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J-GLOBAL ID：200901055310348284   Update date: Jan. 31, 2024

Nishimura Yoshifumi

ニシムラ ヨシフミ | Nishimura Yoshifumi
Affiliation and department：
Yokohama City University

About Yokohama City University


Homepage URL  (1)： http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/
Research field  (1)： Molecular biology
Research keywords  (5)： histone ,  chromatin ,  epigenome ,  NMR ,  Structural Biology
Research theme for competitive and other funds  (55)：
  • 2009 - 2014 Characterization of structural dynamics of intrinsically disordered proteins
  • 2009 - 2014 Integrative understanding of biological processes mediated by transient macromolecul ar complexes; New technology for visualizing physiologically metastable states
  • 2009 - 2014 Target recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein
  • 2008 - 2012 Dynamics of intrinsically disordered proteins and their functional roles
  • 2003 - 2009 Molecular soft interactions regulating membrane-interface activities in living systems
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Papers (82)：
  • Masahiko Okuda, Yoshifumi Nishimura. Structural polymorphism of the PH domain in TFIIH. Bioscience Reports. 2023. 43. 7
  • Hideaki Ohtomo, Tsutomu Yamane, Takashi Oda, Noriyuki Kodera, Jun-ichi Kurita, Yasuo Tsunaka, Romain Amyot, Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura. Dynamic solution structures of whole human NAP1 dimer bound to one and two histone H2A-H2B heterodimers obtained by integrative methods. Journal of Molecular Biology. 2023. 168189-168189
  • Hideaki Ohtomo, Shinsuke Ito, Nicholas J. McKenzie, Michael Uckelmann, Masatoshi Wakamori, Haruhiko Ehara, Ayako Furukawa, Yasuo Tsunaka, Marika Shibata, Shun-ichi Sekine, et al. H2A ubiquitination alters H3-tail dynamics on linker-DNA to enhance H3K27 methylation. Journal of Molecular Biology. 2023. 435. 4. 167936-167936
  • Masahiko Okuda, Yasuo Tsunaka, Yoshifumi Nishimura. Dynamic structures of intrinsically disordered proteins related to the general transcription factor TFIIH, nucleosomes, and histone chaperones. Biophysical Reviews. 2022. 14. 6. 1449-1472
  • Yasuo Tsunaka, Hideaki Ohtomo, Yoshifumi Nishimura. FACT modulates the conformations of histone H2A and H2B N-terminal tails within nucleosomes. Communications biology. 2022. 5. 1. 814-814
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MISC (182)：
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Patents (3)：
  • 新規Sin3モジュレーター及びその医薬用途
  • 神経選択的転写抑制因子NRSFに特異的に結合するmSin3Bに結合する化合物の利用
  • 神経選択的転写抑制因子NRSFに特異的に結合するmSin3Bに結合する化合物の利用
Books (26)：
  • NMR分光法 (分光法シリーズ) 2016/4/23 日本分光学会
    2016
  • 生化学 「バンド生物学」とインパクトファクター
    2011
  • 蛋白質・核酸・酵素 転写・翻訳 真核生物の転写系を中心に
    2008
  • 生化学 基本転写因子TFIIEの構造とTFIIHとの相互作用
    2008
  • 生命科学のための機器分析実験ハンドブック 西村善文編集
    2007
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Lectures and oral presentations  (129)：
  • エピゲノム関連タンパク質のNMR機能解析と超高磁場への展望
    (第65回ワークショップ よこはまNMR研究会 2020)
  • ヌクレオソーム中ヒストンテイルの化学修飾による動的相互作用変化
    (第37回染色体ワークショップ;回核ダイナミクス研究会 2019)
  • エピゲノム科学とNMR
    (よこはまNMR研究会 第62回ワークショップ「令和最初のNMR」 2019)
  • NMR構造解析の特徴と共用支援例の紹介
    (2017年度生命科学系学会合同年次大会 2017)
  • Extended String Binding Modes of Intrinsically Disordered Nuclear Proteins
    (2017 Taiwan-Japan Biomedical Symposium on Magnetic Resonance 2017)
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Education (3)：
  • 1973 - 1976 The University of Tokyo Doctor Course, Faculty of Pharmaceutical Sciences
  • 1971 - 1973 The University of Tokyo Master Course, Faculty of Pharmaceutical Sciences
  • 1967 - 1971 The University of Tokyo Faculty of Pharmaceutical Sciences
Professional career (2)：
  • Ph.D. (The University of Tokyo)
  • Master of Pharmaceutical Sciences (The University of Tokyo)
Work history (7)：
  • 2019/04 - 現在 Hiroshima University Graduate School of Integrated Sciences for Life Vice President,Dean
  • 2018/04 - 現在 Yokohama City University Graduate School of Medical Life Science Project Professor
  • 2015/04 - 2018/03 Yokohama City University Graduate School of Medical Life Science Advisor to the President
  • 2013/04 - 2015/03 Yokohama City University Graduate School of Medical Life Science Dean
  • 1989/04 - 2013/03 Yokohama City University Graduate School Professor
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Committee career (4)：
  • 2009/12 - 2011/11 日本分光学会 会長
  • 2007/09 - 2009/08 日本生化学会 関東支部長
  • 1992 - 日本生化学会 評議員
  • 1992 - 日本分光学会 評議員
Awards (2)：
  • 2012/06 - The Spectroscopical Society of Japan The Spectroscopy Society of Japan Award
  • 1982 - 日本分光学会論文賞
Association Membership(s) (4)：
日本核磁気共鳴学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本分光学会 ,  The Japanese Society of Magnetic Resonance in Medicine
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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