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J-GLOBAL ID:200901059322608821   Update date: Nov. 18, 2020

Shimizu Hirofumi

シミズ ヒロフミ | Shimizu Hirofumi
Affiliation and department:
Job title: Senior Assistant Professor
Research field  (3): Clinical pharmacy ,  Physiology ,  Biophysics
Research keywords  (4): 生理学 ,  生物物理学 ,  Physiology ,  Biophysics
Research theme for competitive and other funds  (24):
  • 2019 - 2021 蛋白質の立体構造にタイムスタンプを付し構造遷移過程を解明する手法開発
  • 2019 - 2021 熱エネルギーを電気エネルギーに変換する分子機構の動的解明
  • 2018 - 2021 膜電位存在下におけるイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測
  • 2018 - 2020 X線1分子動態計測による温度依存性イオンチャネル開閉制御機構の動的解明
  • 2017 - 2019 in vitro とin cellの蛋白質動態をつなぐX線1分子動態計測法の開発
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Papers (12):
  • Hirofumi Shimizu. Diffracted X-ray tracking method for recording single-molecule protein motions. Biochimica et biophysica acta. General subjects. 2020. 1864. 2. 129361-129361
  • Ikkei Yamauchi, Tomoki Tabuchi, Yoshikazu Hirai, Masayuki Iwamoto, Toshiyuki Tsuchiya, Hirofumi Shimizu, Osamu Tabata. MICROFABRICATED SOLUTION CHAMBER FOR HIGH RESOLUTION DIFFRACTED X-RAY TRACKING METHOD TO OBSERVE ION-CHANNEL GATING MOTION. 2019 20TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON SOLID-STATE SENSORS, ACTUATORS AND MICROSYSTEMS & EUROSENSORS XXXIII (TRANSDUCERS & EUROSENSORS XXXIII). 2019. 25-28
  • Yonekura K, Maki-Yonekura S, Matsuoka R, Yamashita Y, Shimizu H, Tanaka M, Iwabuki F. Correction: Hexameric and pentameric complexes of the ExbBD energizer in the Ton system. eLife. 2018. 7
  • Maki-Yonekura S, Matsuoka R, Yamashita Y, Shimizu H, Tanaka M, Iwabuki F, Yonekura K. Hexameric and pentameric complexes of the ExbBD energizer in the Ton system. eLife. 2018. 7
  • Akira Yamakata, Hirofumi Shimizu, Shigetoshi Oiki. Surface-enhanced IR absorption spectroscopy of the KcsA potassium channel upon application of an electric field. Physical chemistry chemical physics : PCCP. 2015. 17. 33. 21104-11
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MISC (35):
  • Hiroyuki Nakao, Keisuke Ikeda, Masayuki Iwamoto, Hirofumi Shimizu, Shigetoshi Oiki, Yasushi Ishihama, Minoru Nakano. PH-dependent promotion of phospholipid flip-flop by the KcsA potassium channel. Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 2015. 1848. 1. 145-150
  • H. Shimizu, M. Iwamoto, Y. Oota, Yoshikazu Hirai, Osamu Tabata, S. Oiki. The diffracted X-ray tracking method for recording the single-molecule conformational changes of the KcsA potassium channel in a sub-millisecond time resolution. The 45th Natl Inst Physiol Sci (NIPS) International Symposium. 2014. 22
  • 中尾裕之, 若林真樹, 池田恵介, 石濱泰, 岩本真幸, 清水啓史, 老木成稔, 中野実. カリウムチャネルKcsAのpH依存的なリン脂質flip-flop誘起能. 日本薬学会年会要旨集(CD-ROM). 2014. 134th. 2. ROMBUNNO.28Q-AM03S-260
  • 中尾裕之, 若林真樹, 池田恵介, 石濱泰, 岩本真幸, 清水啓史, 老木成稔, 中野実. カリウムチャネルKcsAのリン脂質フリップフロップ誘起能におけるN末ヘリックスの効果. 生体膜と薬物の相互作用シンポジウム講演要旨集. 2013. 35th. 76-77
  • 中尾裕之, 若林真樹, 池田恵介, 石濱泰, 岩本真幸, 清水啓史, 老木成稔, 中野実. リン脂質のフリップフロップに対するカリウムチャネルKcsAのN末ヘリックスの影響. 膜シンポジウム. 2013. 25. 166-167
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Lectures and oral presentations  (83):
  • X線1分子動態計測法の開発
    (第67回中部生理学会)
  • イオンチャネル構造遷移過程のX線1分子動画計測
    (生理研研究会「イオンチャネルと生体膜のダイナミクス:構造生物学の先にあるもの」)
  • Single-Molecule Fluctuations and Conformational Changes of the Human Transient Receptor Potential Vanilloid 1 (TRPV1) Channel Recorded using Diffracted X-ray Tracking
  • Single-Molecule Twisting Motions during Gating of the Human TRPV1 Channel Recorded with Sub-Millisecond Time Resolution.
    (64th Biophysical meeting)
  • X 線1 分子動態計測法を適用する新たなターゲット分子の探索
    (第4回イオンチャネル研究会)
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Works (10):
  • 膜電位存在下におけるイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測, 基盤研究(A)(一般)
    2014 -
  • 半導体ナノ加工技術を利用したX線1分子動態計測法の開発, 挑戦的萌芽研究
    2014 -
  • KcsAカリウムチャネルpH依存性ゲーティングダイナミクスの一分子構造機能解析, 基盤研究(B)(一般)
    2013 -
  • エックス線1分子計測によるイオンチャネル開閉ダイナミクスの解析, 特定領域研究(継続領域)
    2011 -
  • 電場と動態:膜電位存在下でのイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測, 若手研究(S)
    2011 -
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Education (2):
  • - 2000 The University of Tokyo
  • - 2000 The University of Tokyo 生物化学
Professional career (1):
  • 博士(理学) (東京大学)
Committee career (4):
  • 2003 - アメリカ生物物理学会 一般会員
  • 2001 - 生理学会 一般会員
  • 1996 - 生物物理学会 一般会員
  • 1996 - 生物物理学会 member
Awards (3):
  • 2012 - 医学系研究奨励対象
  • 2010 - 文部科学大臣表彰若手科学者賞
  • 2010 - The Young Scientists’ Prize, The Commendation for Science and Technology by the Minister of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Association Membership(s) (4):
生物物理学会 ,  生理学会 ,  アメリカ生物物理学会 ,  生物物理学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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