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J-GLOBAL ID:200901023254452503   Update date: Apr. 01, 2024

Shigi Naoki

シギ ナオキ | Shigi Naoki
Affiliation and department:
Other affiliations (1):
Homepage URL  (1): https://unit.aist.go.jp/cbbd-oil/
Research field  (2): Structural biochemistry ,  Functional biochemistry
Research keywords  (6): 無酸素生化学実験 ,  oxygen ,  sulfur ,  post-transcriptional modification ,  post-translational modification ,  protein synthesis
Research theme for competitive and other funds  (18):
  • 2024 - 2026 過硫化硫黄中間体を経由する硫黄化合物の生合成のしくみの多様性とその進化
  • 2021 - 2024 tRNA硫黄修飾塩基の生合成・分解系の多様性とその分子基盤
  • 2021 - 2023 バクテリアに現存するユビキチンの始原機能
  • 2020 - 2023 Molecular basis of ancestral sulfur relay system
  • 2019 - 2022 膜タンパク質の膜貫通領域におけるシステイン残基を介したレドックス感知機構
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Papers (19):
  • Yuzuru Sugio, Ryota Yamagami, Naoki Shigi, Hiroyuki Hori. A selective and sensitive detection system for 4-thiouridine modification in RNA. RNA (New York, N.Y.). 2022
  • Naoki Shigi. Biosynthesis and Degradation of Sulfur Modifications in tRNAs. International journal of molecular sciences. 2021. 22. 21
  • The [4Fe-4S] cluster of sulfurtransferase TtuA desulfurizes TtuB during tRNA modification in Thermus thermophilus. Communications Biology. 2020. 3. 168. 1-9
  • Shigi N, Horitani M, Miyauchi K, Suzuki T, Kuroki M. An ancient type of MnmA protein is an iron-sulfur cluster-dependent sulfurtransferase for tRNA anticodons. RNA. 2019. 26. 3. 240-250
  • Shigi N. Recent Advances in Our Understanding of the Biosynthesis of Sulfur Modifications in tRNAs. Frontiers in Microbiology. 2018. 9. 2679. 1-9
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Books (11):
  • 技術で未来拓く産総研の挑戦(303)~たんぱく質の合成、硫黄修飾が重要な役割~
    日刊工業新聞 2024
  • 極限環境微生物の先端科学と社会実装最前線
    エヌ・ティー・エス 2023 ISBN:9784860438487
  • 鉄硫黄クラスターが関与するtRNAの硫黄修飾塩基の生合成機構
    硫酸協会 2020
  • 高度好熱菌を耐熱化するtRNA硫黄修飾塩基の生合成と機能の解明
    極限環境生物学会 学会事務局 2019
  • RNA チオ化
    金原一郎記念医学医療振興財団 2018
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Lectures and oral presentations  (7):
  • tRNA 硫黄化酵素の酸素感受性の反応機構とその環境適応進化
    (遺伝研研究会「エピトランスクリプトーム制御の分子機構と生理機能」 2024)
  • Biosynthesis and Functions of Sulfur Modifications of Transfer RNA
    (30th Tokyo RNA Club 2022)
  • Biosynthesis and Functions of Sulfur Modifications of Transfer RNA
    (Weekly ESLI seminar (online), Tokyo Institute of Technology 2021)
  • 高度好熱菌を耐熱化するtRNA硫黄修飾塩基の生合成と機能の解明
    (極限環境生物学会 年会 研究奨励賞受賞講演 2017)
  • 生命の中枢をささえるRNA硫黄化のしくみ
    (第7回 連合農学研究科セミナー ~FROM 岐阜連農 TO 産総研~ 2016)
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Education (3):
  • 2001 - 2004 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 先端生命科学専攻 博士課程 (渡辺公綱教授)
  • 1999 - 2001 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 先端生命科学専攻 修士課程
  • 1997 - 1999 The University of Tokyo The Faculty of Engineering Department of Chemistry and Biotechnology
Professional career (1):
  • 博士(生命科学) (東京大学大学院新領域創成科学研究科)
Work history (9):
  • 2023/04 - 現在 産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ 副ラボ長
  • 2016/04 - 現在 Gifu University The United Graduate School of Agricultural Science
  • 2022/04 - 2023/03 経済産業省 生物化学産業課 課長補佐 (ホワイトバイオ担当)
  • 2020/04 - 2023/03 産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門 主任研究員
  • 2015/04 - 2020/03 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 主任研究員
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Committee career (2):
  • 2010/11 - 現在 Review editorial board; Frontiers in Genetics
  • 2020/04 - 2022/03 極限環境生物学会 年会担当幹事
Awards (1):
  • 2017/11 - 極限環境生物学会 研究奨励賞 高度好熱菌を耐熱化するtRNA硫黄修飾塩基の生合成と機能の解明
Association Membership(s) (4):
JAPANESE SOCIETY FOR EXTREMOPHILES ,  THE RNA SOCIETY OF JAPAN ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN ,  THE JAPANESE BIOCHEMICAL SOCIETY
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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