- 2016 - 2020 大腸菌と溶菌ファージとのモデル生態系による寄生から共生への移行・発展の実証的研究
- 2018 - 2019 RNAファージQβ由来RNA複製酵素の進化分子工学手法による改良
- 2016 - 2018 新規エーテル型リン脂質の微生物酵素による合成と生理機能の解明
- 2014 - 2017 RNAバクテリオファージQβの高温適応実験進化における適応機構の解明
- 2011 - 2014 Characterization of a Escherichia coli strain that evolved in an experimental coevolution system
- 2010 - 2012 自然栽培リンゴ樹の自然免疫獲得機構と葉・根圏微生物相互作用の大規模塩基配列解析
- 2008 - 2011 実験室内進化系を用いたRNAウイルスの進化に関する研究
- 2009 - 2010 Analysis of bacteriophage Qβ genome evolution in an experimental coevolution system
- 2008 - 2009 大腸菌とQβバクテリオファージとの共進化系の構築と解析
- 2007 - 2008 1遺伝子発現量可変大腸菌株を用いた信号伝播解析
- 2007 - 2008 細胞内一遺伝子発現量変化が及ぼす他遺伝子発現量変化の網羅的解析内進化系の構築
- 2007 - 2008 大腸菌内一遺伝子発現量可変体集団の構築
- The Mechanism of Maintaing Genetic Diversitydue to Phenotypic Differentiation
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