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J-GLOBAL ID：200901020778483806 Update date: Apr. 04, 2024

Yao Min

ヤオミン | Yao Min

Affiliation and department：
Job title： Associate Professor
Homepage URL (1)： http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/index.html

Research field (2)： Biophysics , Structural biochemistry

Research keywords (7)： RNA , tanslation , タンパク質科学 , コンピュータ科学 , 構造生物学 , 蛋白質結晶学 , Protein Crystallography

Research theme for competitive and other funds (40)：

2022 - 2024 世界初IDP型酵素の存在意義と構造形成機構の解明
2021 - 2024 新規に開発したBLLナノ構造体による、タンパク質結晶核形成過程の研究
2019 - 2023 酵素による高分子構造制御-セルロース合成酵素の構造-機能相関
2019 - 2022 Structural-biology study on initiation mechanism of telomere bouquet formation
2019 - 2022 全自動大規模結晶化スクリーニングシステムを用いたX線結晶構造解析の支援と高度化タンパク質結晶化促進剤の開発

2017 - 2022 創薬等ライフサイエンス研究のための相関構造解析プラットフォームによる支援と高度化低エネルギーX線利用を中心としたタンパク質立体構造解析の支援と高度化

2019 - 2021 非天然機能性分子生合成のために、新触媒酵素のAI設計・創製ツールの開発

2017 - 2020 4者複合体の構造解析によるtranssulfursomeのtRNA変換機構の解明

2017 - 2019 新生鎖の合成速度を段階的に変える翻訳システムの創成

2017 - 2019 非天然型アドレナリン作動薬の選択的生合成経路の構築

2015 - 2018 Molecular mechanism of enzyme complexes catalyzing two-step reaction for Cys-tRNA synthesis

2016 - 2018 熱応答ゲル化ポリマーを利用した,中性子線構造解析のための大型結晶作製法の開発

2013 - 2018 中性子と放射光の連携利用によるタンパク質反応プロセスの解明(アミド基転移酵素におけるアンモニア輸送制御機構の解)

2014 - 2017 Molecular mechanism of the regulation of biosynthesis of polyamine which is covalently bound to the peptidolycan by the ribosomal protein L10 in bacteria

2014 - 2017 Structural study of a huge respiratory supermolecule hemocyanin

2014 - 2016 大腸菌リボソーム駆動部構成蛋白質のカセット交換による真核型合成速度の実現

2013 - 2016 真核生物リボソーム生合成における5SrRNP複合体の形成機構と機能の解明

2013 - 2015 Development of the gel coating technique for the automation of the inhibitor search by the X-ray crystal structure analysis

2012 - 2015 Ribosomal stalk complex driving translation cycle: molecular basis for high-speed and high-efficiency

2012 - 2015 Elucidation of the molecular mechanism of the enzyme Thg1 which catalyzes template-dependent RNA chain elongation in the 3'- 5'direction

2014 - 2015 タンパク質結晶構造解析のための実用的な結晶化タグの開発

2013 - 2015 未来創薬・医療イノベーション拠点形成

2012 - 2014 二次元有機-無機ハイブリッド複合体空間を用いた新規結晶化法

2009 - 2012 トランスアミドソームによるGln-tRNA(Gln)合成反応の多分子協調機構

2010 - 2011 Development of the general tags for formation of hetero-complex

2009 - 2011 Molecular Dissection of the Ribosomal Protein Complex that Plays a as Drive Part of Translation apparatus

2008 - 2011 Study of ribosome maturation mechanism by the structural analysis of Rat-U13snoRNA complex

2008 - 2009 情報工学・遺伝子工学・結晶工学の融合による蛋白質新規結晶化法

2008 - 2009 分子量が1億ダルトンに及ぶ生体超分子の構造解析を可能とするソフトウェアの開発

2007 - 2008 The coupling mechanism of glutaminase and kinase in GatCAB

2006 - 2007 Structural and functional analysis of a cell wall-associated giant protein EbhA from Staphylococcus aureus

2006 - 2007 分子量1億ダルトンに及ぶ生体超分子の構造解析を可能とするソフトウェアの開発

2005 - 2005 分子量が1億ダルトンに及ぶ生体超分子の構造解析を可能とするソフトウェアの開発

2004 - 2005 Structure analysis of multi-factor complex of eukaryotic translation initiation factor

2003 - 2004 距離関数の特異性とその蛋白質立体構造解析への応用

2003 - 2004 Structural and functional analysis of intermolecular Diels-Alderase

2001 - 2002 Nano liter scale protein crystallization and development of an automatic crystal appraisal method

2001 - 2002 RNA-蛋白質複合体マシーナリー・リボソームの構造研究

1999 - 2000 Structural studies on the protein synthesis machinery

1999 - 2000 Analysis reaction mechanism of ACC deaminase by X-ray crystallography

