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J-GLOBAL ID：200901059322608821
Update date: Sep. 19, 2024
SHIMIZU Hirofumi
シミズ ヒロフミ | SHIMIZU Hirofumi
Affiliation and department：
Job title：
Senior Assistant Professor
Homepage URL (1)：
http://seiri2.med.lab.u-fukui.ac.jp/
Research field (3)：
Clinical pharmacy
, Physiology
, Biophysics
Research keywords (8)：
KcsA potassium channel
, Single-Molecule Dynamics Measurement
, QT延長症候群,カリウムチャネル
, long QT syndrome,potassium channel(HERG)
, 生理学
, 生物物理学
, Physiology
, Biophysics
Research theme for competitive and other funds (30)：
- 2024 - 2026 X線1分子動態計測による膜蛋白質マルチセンシング機構の動的解明
- 2023 - 2026 X線1分子動態計測による膜蛋白質マルチセンシング機構の動的解明
- 2022 - 2025 蛋白質の立体構造にタイムスタンプを付し構造遷移過程の全容を解明する手法の確立
- 2021 - 2024 カリウムチャネルKcsAの脂質内高分解能構造解析によるゲーティング機構の解明
- 2019 - 2021 Development of a method to elucidate the structural transition process by adding a time stamp to the three-dimensional structure of a protein
- 2019 - 2021 熱エネルギーを電気エネルギーに変換する分子機構の動的解明
- 2018 - 2021 Development of a method for simultaneous recordings of single channel dynamics and currents
- 2018 - 2020 X線1分子動態計測による温度依存性イオンチャネル開閉制御機構の動的解明
- 2017 - 2019 in vitro とin cellの蛋白質動態をつなぐX線1分子動態計測法の開発
- 2015 - 2018 Development of a method for simultaneous recordings of single channel dynamics and currents
- 2015 - 2017 in vitro とin cellの蛋白質動態をつなぐX線1分子動態計測法の開発
- 2015 - 2017 Development of SOI detector adopted for recording single molecular dynamics of proteins
- 2013 - 2015 Development of the DXT method by Photolithography
- 2012 - 2015 Development of a method for simultaneous recordings of single channel dynamics and currents
- 2011 - 2014 Single-molecule structure-function analysis of the pH-dependent gating of the KcsA potassium channel
- 2010 - 2011 エックス線1分子計測によるイオンチャネル開閉ダイナミクスの解析
- 2010 - 2011 エックス線1分子計測によるイオンチャネル準安定状態の観測
- 2008 - 2011 Simultaneous recording of conformational changes and ionic currents of single-molecular ion channels reveals the relationship between membrane potentials and motions of the channels.
- 2008 - 2010 Structural and functional dynamics of the KcsA channel : Single molecule measurements of the conformational change during gating.
- 2008 - 2009 エックス線1分子計測によるイオンチャネル開閉ダイナミクスの解析
- 2008 - 2008 エックス線分子生理学:イオンチャネル1分子電流と1分子構造変化の同時計測
- 2005 - 2006 A systematic method of noise analysis for channels with single-channel conductance of fA level
- 2003 - 2004 膜タンパク質二次元結晶の電気的特性とその成長過程の長時間追跡法の開発
- 2001 - 2002 膜蛋白質3次元結晶の電気特性測定法の開発
- 2001 - 2002 Developing an E. coli-expression-function platform for study of 3-D structure-function relationships of channel molecules
- カリウムイオンチャネルの機能・ダイナミクス同時計測
- QT延長症候群に関与する心臓Kチャネルの機能解析
- Functional Analysis of HERG.(human k channel)
- Relationships between dynamics and function of potassium channels in a single molecular level
- Functional Analysis of HERG.(human k channel)
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Papers (43)：
MISC (40)：
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Hirofumi Shimizu, Takuya Kobayashi, Masayuki Iwamoto, Kentaro Kajiwara, Nagomi Kurebayashi, Haruo Ogawa, Takashi Murayama. Single-Molecule Twisting Motions During Gating of the Human TRPV1 Channel Recorded with Sub-Millisecond Time Resolution. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2020. 118. 3. 22A-22A
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Development of Low X-ray Scattering Chamber for Recording Single-Molecule Conformational Changes of Proteins with the Diffracted X-ray Tracking Method. 2017. 34. 1-4
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Hiroyuki Nakao, Keisuke Ikeda, Masayuki Iwamoto, Hirofumi Shimizu, Shigetoshi Oiki, Yasushi Ishihama, Minoru Nakano. PH-dependent promotion of phospholipid flip-flop by the KcsA potassium channel. Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 2015. 1848. 1. 145-150
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H. Shimizu, M. Iwamoto, Y. Oota, Yoshikazu Hirai, Osamu Tabata, S. Oiki. The diffracted X-ray tracking method for recording the single-molecule conformational changes of the KcsA potassium channel in a sub-millisecond time resolution. The 45th Natl Inst Physiol Sci (NIPS) International Symposium. 2014. 22
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中尾裕之, 若林真樹, 池田恵介, 石濱泰, 岩本真幸, 清水啓史, 老木成稔, 中野実. カリウムチャネルKcsAのpH依存的なリン脂質flip-flop誘起能. 日本薬学会年会要旨集(CD-ROM). 2014. 134th. 2. ROMBUNNO.28Q-AM03S-260
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Lectures and oral presentations (88)：
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Microfluidic-based Diffracted X-ray Tracking Method for Real-Time Observation of Ion Channel Twist Motion Under Sequential Chemical Stimuli
(The 22nd International Conference on Solid-State Sensors Actuators and Microsystems (Transducers 2023) 2023)
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pH変化に対するKcsAイオンチャネルの運動応答を解析するためのX線1分子動態計測用流体デバイス
(化学とマイクロ・ナノシステム学会第47回研究会 2023)
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A new gating model of K+ channel based on cryo-EM structures and single-molecule dynamics measurements using X-ray
(The 100th Anniversary Annual Meeting of The Physiological Society of Japan 2023)
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Structural Basis for pH-gating of the K+ channel KcsA
(日本顕微鏡学会シンポジウム 2022)
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KcsA K+channel structure incorporated into nanodisc
(第60回日本生物物理学会 2022)
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Works (10)：
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膜電位存在下におけるイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測, 基盤研究(A)(一般)
2014 -
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半導体ナノ加工技術を利用したX線1分子動態計測法の開発, 挑戦的萌芽研究
2014 -
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KcsAカリウムチャネルpH依存性ゲーティングダイナミクスの一分子構造機能解析, 基盤研究(B)(一般)
2013 -
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エックス線1分子計測によるイオンチャネル開閉ダイナミクスの解析, 特定領域研究(継続領域)
2011 -
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電場と動態:膜電位存在下でのイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測, 若手研究(S)
2011 -
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Education (2)：
- - 2000 The University of Tokyo
- - 2000 The University of Tokyo Graduate School, Division of Science 生物化学
Professional career (1)：
Committee career (4)：
- 2003 - アメリカ生物物理学会 一般会員
- 2001 - 生理学会 一般会員
- 1996 - 生物物理学会 一般会員
- 1996 - 生物物理学会 member
Awards (3)：
- 2012 - 医学系研究奨励対象
- 2010 - 文部科学大臣表彰若手科学者賞
- 2010 - The Young Scientists’ Prize, The Commendation for Science and Technology by the Minister of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Association Membership(s) (4)：
生物物理学会
, 生理学会
, アメリカ生物物理学会
, 生物物理学会
