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J-GLOBAL ID:200901045012748380   Update date: Nov. 09, 2024

TAMIKI KOMATSUZAKI

コマツザキ タミキ | TAMIKI KOMATSUZAKI
Affiliation and department:
Other affiliations (1):
Homepage URL  (1): http://mlns.es.hokudai.ac.jp/
Research field  (4): Biophysics ,  Basic physical chemistry ,  Bio-, chemical, and soft-matter physics ,  Mathematical physics and basic theory
Research keywords  (5): 情報計測 時系列解析 データマイニング 生体情報 非平衡・非線形物理学 統計物理学 化学物理 生物物理 化学反応 分子動力学 タンパク質・核酸の構造・動態・機能 フォールディング 1分子計測・操作 非平衡・複雑系 ,  Functions Folding Single Molecule Measurement Complex Systems ,  Dynamics ,  Nolinear Physics Statistical Physics Chemical Physics Biological Physics Chemical Reaction Molecular Dynamics Protein Structure ,  Time Series Analysis Data Mining Biological Information Nonequilibrium
Research theme for competitive and other funds  (39):
  • 2023 - 2029 個体差を活かした計測介入型の迅速スクリーニング計測基盤
  • 2018 - 2023 Development of Data-driven Mathematical Analysis for Single Cells and Singularity Cells
  • 2016 - 2022 一細胞ラマン計測と情報科学の融合による細胞診断の迅速解析技術の開発
  • 2018 - 2021 Cell diagnosis by bridging Raman Spectral Imaging and Information Science
  • 2018 - 2020 データサイエンスと非線形科学の融合による新たな非平衡現象の探求
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Papers (171):
  • Ryoichi Tanaka, Yuta Mizuno, Takuro Tsutsumi, Mikito Toda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki. Low-dimensional projection of reactivity classes in chemical reaction dynamics using supervised dimensionality reduction. The Journal of chemical physics. 2024. 161. 15
  • Md Menhazul Abedin, Koji Tabata, Yoshihiro Matsumura, Tamiki Komatsuzaki. Multi-armed bandit algorithm for sequential experiments of molecular properties with dynamic feature selection. The Journal of chemical physics. 2024. 161. 1
  • Yutaka Nagahata, Masato Kobayashi, Mikito Toda, Satoshi Maeda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki. An encompassed representation of timescale hierarchies in first-order reaction network. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2024. 121. 21. e2317781121
  • Koji Tabata, Hiroyuki Kawagoe, J Nicholas Taylor, Kentaro Mochizuki, Toshiki Kubo, Jean-Emmanuel Clement, Yasuaki Kumamoto, Yoshinori Harada, Atsuyoshi Nakamura, Katsumasa Fujita, et al. On-the-fly Raman microscopy guaranteeing the accuracy of discrimination. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2024. 121. 12. e2304866121
  • Xun Sun, Jonas Alfermann, Hao Li, Maxwell B Watkins, Yi-Tsao Chen, Thomas E Morrell, Florian Mayerthaler, Chia-Ying Wang, Tamiki Komatsuzaki, Jhih-Wei Chu, et al. Subdomain dynamics enable chemical chain reactions in non-ribosomal peptide synthetases. Nature chemistry. 2024. 16. 2. 259-268
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MISC (331):
  • Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki. Quantum algorithm for dynamic mode decomposition integrated with a quantum differential equation solver. Physical Review Research. 2024
  • Ryoichi Tanaka, Yuta Mizuno, Takuro Tsutsumi, Mikito Toda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki. Low-Dimensional Projection of Reactive Islands in Chemical Reaction Dynamics Using a Supervised Dimensionality Reduction Method. arXiv. 2024
  • Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki. Finding optimal pathways in chemical reaction networks using Ising machines. Physical Review Research. 2024
  • Sulimon Sattari, Udoy S. Basak, Ryan G. James, Louis W. Perrin, James P. Crutchfield, Tamiki Komatsuzaki. Modes of information flow in collective cohesion. SCIENCE ADVANCES. 2022. 8. 6. eabj1720
  • 田畑公次, 田畑公次, 川越寛之, TALYER James Nicholas, 望月健太郎, 久保俊貴, CLEMENT Jean-Emmanuel, 熊本康昭, 熊本康昭, 原田義規, et al. Bandit Raman microscopy: reinforcement learning for rapid diagnosis. 日本分光学会年次講演会(CD-ROM). 2022. 2022
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Books (35):
  • Minorities and Small Numbers from Molecules to Organisms in Biology-Toward a New Understanding of Biological Phenomena
    Springer 2018
  • 化学反応理論の普遍性:GRRMに期するもの
    IQCE NEWS (量子化学探索研究所) 2018
  • 【少数性生物学ってなんだ?少数の因子が生命システムを制御する】少数と個性 分子の数と生命らしさ
    (株)羊土社 2017
  • 少数性生物学
    株式会社 日本評論社 2017
  • Advances in Chemical Physics
    Wiley 2017
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Lectures and oral presentations  (422):
  • 実在分子系における化学反応動力学の相空間構造の理論的研究
    (第18回分子科学討論会 2024)
  • 個体差を反映した薬物迅速スクリーニングと異なる種間の情報接続
    (2024年度日本神経回路学会時限研究会 2024)
  • Raman Imaging Algorithm for Analysing Therapy-Resistant Cancer Cells
    (28th International Conference on Raman Spectroscopy - ICORS 2024 2024)
  • On-the-Fly Raman Microscopy Guaranteeing the Accuracy of Discrimination
    (28th International Conference on Raman Spectroscopy - ICORS 2024 2024)
  • Development of;an;Efficien;Estimation Method for;Maximum Tolerated Dose by Reinforcement Learning
    (IUPAB2024 2024)
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Professional career (1):
  • 博士(理学) (総合研究大学院大学(分子科学研究所))
Work history (38):
  • 2024/09 - 現在 FlyWorks Inc. Techinical Advisor
  • 2023/04 - 現在 情報計測オンラインセミナー運営委員会 委員
  • 2022/10 - 現在 日本化学会代議員
  • 2022/07 - 現在 大阪大学産業科学研究所 特任教授
  • 2022/04 - 現在 学術変革領域B「嫉妬の科学」外部アドバイザー
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Committee career (25):
  • 2024/01 - 現在 生物物理学会 分野別専門委員(非線形・カオス・複雑系)
  • 2024/01 - 現在 生物物理学会 「生物物理」編集委員長
  • 2023/10 - 現在 科学技術振興機構・創発アドバイザー
  • 2019/06 - 現在 科学技術振興機構・さきがけ「革新的な量子情報処理技術基盤の創出」 アドバイザー
  • 2018/01 - 現在 人工知能学会第2種研究会 計測インフォマティクス研究会 (Special Interest Group on Measurement Informatics: SIG-MEI) 幹事
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Awards (4):
  • 2021/09 - FACSS SciX2021 Finalist of FACSS Innovation award
  • 2014 - 科研費審査員表彰
  • 2012 - Bulletin of the Chemical Society of Japan (BCSJ) Award
  • 2010 - Human Frontier Science Program (HFSP) Grant Award
Association Membership(s) (8):
American Association for the Advancement of Science ,  SAIM(Society for Industrial and Applied Mathematics) ,  JAPAN SOCIETY FOR MOLECULAR SCIENCE ,  WATOC(World Association of Theoretically Oriented Chemists) ,  アメリカ化学会 ,  日本物理学会 ,  日本生物物理学会 ,  日本化学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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