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Papers (278)：

Xiaomei Sun, Yuxin Ye, Naofumi Sakurai, Hang Wang, Koji Kato, Jian Yu, Keizo Yuasa, Akihiko Tsuji, Min Yao. Structural basis of EHEP-mediated offense against phlorotannin-induced defense from brown algae to protect akuBGL activity. eLife. 2023. 12
Yukino Sato, Tsubasa Hashimoto, Koji Kato, Akiko Okamura, Kaito Hasegawa, Tsukasa Shinone, Yoshikazu Tanaka, Yoshiki Tanaka, Tomoya Tsukazaki, Takashi Tsukamoto, et al. Multistep conformational changes leading to the gate opening of light-driven sodium pump rhodopsin. The Journal of biological chemistry. 2023. 105393-105393
Tomoya Ota, Wataru Saburi, Takayoshi Tagami, Jian Yu, Shiro Komba, Linda Elizabeth Jewell, Tom Hsiang, Ryozo Imai, Min Yao, Haruhide Mori. Molecular mechanism for endo-type action of glycoside hydrolase family 55 endo-β-1,3-glucanase on β1-3/1-6-glucan. The Journal of biological chemistry. 2023. 105294-105294
Hang Wang, Xiaomei Sun, Wataru Saburi, Saki Hashiguchi, Jian Yu, Toyoyuki Ose, Haruhide Mori, Min Yao. Structural insights into the substrate specificity and activity of a novel mannose 2-epimerase from Runella slithyformis. Acta crystallographica. Section D, Structural biology. 2023. 79. Pt 7. 585-595
Waraporn Auiewiriyanukul, Wataru Saburi, Tomoya Ota, Jian Yu, Koji Kato, Min Yao, Haruhide Mori. Alteration of Substrate Specificity and Transglucosylation Activity of GH13_31 α-Glucosidase from Bacillus sp. AHU2216 through Site-Directed Mutagenesis of Asn258 on β→α Loop 5. Molecules. 2023. 28. 7. 3109-3109

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MISC (143)：

太田智也, 佐分利亘, 山下恵太郎, 田上貴祥, 于健, 今場司朗, ジュウェルリンダ, シャントム, 今井亮三, 姚閔, et al. GH55β-1,3-グルカナーゼのエンド様式の作用と構造. 応用糖質科学. 2023. 13. 1
南未来, 杉山葵, 武川祐一郎, 姚閔, 姚閔, 廣瀬未果, 杉田征彦, 尾瀬農之, 尾瀬農之. 狂犬病ウイルスPタンパク質によるSTAT阻害機構の解明. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2023. 23rd (CD-ROM)
近藤辰哉, 中村結衣, 野島慎五, 姚閔, 今井友也. セルラーゼを用いた酢酸菌由来セルロース合成酵素複合体の構造局在解析. 応用糖質科学:日本応用糖質科学会誌. 2022. 12. 1. 47-48
碓井拓哉, 大江花, 中村彰良, 尾瀬農之, 尾瀬農之, YAO Min, YAO Min. Structure determination of protein-tRNA complex using AlphaFold2 predicted model. Photon Factory News. 2022. 40. 3
太田智也, 佐分利亘, 山下恵太郎, 田上貴祥, 于健, 今場司朗, JEWELL Linda, HSIANG Tom, 今井亮三, 姚閔, et al. GH55β-1,3-グルカナーゼのエンド様式の作用と構造. 応用糖質科学. 2022. 12. 3

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Patents (2)：

結晶化促進ポリペプチド
機能性ポリペプチドとそれを用いた蛋白質の多量体形成法

Books (6)：

【解説】酢酸菌におけるセルロースの合成セルロースナノファイバーを紡ぎ出す超精密ナノマシンの秘密に迫る
化学と生物 Vol.58, NO.7, 2020 /日本農芸化学会編集・発行 / 株式会社国際文献社刊行 2020
鉄硫黄クラスターが関与するtRNAチオ化修飾酵素の詳細な反応機構解明を目指した研究
Photon Factory News、第37巻、第3号/高エネルギー加速器研究機構 2019
tRNA依存的アミノ酸システインの生合成複合体の分子機構
生化学 2018
βマンナン分解に寄与するセロビオース2-エピメラーゼとβ-マンノシドホスホリラーゼの構造と機能
応用糖質科学会誌 2017
『第5版実験化学講座11 物質の構造III 回折』
丸善株式会社 2006 ISBN:9784621073100

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Lectures and oral presentations (28)：

新たな蛋白質結晶化促進剤の開発と応用
(第21回日本蛋白質科学会年会(オンライン開催) 2021)
北海道大学でX線発生装置を使ったS-SAD法に取り組んでいた頃
(特別シンポジウム~渡邉信久先生を偲んで~(オンライン開催) 2021)
Dynamic structure is requited for transslufursome on the Cys-tRNA(Cys) synthesis in indirect pathway
(Asian Crystallographic Association2019 2019)
「非天然機能性分子生合成のための,新触媒酵素のAI設計・創製ツールの開発」
(新学術領域研究(研究領域提案型)平成28~32年度 2019)
新生鎖の合成速度を段階的に変える翻訳システムの創成
(新学術領域研究「新生鎖の生物学」平成30年度公募班員成果報告会 2019)

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Professional career (2)：

Doctor of Science (Hokkaido University)
Master of Science (Hokkaido University)

Work history (15)：

2022/04 - 現在 Hokkaido University Faculty of Advanced Life Science
2012/06 - 現在 Hokkaido University Faculty of Advanced Life Science
2012 - 現在 Faculty of Advanced Life Science, and Graduate School of Life Science, Hokkaido University Professor
2007/04 - 2012/06 Hokkaido University Faculty of Advanced Life Science
2006 - 2012 Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University Associate Professor

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Committee career (8)：

2018/05 - 現在大阪大学蛋白質研究所大阪大学蛋白質研究所専門委員会
2018/04 - 現在日本結晶学会評議員
2017/04 - 2019/03 日本生物物理学会北海道支部支部長
2014/04 - 2017/03 日本蛋白質科学会役員
2011/04 - 2017/03 日本結晶学会評議員

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Association Membership(s) (6)：

日本蛋白質科学会 , 日本生物物理学会 , 日本結晶学会 , Protein Science Society of Japan , The Biophysical Society of Japan , The Crystallographic Society of Japan

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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