Sugimoto Naoki

スギモトナオキ | Sugimoto Naoki

Affiliation and department：
Job title： Professor
Other affiliations (3)：

Konan University Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research
KONAN UNIVERSITY Frontier of Institute for Biomolecular Engineering Research in Science and Technology Department of Nanobiochemistry Director in General
学校法人甲南学園理事

Research field (3)： Nanomaterials , Applied biofunctional and bioprocess engineering , Biochemistry

Research keywords (3)： Bioscience , Nucleic Acid Chemistry , Biofunctional Chemistry

Research theme for competitive and other funds (81)：

2018 - 現在核酸の非二重らせん構造を調節し、がんの発症を制御するのは、カリウムイオンなのか
2017 - 現在細胞夾雑模倣系の構築と細胞内活性分子設計指針の構築 (計画研究)
2017 - 2022 分子夾雑の生命化学 (総括班)
2018 - 2021 細胞内環境で変化する非二重らせん構造の定量的機能解析と遺伝子発現制御
2020 - イオンチャンネルは核酸の非二重らせん構造の形成と遺伝子発現を制御しているのか

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Papers (427)：

Dipanwita Banerjee, Hisae Tateishi-Karimata, Maria Toplishek, Tatsuya Ohyama, Saptarshi Ghosh, Shuntaro Takahashi, Marko Trajkovski, Janez Plavec, Naoki Sugimoto. In-Cell Stability Prediction of RNA/DNA Hybrid Duplexes for Designing Oligonucleotides Aimed at Therapeutics. Journal of the American Chemical Society. 2023. 145. 43. 23503-23518
Sinjan Das, Shuntaro Takahashi, Tatsuya Ohyama, Sudipta Bhowmik, Naoki Sugimoto. Theranostic approach to specifically targeting the interloop region of BCL2 i-motif DNA by crystal violet. Scientific reports. 2023. 13. 1. 14338-14338
Saptarshi Ghosh, Shuntaro Takahashi, Dipanwita Banerjee, Tatsuya Ohyama, Tamaki Endoh, Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto. Nearest-neighbor parameters for the prediction of RNA duplex stability in diverse in vitro and cellular-like crowding conditions. Nucleic acids research. 2023. 51. 9. 4101-4111
Yoshiki Hashimoto, Yoshiki Imagawa, Kaho Nagano, Ryuichi Maeda, Naho Nagahama, Takeru Torii, Natsuki Kinoshita, Nagisa Takamiya, Keiko Kawauchi, Hisae Tatesishi-Karimata, et al. Simple and fast screening for structure-selective G-quadruplex ligands. Chemical communications (Cambridge, England). 2023. 59. 33. 4891-4894
Tamaki Endoh, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto. Endogenous G-quadruplex-forming RNAs inhibit the activity of SARS-CoV-2 RNA polymerase. Chemical communications (Cambridge, England). 2023. 59. 7. 872-875

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MISC (398)：

鶴田充生, 取井猛流, 小畠一起, 川内敬子, 建石(狩俣)寿枝, 杉本直己, 三好大輔. Droplet degradation targeted at secondary structure of nucleic acid. 日本化学会春季年会講演予稿集(Web). 2022. 102nd
橋本佳樹, 取井猛流, 藤田ひな, 川内敬子, 建石寿枝, 杉本直己, 三好大輔. A Novel G4 Ligand Screening System with G4-selective Fluorescent Probe. 日本化学会春季年会講演予稿集(Web). 2022. 102nd
神谷真子, 建石寿枝, 永次史, 山吉麻子, 杉本直己. フロントランナーに聞く「令和の時代も進化を続ける核酸化学」. CSJカレントレビュー「進化を続ける核酸化学-ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬-」. 2021. 41. 2-13
松本咲, 杉本直己. 遺伝子発現における核酸の新機能. CSJカレントレビュー「進化を続ける核酸化学-ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬-」. 2021. 41. 146-154
高橋俊太郎, 杉本直己. 細胞内の核酸物理化学. CSJカレントレビュー「進化を続ける核酸化学-ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬-」. 2021. 41. 14-21

