nakagawa shinichi

ナカガワシンイチ | nakagawa shinichi

Affiliation and department：
Job title：教授
Homepage URL (1)： https://sites.google.com/rnabiol.com/home

Research field (2)： Molecular biology , Developmental biology

Research keywords (20)： Xist , epigenetics , nuclear bodies , paraspeckle , Neat1 , 神経細胞 , noncoding RNA , 形態 , poly A , ヘテロカリオン , 核マトリックス , Gomafu , ロゼット , マウス , グリア , シナプス , ノックアウトマウス , 中枢神経系 , 核スペックル , 分化

Research theme for competitive and other funds (19)：

2021 - 2026 Funtional analyses of non-domain RNAs using mutant mice
2021 - 2026 Management of non-domain biopolymer research group
2021 - 2026 Biology of Non-domain Biopolymer
2021 - 2024 超天然変性タンパク質の個体レベルでの生理機能解析
2018 - 2023 Biochemical approaches to understanding the reaction platforms of the piRNA pathway

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Papers (123)：

Rei Yoshimoto, Shinichi Nakagawa. SINE-derived short noncoding RNAs: their evolutionary origins, molecular mechanisms, and physiological significance. Frontiers in RNA Research. 2023. 1
Kazuharu Arakawa, Tetsuro Hirose, Toshifumi Inada, Takuhiro Ito, Toshie Kai, Masaaki Oyama, Yukihide Tomari, Takao Yoda, Shinichi Nakagawa. Nondomain biopolymers: Flexible molecular strategies to acquire biological functions. Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms. 2023
Hiro Takakuwa, Tomohiro Yamazaki, Sylvie Souquere, Shungo Adachi, Hyura Yoshino, Naoko Fujiwara, Tetsuya Yamamoto, Tohru Natsume, Shinichi Nakagawa, Gerard Pierron, et al. Shell protein composition specified by NEAT1 domains dictates the formation of paraspeckles as distinct membraneless organelles. 2023
Akira Yamashita, Yuichi Shichino, Kazuki Fujii, Yumie Koshidaka, Mayumi Adachi, Eri Sasagawa, Mari Mito, Shinichi Nakagawa, Shintaro Iwasaki, Keizo Takao, et al. ILF3 prion-like domain regulates gene expression and fear memory under chronic stress. iScience. 2023. 26. 3. 106229-106229
John S. Mattick, Paulo P. Amaral, Piero Carninci, Susan Carpenter, Howard Y. Chang, Ling-Ling Chen, Runsheng Chen, Caroline Dean, Marcel E. Dinger, Katherine A. Fitzgerald, et al. Long non-coding RNAs: definitions, functions, challenges and recommendations. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2023

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MISC (104)：

横井佐織, 水戸麻里, 岩崎信太郎, 中川真一. Analysis of physiological funtions of malat1 in medaka fish. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
田中豪, 成瀬清, 郷康広, 辰本将司, 豊田敦, 勝村啓史, 中川真一, 横井佐織. メダカをモデルとした行動に関わる性格の分子神経基盤解析. 日本神経化学会大会抄録集(Web). 2022. 65th
大峽咲希, 中川真一, 米田宏. 【相分離メカニズムと疾患"膜のないオルガネラ"はいかに機能するか?神経変性疾患・ウイルス感染とどう関わるか?】(第2章)相分離と細胞内構造核内の非膜オルガネラ Cajal bodyの多機能性と柔軟性の包括的理解. 実験医学. 2021. 39. 10. 1509-1514
中川真一, 大峽咲希, 米田宏. 細胞内ティール組織化:マルチバレント相互作用と相分離が織りなす細胞内プロセスの理解ティール相互作用によって作られる核内非膜オルガネラの形成機構. 日本細胞生物学会大会講演要旨集. 2020. 72回. W2-4
中川真一. 【イメージング時代の構造生命科学細胞の動態、膜のないオルガネラ、分子の構造変化をトランススケールに観る】(第2章)構造生命科学からトランススケール・イメージングによる細胞動態学へトランススケールな解析が待たれる生命科学の未解決課題 RNAを含む非膜構造体の内部微細構造観察と天然変性領域の役割. 実験医学. 2020. 38. 5. 762-768

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Books (1)：

ノンコーディングRNAテキストブック : 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報
羊土社 2015 ISBN:9784758103510

Lectures and oral presentations (52)：

Preferential association of prion-like-domain-containing RNA binding proteins to functional lncRNA candidates
(2018)
Prediction of functional lncRNAs using UPA-seq
(CSHL Asia 2018)
UPA-Seq:UVへの感受性を利用した機能性lncRNAの同定
(日本RNA学会年会要旨集 2018)
Attempts towards identification of novel functional lncRNAs
(EMBO workshop 2018)
Towards Identification of Novel Functional Long noncoding RNAs
(Kumamoto Key Forum 2018)

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Professional career (1)：

理学博士 (京都大学)

Work history (7)：

2016/05 - 現在 Hokkaido University Faculty of Pharmaceutical Sciences Professor
2010/04 - 2016/04 RIKEN Associate Chief Scientist
2005/04 - 2010/03 RIKEN Initiative Researcher
2002/04 - 2005/03 RIKEN CDB Researcher
2000/04 - 2002/03 University of Kyoto Assistant Professor

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※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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