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J-GLOBAL ID：202301016029585069   Update date: Dec. 06, 2024

KOGE DAIKI

コウゲ ダイキ | KOGE DAIKI
Affiliation and department：
Niigata University Faculty of Engineering

About Niigata University Faculty of Engineering


Other affiliations (1)：
Homepage URL  (1)： https://sites.google.com/view/daiki-ko/%E3%83%9B%E3%83%BC%E3%83%A0/
Research field  (1)： Biological, health, and medical informatics
Research keywords  (5)： Cheminformatics ,  Bayesian Inference ,  Deep Learning ,  深層生成モデル ,  Machine Learning
Research theme for competitive and other funds  (2)：
  • 2024 - 2026 深層学習による分子立体構造の動的揺らぎに関する特徴量の抽出と分子特性予測への応用
  • 2022 - 2024 深層学習を用いた分子埋め込みモデルによる薬剤候補分子の仮想的探索
Papers (6)：
  • Daiki Koge, Naoaki Ono, Shigehiko Kanaya. Pre-training of Molecular GNNs via Conditional Boltzmann Generator. 2023
  • Daiki Koge, Naoaki Ono, Shigehiko Kanaya. Variational Autoencoding Molecular Graphs with Denoising Diffusion Probabilistic Model. arXiv. 2023
  • Keisuke Wakakuri, Yudai Taguchi, Daiki Koge, Naoaki Ono, Md. Altaf-Ul-Amin, Shigehiko Kanaya. Molecular Graph Indexes for Assessing Heterogeneity of Chemical Compounds. Journal of Computer Aided Chemistry. 2023. 23. 50-59
  • Hideki Ueda, Akio Fukumori, Daiki Koge, Naoaki Ono, Md. Altaf-Ul-Amin, Shigehiko Kanaya. Data Science for QSAR for Protease activity. Journal of Computer Aided Chemistry. 2023. 23. 43-49
  • Yuri Koide, Daiki Koge, Shigehiko Kanaya, Md. Altaf-Ul-Amin, Ming Huang, Aki Hirai Morita, Naoaki Ono. Classification of metabolites by metabolic pathways concerning terpenoids, phenylpropanoids, and polyketide compounds based on machine learning. Journal of Computer Aided Chemistry. 2023. 23. 25-34
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Books (1)：
  • データ駆動型材料開発 : オントロジーとマイニング、計測と実験装置の自動制御
    エヌ・ティー・エス 2021 ISBN:9784860437596
Lectures and oral presentations  (1)：
  • Variational Autoencoding Molecular Graphs with Denoising Diffusion Probabilistic Model
    (IEEE CIBCB 2023 2023)
Work history (4)：
  • 2024/04 - 現在 新潟大学 工学部 助教
  • 2024/04 - 現在 新潟大学大学院 自然科学研究科 助教
  • 2022/04 - 2024/03 Japan Society for the Promotion of Science JSPS DC2
  • 2021/04 - 2024/03 Nara Institute of Science and Technology 先端科学技術研究科 PhD Student
Awards (2)：
  • 2023/04 - Molecular Informatics : Top cited paper among work pulished in an issue between 1 January 2021 - 15 December 2022 Embedding of Molecular Structure Using Molecular Hypergraph Variational Autoencoder with Metric Learning
  • 2019/03 - 鹿児島大学 工学部 卒業論文優秀発表賞 ひまわり8号の画像解析による桜島噴火後の火山灰追尾
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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