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Patents (25)：

核酸を用いた紫外線吸収剤
核酸合成を促進する化合物を含む組成物およびその利用、並びに当該化合物の製造方法
プラセンタを用いた紫外線吸収剤
核酸を用いた紫外線吸収剤
ヌクレアーゼ活性の促進法

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Books (55)：

Chemistry and Biology of Non-canonical Nucleic Acids
WILEY 2021
核酸科学ハンドブック
講談社 2020
第IV部生物学的相分離の理論
相分離生物学の全貌(現代化学増刊46), 東京化学同人 2020
Quantitative Analysis of Stall of Replicating DNA Polymerase by G-Quadruplex Formation
Methods in Molecular Biology (Methods Mol. Biol.)Springer 2019
Development and Application of a Highly Efficient Protein Synthesis Technique Using Riboswitches in Microorganisms
Applied RNA Bioscience (Springer) 2018

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Lectures and oral presentations (3,013)：

Structure-based Derivatization of Berberine to Improve the Potency for Targeting RNA Structures
(日本化学会第102回春季年会)
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (74): Effect of DNA modifications on the transition between canonical and non-canonical DNA structures in CpG island
(日本化学会第102回春季年会)
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (73):Effect of G-quadruplex stability change on transcriptional repression in cancer cells
(日本化学会第102回春季年会)
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (76) : Structure-based Derivatization of Berberine to Improve the Potency for Targeting RNA Structures
(日本化学会第102回春季年会,)
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (79) : Application of the nearest-neighbor model for the stability prediction of intramolecular i-motif DNAs
(日本化学会第102回春季年会)

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Works (1)：

私の自慢「知の系譜:挑戦するオストワルト・ギブスの末裔たち-物理化学は細胞の中へ,極限状態の生命へ」
2013 -

Education (2)：

- 1982 Kyoto University Graduate School, Division of Natural Science
- 1979 Kyoto University Faculty of Science

Professional career (3)：

理学士 (京都大学)
理学修士 (京都大学)
理学博士 (京都大学)

Work history (9)：

2012/08 - 現在学校法人甲南学園理事
2012/08/01 - 現在 KONAN UNIVERSITY Faculty of Frontiers of Innovative Research in Science and Technology Faculty of Frontiers of Innovative Research in Science and Technology Department of Nanobiochemistry
2009/04/01 - 現在 KONAN UNIVERSITY Faculty of Frontiers of Innovative Research in Science and Technology Faculty of Frontiers of Innovative Research in Science and Technology Department of Nanobiochemistry Professor
2004/04/01 - 現在 KONAN UNIVERSITY Frontier of Institute for Biomolecular Engineering Research in Science and Technology Department of Nanobiochemistry Director in General
1994/04/01 - 2009/03/31 KONAN UNIVERSITY Faculty of Science Professor

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Committee career (16)：

2005/04/01 - 現在社団法人兵庫工業会産業学術委員会
2001/03/01 - 現在日本化学会生命化学研究会監事
2001/03/01 - 現在日本化学会バイオテクノロジー部会幹事
2000/04/01 - 現在近畿化学協会研究会運営委員
1992/04/01 - 現在近畿化学協会部会幹事

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Awards (14)：

2020/03/23 - 公益社団法人日本化学会第72回日本化学会賞分子クラウディング環境における非二重らせん核酸の化学
2018/08/28 - IS3NA(International Society for Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids) The Imbach-Townsend Award
2016/06/18 - European Chemistry Congress (Euro Chemistry2016) Keynote Lecture賞
2015/10 - 公益財団法人井植記念会第39回井植文化賞(科学技術部門)
2014/09 - 錯体化学会平成26年度錯体化学会貢献賞

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Association Membership(s) (16)：

錯体化学会 , 日本核酸化学会 , 環境科学会 , 希土類学会 , 社団法人兵庫工業会 , 兵庫県科学技術会 , 社団法人日本学術振興会 , ACS学会 , 近畿化学協会 , 生命化学研究会 , 日本生化学会 , 日本生物物理学会 , 日本薬学会 , 日本分析化学会 , 高分子学会(国内) , 日本化学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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