム解析
Research theme for competitive and other funds (3)：
- 2019 - 2023 個人多様性を考慮した腸内環境状態遷移モデルの構築による大腸がんリスク要因の解明
- 2019 - 2023 大腸がんの内視鏡生検検体を用いた腸内細菌機能の定量化による発がんへの関与の解明
- 2016 - 2019 ヒト腸内環境超多次元データの統合による大腸がんシグナル検出
Papers (25)：
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Sayaka Mizutani, Ayako Tamaki, Satoshi Shiba, Felix Salim, Masayoshi Yamada, Hiroyuki Takamaru, Takeshi Nakajima, Naohisa Yoshida, Shoko Ikuta, Tatsuo Yachida, et al. Dynamics of the gut microbiome in FAP patients undergoing intensive endoscopic reduction of polyp burden. Gut. 2024. gutjnl-2024
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Felix Salim, Sayaka Mizutani, Satoshi Shiba, Hiroyuki Takamaru, Masayoshi Yamada, Takeshi Nakajima, Tatsuo Yachida, Tomoyoshi Soga, Yutaka Saito, Shinji Fukuda, et al. Fusobacterium species are distinctly associated with patients with Lynch Syndrome colorectal cancer. iScience. 2024. 110181-110181
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Nobuhiro Narii, Ling Zha, Tomotaka Sobue, Tetsuhisa Kitamura, Masayo Komatsu, Yoshimitsu Shimomura, Satoshi Shiba, Sayaka Mizutani, Takuji Yamada, Shinichi Yachida. Intestinal Bacteria Fluctuating in Early-Stage Colorectal Cancer Carcinogenesis are Associated with Diet in Healthy Adults. Nutrition and cancer. 2024. 1-8
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Ryza Rynazal, Kota Fujisawa, Hirotsugu Shiroma, Felix Salim, Sayaka Mizutani, Satoshi Shiba, Shinichi Yachida, Takuji Yamada. Leveraging explainable AI for gut microbiome-based colorectal cancer classification. Genome biology. 2023. 24. 1. 21-21
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Felix Salim, Sayaka Mizutani, Moreno Zolfo, Takuji Yamada. Recent advances of machine learning applications in human gut microbiota study: from observational analysis toward causal inference and clinical intervention. Current opinion in biotechnology. 2023. 79. 102884-102884
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MISC (21)：
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山田 拓司, Erawijantari Pande, 水谷 紗弥佳, 城間 博紹. 近未来の臨床応用に向けたゲノム解析 胃がん治療のための胃切除による腸内細菌や代謝産物への影響. 日本癌学会総会記事. 2021. 80th. [S11-4]
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水谷紗弥佳, 水谷紗弥佳, 山田拓司, 山田拓司, 山田拓司, 山田拓司. Oral microbiota in colorectal cancer progression model. 実験医学. 2021. 39. 16. 2527-2531
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水谷紗弥佳, 水谷紗弥佳, 山田拓司. 腸内細菌叢 11 大腸がんと腸内環境のダイナミクス. モダンメディア. 2020. 66. 2. 37-42
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城間博紹, 水谷紗弥佳, 谷内田真一, 山田拓司. Gut microbiome and metabolome alteration after treatment for colorectal cancer. 腸内細菌学雑誌. 2020. 34. 2. 110-110
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水谷紗弥佳, 谷内田真一, 城間博紹, 柴知史, 山田拓司, 山田拓司. Gut microbiome and metabolome analyses in adenoma-carcinoma sequence of colorectal cancer. 日本細菌学雑誌(Web). 2020. 75. 1
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Books (2)：
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実験医学 <特集>口腔細菌叢 : 健康と病気を操るもう一つの生態系
羊土社 2021 ISBN:9784758125482
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大腸がんと腸内環境のダイナミクス
モダンメディア 2020
Lectures and oral presentations (10)：
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Gut microbiota as a risk factor for colorectal cancer in patients with familial adenomatous polyposis (FAP)
(2024)
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Explainable AI-based identification of gut microbiome as a potential biomarker for colorectal cancer
(2023)
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説明可能なAIを活用した腸内マイクロバイオームに基づく大腸がん診断マーカーの開発
(第12回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2023) 2023)
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糞便メタゲノムおよびメタボローム解析を用いた大腸がんの多段階発がんに伴う腸内細菌の変化
(第92回日本生化学会大会 2019)
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Metagenomic and metabolomic analyses reveal dynamic shifts in gut microbiota along the adenoma-carcinoma sequence in colorectal cancer
(IIBMP2019 2019)
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Education (3)：
- 2009 - 2015 Kyoto University Graduate School of Science Division of Biological Sciences
- 2007 - 2009 Kyoto University Graduate School of Science Division of Biological Sciences
- 2003 - 2006 University of California, Los Angeles Department of Molecular, Cell and Developmental Biology
Work history (5)：
- 2023/04 - 現在 Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology JSPS Research Fellow
- 2023/01 - 2023/03 Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology
- 2019/07 - 2022/12 Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology JSPS Research Fellow
- 2016/04 - 2019/06 Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology JSPS Research Fellow
- 2015/04 - 2016/03 Tokyo Institute of Technology Graduate School of Bioscience and Biotechnology
Awards (3)：
- 2021/02 - 東京工業大学 令和2年度手島記念研究賞(若手研究賞)
- 2015/02 - 京都大学化学研究所 平成26年度京都大学化学研究所院生発表会 口頭発表賞
- 2012/10 - 日本バイオインフォマティクス学会 2012年日本バイオインフォマティクス学会年会・第2回生命医薬情報学連合大会 Excellent Poster Award
Association Membership(s) (5)：
Microbiome Virtual International Forum
, 日本細菌学会
, 日本バイオインフォマティクス学会
, 日本生化学会
, 日本分子生物学会
