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J-GLOBAL ID:200901052621726836   Update date: May. 21, 2024

Yasubumi Sakakibara

サカキバラ ヤスブミ | Yasubumi Sakakibara
Affiliation and department:
Job title: Professor
Homepage URL  (1): http://www.dna.bio.keio.ac.jp/
Research field  (2): Systems genomics ,  Biological, health, and medical informatics
Research keywords  (2): Bioinformatics ,  cancer genome
Research theme for competitive and other funds  (25):
  • 2023 - 2028 天然物が織り成す化合物潜在空間が拓く生物活性分子デザイン
  • 2023 - 2028 深層学習を用いた化合物潜在空間の構築および人工分子構造のデザイン
  • 2021 - 2024 Pathological diagnosis based on integration of morphological images and multi-layer omics data by artificial intelligence
  • 2018 - 2023 非コードRNA遺伝子をゲノムワイドに発見する汎用システム
  • 2017 - 2022 Frontiers in Chemical Communications
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Papers (116):
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MISC (28):
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Patents (2):
  • 核酸分子を用いた新規な情報解析方法およびそれを用いた核酸の解析方法
  • Data Sorting,Data Sorting Tree Creating,Derivative
Books (3):
  • 情報数理シリーズ「計算論的学習」
    培風館 2001
  • DNAコンピューティング
    シュプリンガー・フェアラーク東京 1999
  • 新版 情報処理ハンドブック
    オーム社 1995
Lectures and oral presentations  (24):
  • MetaVelvet : An extension of Velvet assembler to de novo metagenome assembly from short sequence reads
    (ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine 2011 2011)
  • Comprehensive analysis of small non-coding RNAs in medaka transcriptome by deep RNA-seq approach
    (RNA 2011 Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society 2011)
  • Genome-wide detections of non-coding RNAs on Ciona intestinalis genome: from in silico search of snoRNA to full-length sequencing and expression analysis
    (5th International Tunicate Meeting 2009)
  • Discriminative Detection of Cis-acting Regulatory Variation from Location Data
    (The 4th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2006), Taiwan 2006)
  • Development of an in vivo computer based on Escherichia coli
    (The 11th International Meeting on DNA Based Computers (DNA11), London, Ontario 2005)
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Education (2):
  • 1985 - Tokyo Institute of Technology Graduate School, Division of Science and Engineeri 情報科学専攻
  • 1983 - Tokyo Institute of Technology Faculty of Science 情報科学科
Professional career (2):
  • 理学 (東京工業大学)
  • 理学 (Tokyo Institute of Technology)
Work history (7):
  • 2005/04 - 現在 Professor, Department of Biosciences and Informatics, Keio University
  • 2002/04 - 2005/03 慶應義塾大学大学院理工学研究科基礎理工学専攻 ,助教授
  • 2002/04 - 2005/03 慶應義塾大学理工学部生命情報学科 ,助教授
  • 2001/10 - 2002/03 東京電機大学理工学部情報科学科 ,教授
  • 1996/04 - 2001/09 東京電機大学理工学部情報科学科 ,助教授
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Committee career (24):
  • 1995/10 - 現在 6th International Workshop on Algorithmic Learning 招待講演
  • 1995/10 - 現在 6th International Workshop on Algorithmic Learning 招待講演
  • 1990/04 - 現在 人工知能学会 人工知能基礎論研究会 連絡委員
  • 1990/04 - 現在 人工知能学会 人工知能基礎論研究会 連絡委員
  • 2010/07/14 - 2010/07/17 16th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming Program Committee Co-Chairman
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Awards (1):
  • 1999 - 東京電機大学研究振興会 東京電機大学研究振興会 教育奨励賞 「プログラム言語のマルチメディア教育」
Association Membership(s) (2):
人工知能学会 人工知能基礎論研究会 ,  第44回情報処理学会全国大会 チュートリアルセッション 機械学習入門
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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