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J-GLOBAL ID:200901052621726836   Update date: Apr. 08, 2021

Yasubumi Sakakibara

サカキバラ ヤスブミ | Yasubumi Sakakibara
Affiliation and department:
Job title: Professor
Homepage URL  (1): http://www.dna.bio.keio.ac.jp/
Research field  (2): Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics
Research keywords  (2): Bioinformatics ,  cancer genome
Research theme for competitive and other funds  (9):
  • 2018 - 2023 非コードRNA遺伝子をゲノムワイドに発見する汎用システム
  • 2017 - 2022 Deep analysis of chemical communication space using artificial intelligence technology
  • 2014 - 2018 ビッグデータ駆動型創薬システム研究拠点
  • 2010 - 2015 ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援
  • 2011 - 2014 発がんゲノムにおける非コードRNAの網羅的機能解析
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Papers (100):
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MISC (8):
  • Yamanishi Y, Sakakibara Y, Chen Y. Guest Editorial for the 16th Asia Pacific Bioinformatics Conference. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2019. 16. 1
  • YOTSUI Mizuki, KUO-CHING Liang, HIROHARA Maya, KITAZAWA Momoko, YOSHIMURA Michitaka, EGUCHI Yoko, FUJITA Takanori, KISHIMOTO Taishiro, SAKAKIBARA Yasubumi. Deep learning analysis of depression severity using voice data. Proceedings of the Annual Conference of JSAI. 2018. 2018. 0. 4C2OS27b02-4C2OS27b02
  • 星野敦, 仁田坂英二, V. Jayakumar, 榊原康文. 新たなステージに入ったアサガオ研究。高精度なゲノム解読と幻の黄色いアサガオの再現. 化学と生物. 2018. 56. 39-46
  • 青戸 良賢, 奥村 和弘, 石川 冬木, 若林 雄一, 榊原 康文. 発がん過程の経時的ゲノム解析. 日本癌学会総会記事. 2015. 74回. E-1048
  • 青戸良賢, 八谷剛史, 奥村和弘, 長谷純崇, 佐藤健吾, 若林雄一, 榊原康文. Temporal transcriptome analysis for carcinogenesis process by digital clustering. 研究報告バイオ情報学(BIO). 2013. 2013. 8. 1-6
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Patents (2):
  • 核酸分子を用いた新規な情報解析方法およびそれを用いた核酸の解析方法
  • Data Sorting,Data Sorting Tree Creating,Derivative
Books (3):
  • 情報数理シリーズ「計算論的学習」
    培風館 2001
  • DNAコンピューティング
    シュプリンガー・フェアラーク東京 1999
  • 新版 情報処理ハンドブック
    オーム社 1995
Lectures and oral presentations  (24):
  • MetaVelvet : An extension of Velvet assembler to de novo metagenome assembly from short sequence reads
    (ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine 2011 2011)
  • Comprehensive analysis of small non-coding RNAs in medaka transcriptome by deep RNA-seq approach
    (RNA 2011 Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society 2011)
  • Genome-wide detections of non-coding RNAs on Ciona intestinalis genome: from in silico search of snoRNA to full-length sequencing and expression analysis
    (5th International Tunicate Meeting 2009)
  • Discriminative Detection of Cis-acting Regulatory Variation from Location Data
    (The 4th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2006), Taiwan 2006)
  • Development of an in vivo computer based on Escherichia coli
    (The 11th International Meeting on DNA Based Computers (DNA11), London, Ontario 2005)
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Education (2):
  • 1985 - Tokyo Institute of Technology 情報科学専攻
  • 1983 - Tokyo Institute of Technology 情報科学科
Professional career (2):
  • 理学 (東京工業大学)
  • 理学 (Tokyo Institute of Technology)
Work history (8):
  • 2005/04 - 現在 Professor, Department of Biosciences and Informatics, Keio University
  • 2002/04 - 2005/03 慶應義塾大学大学院理工学研究科基礎理工学専攻 ,助教授
  • 2002/04 - 2005/03 慶應義塾大学大学院理工学研究科基礎理工学専攻 ,助教授
  • 2002/04 - 2005/03 慶應義塾大学理工学部生命情報学科 ,助教授
  • 2001/10 - 2002/03 東京電機大学理工学部情報科学科 ,教授
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Committee career (24):
  • 1995/10 - 現在 6th International Workshop on Algorithmic Learning 招待講演
  • 1995/10 - 現在 6th International Workshop on Algorithmic Learning 招待講演
  • 1990/04 - 現在 人工知能学会 人工知能基礎論研究会 連絡委員
  • 1990/04 - 現在 人工知能学会 人工知能基礎論研究会 連絡委員
  • 2010/07/14 - 2010/07/17 16th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming Program Committee Co-Chairman
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Awards (1):
  • 1999 - 東京電機大学研究振興会 東京電機大学研究振興会 教育奨励賞 「プログラム言語のマルチメディア教育」
Association Membership(s) (2):
人工知能学会 人工知能基礎論研究会 ,  第44回情報処理学会全国大会 チュートリアルセッション 機械学習入門
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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